More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2089 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2089  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 398 aa  805    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2140  aspartate aminotransferase  68.02 
 
 		 393 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  66.67 
 
 		 394 aa  543  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1103  aspartate aminotransferase  67.09 
 
 		 461 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  62.18 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  58.88 
 
 		 396 aa  484  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277317  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0562  aspartate aminotransferase  55.73 
 
 		 398 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0565  aspartate aminotransferase  55.73 
 
 		 398 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  55.58 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0081  aspartate aminotransferase  48.35 
 
 		 395 aa  394  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0248669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1171  aspartate aminotransferase  48.86 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1148  aspartate aminotransferase  45.31 
 
 		 395 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000148908  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0580  aspartate aminotransferase  43.96 
 
 		 397 aa  363  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  46.39 
 
 		 393 aa  363  4e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  45.76 
 
 		 393 aa  359  5e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  43.6 
 
 		 396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2600  aspartate aminotransferase  43.6 
 
 		 397 aa  349  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00026488  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  43.65 
 
 		 396 aa  349  5e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1046  aspartate aminotransferase  42.78 
 
 		 398 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1313  aspartate aminotransferase  41.86 
 
 		 397 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211162 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1061  aspartate aminotransferase  42.56 
 
 		 398 aa  342  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0613658  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3287  aspartate aminotransferase  41.28 
 
 		 397 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0961  aspartate aminotransferase  40.66 
 
 		 397 aa  331  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.173671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0732  aspartate aminotransferase  40.36 
 
 		 397 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  41.54 
 
 		 395 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  42.53 
 
 		 398 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  39.52 
 
 		 393 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  39.23 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27170  aspartate aminotransferase  39.73 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  39.74 
 
 		 395 aa  267  2.9999999999999995e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0522  aspartate aminotransferase  37.14 
 
 		 396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.138181  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0186  aspartate aminotransferase  38.56 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1558  aminotransferase class I and II  32.35 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1633  aminotransferase class I and II  32.35 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2315  aminotransferase  32.05 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5530  aminotransferase class I and II  31.71 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2832  aminotransferase class I and II  31.7 
 
 		 404 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3157  aminotransferase  30.53 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3525  aminotransferase  26.34 
 
 		 403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  32.04 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  32.44 
 
 		 377 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  32.44 
 
 		 377 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1056  aspartate aminotransferase A  32.8 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  32.17 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  29.18 
 
 		 373 aa  149  7e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  33.07 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  30.81 
 
 		 395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  30.11 
 
 		 379 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  31.03 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  31.22 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  30.81 
 
 		 395 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  30.81 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  30 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  30.81 
 
 		 395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  28.97 
 
 		 412 aa  146  6e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  30.14 
 
 		 381 aa  145  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1731  L-aspartate aminotransferase  30.25 
 
 		 400 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  30.71 
 
 		 393 aa  145  9e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  30.81 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  30.81 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  30.81 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  30.81 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2206  aminotransferase class I and II  29.75 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  30.81 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  29.61 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  28.17 
 
 		 385 aa  145  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  30.23 
 
 		 387 aa  145  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  31.88 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  32.88 
 
 		 392 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  30.43 
 
 		 395 aa  144  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  29.9 
 
 		 402 aa  143  4e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  31.08 
 
 		 400 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  30.11 
 
 		 390 aa  142  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  29.16 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  31.08 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  28.17 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  29.33 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  31.1 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  32.02 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0525  aspartate aminotransferase  29.33 
 
 		 397 aa  140  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  30.37 
 
 		 401 aa  141  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1096  aspartate aminotransferase protein  29.34 
 
 		 403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.420388 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  31.03 
 
 		 388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  30.27 
 
 		 400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  31.03 
 
 		 392 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  30.24 
 
 		 402 aa  139  6e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  29.06 
 
 		 375 aa  139  6e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  30.21 
 
 		 390 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  30.27 
 
 		 414 aa  140  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  31.3 
 
 		 400 aa  140  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  29.29 
 
 		 382 aa  139  7e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  31.03 
 
 		 392 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  31.88 
 
 		 402 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0758  aspartate aminotransferase  31.2 
 
 		 397 aa  139  8.999999999999999e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  30.67 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  30.67 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  31.62 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0421  aspartate aminotransferase  29.3 
 
 		 380 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.248364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 		 404 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  31.94 
 
 		 404 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>