More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0732 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1061  aspartate aminotransferase  84.63 
 
 		 398 aa  718    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0613658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0732  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 397 aa  818    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0961  aspartate aminotransferase  77.08 
 
 		 397 aa  649    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.173671 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  75.76 
 
 		 396 aa  641    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3287  aspartate aminotransferase  76.57 
 
 		 397 aa  645    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1046  aspartate aminotransferase  77.22 
 
 		 398 aa  629  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2600  aspartate aminotransferase  75.19 
 
 		 397 aa  623  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00026488  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  64.81 
 
 		 396 aa  560  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1313  aspartate aminotransferase  63.13 
 
 		 397 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1148  aspartate aminotransferase  63.04 
 
 		 395 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000148908  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0580  aspartate aminotransferase  53.55 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0081  aspartate aminotransferase  52.9 
 
 		 395 aa  430  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0248669  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  51.03 
 
 		 393 aa  422  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1171  aspartate aminotransferase  51.8 
 
 		 396 aa  424  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  50.51 
 
 		 393 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  47.18 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  44.42 
 
 		 395 aa  360  3e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  43 
 
 		 398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  44.97 
 
 		 396 aa  353  4e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277317  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  44.62 
 
 		 394 aa  351  2e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1103  aspartate aminotransferase  44.88 
 
 		 461 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2140  aspartate aminotransferase  43.15 
 
 		 393 aa  341  1e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2089  aspartate aminotransferase  40.36 
 
 		 398 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0565  aspartate aminotransferase  42.89 
 
 		 398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0562  aspartate aminotransferase  42.6 
 
 		 398 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  43.16 
 
 		 400 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  39.69 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0522  aspartate aminotransferase  37.99 
 
 		 396 aa  279  5e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.138181  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  37.89 
 
 		 394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27170  aspartate aminotransferase  36.27 
 
 		 393 aa  267  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  34.93 
 
 		 393 aa  259  6e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0186  aspartate aminotransferase  38.76 
 
 		 393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3157  aminotransferase  37.74 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2832  aminotransferase class I and II  35.61 
 
 		 404 aa  232  7.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5530  aminotransferase class I and II  36.12 
 
 		 397 aa  212  7.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3525  aminotransferase  30.89 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2315  aminotransferase  33.15 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1558  aminotransferase class I and II  32.34 
 
 		 389 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1633  aminotransferase class I and II  32.34 
 
 		 389 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  32.01 
 
 		 407 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  31.86 
 
 		 402 aa  163  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  29.38 
 
 		 375 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  29.47 
 
 		 375 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  31.62 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  29.85 
 
 		 367 aa  160  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  29.9 
 
 		 375 aa  159  7e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  29.78 
 
 		 375 aa  159  8e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  29.87 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  33.06 
 
 		 396 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  31.15 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  30.79 
 
 		 389 aa  153  5e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  29.48 
 
 		 389 aa  152  8e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  28.97 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  29.77 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  28.61 
 
 		 393 aa  150  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  29.23 
 
 		 389 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1506  aminotransferase, class I and II  29.13 
 
 		 368 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  29.52 
 
 		 396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  28.34 
 
 		 395 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  28.88 
 
 		 395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  28.88 
 
 		 395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  28.88 
 
 		 395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  29.22 
 
 		 388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  28.65 
 
 		 379 aa  148  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  28.88 
 
 		 395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  28.88 
 
 		 395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  28.61 
 
 		 395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  28.61 
 
 		 395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  29.66 
 
 		 370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  28.34 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  30.77 
 
 		 377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  30.77 
 
 		 377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  29 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0994  aminotransferase  29.49 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.462278 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  29.04 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  28.93 
 
 		 387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  29.26 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  29.04 
 
 		 396 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  29.04 
 
 		 396 aa  146  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  29.04 
 
 		 396 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  28.38 
 
 		 388 aa  146  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  29.04 
 
 		 396 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0784  aminotransferase  31.32 
 
 		 403 aa  146  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0364994 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  29.44 
 
 		 396 aa  146  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  29.79 
 
 		 390 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  29.16 
 
 		 396 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  26.82 
 
 		 382 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  27.9 
 
 		 379 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  30.11 
 
 		 398 aa  146  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0177  alanine aminotransferase  29.17 
 
 		 391 aa  146  8.000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.127101 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  29.04 
 
 		 396 aa  145  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  28.43 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6257  aminotransferase class I and II  27.72 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  30.23 
 
 		 385 aa  145  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  29.01 
 
 		 413 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  28.64 
 
 		 392 aa  144  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  28.77 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  31.45 
 
 		 396 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  30 
 
 		 393 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1838  aromatic amino acid aminotransferase  29.68 
 
 		 397 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>