More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0583 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0583  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 388 aa  795    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.404967  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  70.95 
 
 		 389 aa  568  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  69.92 
 
 		 389 aa  561  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  69.15 
 
 		 389 aa  554  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  59.79 
 
 		 389 aa  491  9.999999999999999e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1274  aspartate aminotransferase  59.64 
 
 		 392 aa  482  1e-135  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.175604  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  58.87 
 
 		 389 aa  480  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  55.04 
 
 		 392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  56.36 
 
 		 387 aa  444  1e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  46.25 
 
 		 390 aa  364  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  45.74 
 
 		 389 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  47.55 
 
 		 388 aa  349  6e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  46.19 
 
 		 397 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  45.05 
 
 		 392 aa  340  2e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  45.8 
 
 		 395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  48.34 
 
 		 395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  47.86 
 
 		 400 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  47.21 
 
 		 397 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  47.7 
 
 		 395 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  47.7 
 
 		 395 aa  334  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  47.7 
 
 		 395 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  43.93 
 
 		 387 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  45.99 
 
 		 388 aa  334  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  47.7 
 
 		 395 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  47.7 
 
 		 395 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  46.97 
 
 		 395 aa  333  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  46.97 
 
 		 395 aa  332  5e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  46.97 
 
 		 395 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  46.97 
 
 		 395 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  45.48 
 
 		 388 aa  332  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  45.22 
 
 		 388 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  47.19 
 
 		 395 aa  331  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  45.2 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  45.82 
 
 		 398 aa  331  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  47.53 
 
 		 400 aa  330  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  46.19 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  46.58 
 
 		 400 aa  331  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  46.97 
 
 		 400 aa  330  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  46.62 
 
 		 399 aa  329  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  45.27 
 
 		 397 aa  329  6e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1589  aminotransferase class I and II  44.47 
 
 		 388 aa  328  7e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.570274  normal  0.997375 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  45.71 
 
 		 400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  45.01 
 
 		 397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  47.59 
 
 		 393 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  47.04 
 
 		 401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  46.75 
 
 		 400 aa  326  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  45.36 
 
 		 400 aa  324  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  46.65 
 
 		 400 aa  324  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  45.62 
 
 		 400 aa  324  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  46.65 
 
 		 400 aa  323  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  44.87 
 
 		 401 aa  322  9.000000000000001e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  45.59 
 
 		 394 aa  321  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  47.45 
 
 		 396 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  44.99 
 
 		 400 aa  321  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  46.39 
 
 		 400 aa  321  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  46.63 
 
 		 400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  44.94 
 
 		 400 aa  320  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  45.96 
 
 		 397 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  46.37 
 
 		 400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  45.88 
 
 		 400 aa  319  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  44.86 
 
 		 400 aa  318  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  44.39 
 
 		 400 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  43.65 
 
 		 397 aa  317  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  44.3 
 
 		 395 aa  317  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  46.02 
 
 		 400 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  46.12 
 
 		 399 aa  317  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  46.13 
 
 		 400 aa  317  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  43.77 
 
 		 401 aa  317  3e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  45.88 
 
 		 400 aa  316  4e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  45.22 
 
 		 392 aa  316  5e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  45.45 
 
 		 400 aa  315  6e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0732  aspartate aminotransferase  43.72 
 
 		 398 aa  315  8e-85  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  44.72 
 
 		 400 aa  315  9e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  44.86 
 
 		 400 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1056  aspartate aminotransferase A  45.62 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  45.02 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  45.14 
 
 		 400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  44.3 
 
 		 397 aa  313  3.9999999999999997e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  42.71 
 
 		 398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  43.15 
 
 		 397 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  44.36 
 
 		 400 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  44.44 
 
 		 400 aa  313  3.9999999999999997e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0172  aminotransferase, class I and II  46.21 
 
 		 403 aa  312  4.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  45.34 
 
 		 400 aa  312  7.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  44.85 
 
 		 400 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  43.97 
 
 		 400 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  43.97 
 
 		 400 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  44.97 
 
 		 401 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  45.36 
 
 		 400 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  43.99 
 
 		 409 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  42.86 
 
 		 390 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_002978  WD1029  aspartate aminotransferase  45.01 
 
 		 397 aa  309  6.999999999999999e-83  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0979  aspartate aminotransferase  46.15 
 
 		 400 aa  308  6.999999999999999e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  43.75 
 
 		 393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  44.36 
 
 		 396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  44.09 
 
 		 390 aa  306  3e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  44.22 
 
 		 423 aa  306  4.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  43.62 
 
 		 396 aa  306  5.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  45.24 
 
 		 393 aa  306  6e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  43.96 
 
 		 394 aa  305  6e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>