More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2093 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  100 
 
 
393 aa  805    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0580  aspartate aminotransferase  58.73 
 
 
397 aa  499  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  58.78 
 
 
393 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1313  aspartate aminotransferase  55.64 
 
 
397 aa  461  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1148  aspartate aminotransferase  54.2 
 
 
395 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000148908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  54.2 
 
 
396 aa  451  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1061  aspartate aminotransferase  53.08 
 
 
398 aa  435  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0613658  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  51.54 
 
 
396 aa  435  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2600  aspartate aminotransferase  54.1 
 
 
397 aa  435  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00026488  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1046  aspartate aminotransferase  53.59 
 
 
398 aa  435  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3287  aspartate aminotransferase  52.82 
 
 
397 aa  425  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0961  aspartate aminotransferase  52.82 
 
 
397 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.173671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0732  aspartate aminotransferase  51.03 
 
 
397 aa  418  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  49.36 
 
 
398 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1171  aspartate aminotransferase  47 
 
 
396 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  49.74 
 
 
395 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0081  aspartate aminotransferase  46.94 
 
 
395 aa  383  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0248669  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  46.91 
 
 
396 aa  378  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277317  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  46.58 
 
 
397 aa  360  3e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2089  aspartate aminotransferase  45.76 
 
 
398 aa  359  5e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  46.37 
 
 
394 aa  358  6e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2140  aspartate aminotransferase  45.34 
 
 
393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0565  aspartate aminotransferase  44.81 
 
 
398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0562  aspartate aminotransferase  44.3 
 
 
398 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1103  aspartate aminotransferase  44.73 
 
 
461 aa  332  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  45.29 
 
 
400 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  41.84 
 
 
395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0522  aspartate aminotransferase  39.19 
 
 
396 aa  295  1e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.138181  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  38.95 
 
 
393 aa  290  3e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27170  aspartate aminotransferase  36.8 
 
 
393 aa  283  5.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0186  aspartate aminotransferase  39.74 
 
 
393 aa  276  5e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140573  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  38.56 
 
 
394 aa  275  9e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3157  aminotransferase  32.96 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  34.4 
 
 
389 aa  196  6e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  34.07 
 
 
375 aa  194  3e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  34.46 
 
 
389 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1274  aspartate aminotransferase  33.96 
 
 
392 aa  189  7e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.175604  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  33.33 
 
 
370 aa  187  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3525  aminotransferase  30.38 
 
 
403 aa  186  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  31.06 
 
 
385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  32.55 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2832  aminotransferase class I and II  31.2 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642914 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  32.27 
 
 
375 aa  183  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5530  aminotransferase class I and II  30.56 
 
 
397 aa  182  8.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  31.47 
 
 
375 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  30.93 
 
 
375 aa  179  9e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  31.93 
 
 
377 aa  176  6e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  31.93 
 
 
377 aa  176  6e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  30.45 
 
 
404 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  31.18 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  31.54 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  31.54 
 
 
396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  31.94 
 
 
397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  31.47 
 
 
375 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  29.61 
 
 
400 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  32.88 
 
 
379 aa  173  5e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  34.52 
 
 
392 aa  172  7.999999999999999e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  34.7 
 
 
396 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  31.77 
 
 
388 aa  172  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3530  aminotransferase class I and II  31.23 
 
 
373 aa  171  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.903245  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1731  L-aspartate aminotransferase  30.39 
 
 
400 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  30.77 
 
 
393 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  31.04 
 
 
387 aa  170  5e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  31.17 
 
 
380 aa  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2206  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 
400 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  32.26 
 
 
367 aa  169  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3724  aminotransferase class I and II  32.68 
 
 
404 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  33.07 
 
 
402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3133  aminotransferase  30.65 
 
 
370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.475875 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  32.12 
 
 
396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  32.18 
 
 
398 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  30.27 
 
 
389 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0994  aminotransferase  31.28 
 
 
369 aa  166  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.462278 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  31.22 
 
 
388 aa  166  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  30.77 
 
 
399 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  30 
 
 
379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  31.45 
 
 
373 aa  163  6e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  31.27 
 
 
390 aa  163  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  29.32 
 
 
397 aa  162  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  31.68 
 
 
392 aa  162  8.000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  31.12 
 
 
402 aa  162  9e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2987  aminotransferase class I and II  31.22 
 
 
393 aa  161  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  30.77 
 
 
397 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  30.85 
 
 
383 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  31.5 
 
 
389 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  31.08 
 
 
395 aa  160  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1029  aspartate aminotransferase  31.39 
 
 
397 aa  159  7e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  29.27 
 
 
395 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  29.27 
 
 
395 aa  159  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  31.2 
 
 
393 aa  159  9e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  30 
 
 
392 aa  159  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0746  aminotransferase class I and II  31.32 
 
 
387 aa  158  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000316977  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  31 
 
 
389 aa  158  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  31 
 
 
402 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  28.73 
 
 
395 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  29 
 
 
395 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  31.84 
 
 
386 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1506  aminotransferase, class I and II  29.82 
 
 
368 aa  158  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  28.46 
 
 
395 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  28.46 
 
 
395 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>