More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3157 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3157  aminotransferase  100 
 
 
405 aa  825    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2832  aminotransferase class I and II  70.13 
 
 
404 aa  557  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5530  aminotransferase class I and II  53.78 
 
 
397 aa  389  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1558  aminotransferase class I and II  49.86 
 
 
389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1633  aminotransferase class I and II  49.32 
 
 
389 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2315  aminotransferase  48.77 
 
 
389 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3525  aminotransferase  43.53 
 
 
403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0961  aspartate aminotransferase  36.02 
 
 
397 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.173671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3287  aspartate aminotransferase  36.39 
 
 
397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1148  aspartate aminotransferase  36.67 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000148908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0732  aspartate aminotransferase  37.74 
 
 
397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1061  aspartate aminotransferase  36.57 
 
 
398 aa  232  9e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0613658  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  35.61 
 
 
396 aa  226  7e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2600  aspartate aminotransferase  37.29 
 
 
397 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00026488  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1046  aspartate aminotransferase  36.36 
 
 
398 aa  223  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  35.81 
 
 
396 aa  219  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  33.15 
 
 
395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  36.21 
 
 
394 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1171  aspartate aminotransferase  36.89 
 
 
396 aa  211  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1103  aspartate aminotransferase  34.96 
 
 
461 aa  209  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1313  aspartate aminotransferase  34.63 
 
 
397 aa  209  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211162 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0081  aspartate aminotransferase  35.21 
 
 
395 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0248669  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2140  aspartate aminotransferase  36.69 
 
 
393 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  33.51 
 
 
395 aa  202  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  32.96 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0522  aspartate aminotransferase  32.39 
 
 
396 aa  201  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.138181  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0565  aspartate aminotransferase  35.93 
 
 
398 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0562  aspartate aminotransferase  35.05 
 
 
398 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  34.81 
 
 
397 aa  193  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27170  aspartate aminotransferase  32.25 
 
 
393 aa  192  9e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0580  aspartate aminotransferase  31.74 
 
 
397 aa  192  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  32.25 
 
 
396 aa  189  8e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277317  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0186  aspartate aminotransferase  32.95 
 
 
393 aa  187  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140573  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  30.17 
 
 
398 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  31.88 
 
 
394 aa  186  8e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  30.59 
 
 
393 aa  181  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  33.99 
 
 
400 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2089  aspartate aminotransferase  30.53 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  30.42 
 
 
393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  31.67 
 
 
367 aa  145  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  31.33 
 
 
409 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  28.78 
 
 
389 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  30.36 
 
 
379 aa  135  9e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3295  putative aminotransferase  32.58 
 
 
384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  30.84 
 
 
383 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  28.38 
 
 
394 aa  133  5e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0157  putative aminotransferase  32.59 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4026  putative aminotransferase  32.59 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3953  putative aminotransferase  32.59 
 
 
384 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880555  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  25.76 
 
 
375 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  28.96 
 
 
370 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3032  putative aminotransferase  32.22 
 
 
384 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2971  putative aminotransferase  32.22 
 
 
384 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1570  putative aminotransferase  32.22 
 
 
384 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3339  putative aminotransferase  32.22 
 
 
384 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  30.85 
 
 
396 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  31.08 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  27.09 
 
 
390 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1450  putative aminotransferase  29.91 
 
 
391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  29.23 
 
 
394 aa  127  5e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  28.05 
 
 
385 aa  127  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  27.93 
 
 
395 aa  126  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  27.61 
 
 
392 aa  126  8.000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  31.51 
 
 
377 aa  126  9e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  31.51 
 
 
377 aa  126  9e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  31.99 
 
 
393 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  28.53 
 
 
379 aa  125  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2490  putative aminotransferase  27.94 
 
 
391 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.228647  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  29.49 
 
 
379 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0421  aspartate aminotransferase  29.77 
 
 
380 aa  124  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.248364  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  32.37 
 
 
396 aa  124  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0014  putative aminotransferase  27.32 
 
 
384 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1187  aminotransferase class I and II  29.74 
 
 
402 aa  124  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  28.95 
 
 
379 aa  123  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  27.03 
 
 
388 aa  123  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  26.9 
 
 
373 aa  123  7e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3530  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.903245  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  27.65 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  29.34 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1096  aspartate aminotransferase protein  29.26 
 
 
403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.420388 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2478  aspartate aminotransferase  26.99 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0583  aspartate aminotransferase  29.37 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.404967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1014  aminotransferase  30.77 
 
 
402 aa  121  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0746  aminotransferase class I and II  30.92 
 
 
387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000316977  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2698  putative aminotransferase  33.33 
 
 
382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1200  aminotransferase  27.73 
 
 
393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.241319  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  32.07 
 
 
386 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  27.14 
 
 
389 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  28.42 
 
 
399 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  28.31 
 
 
390 aa  119  7.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0744  aminotransferase  29.38 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0285306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  26.59 
 
 
389 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  26.96 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  25.79 
 
 
388 aa  119  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  30.41 
 
 
382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  31.71 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  31.71 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4435  putative aminotransferase  31.88 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  30 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1506  aminotransferase, class I and II  28.25 
 
 
368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>