More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1502 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1502  aminotransferase class I and II  100 
 
 
388 aa  806    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000290558  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1729  aminotransferase  68.31 
 
 
385 aa  552  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118879  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0798  aspartate aminotransferase  66.32 
 
 
387 aa  536  1e-151  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1558  aminotransferase class I and II  61.92 
 
 
386 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0317788  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1353  aspartate aminotransferase  63.21 
 
 
385 aa  478  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2793  aminotransferase  53.72 
 
 
386 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  39.79 
 
 
393 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  42.63 
 
 
379 aa  282  7.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  41.11 
 
 
397 aa  271  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  39.84 
 
 
400 aa  268  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  40.33 
 
 
397 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  39.63 
 
 
390 aa  265  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  37.87 
 
 
383 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3813  aminotransferase  41.25 
 
 
405 aa  260  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  41.28 
 
 
421 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  37.26 
 
 
387 aa  256  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  39.79 
 
 
394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1235  aminotransferase class I and II  37.01 
 
 
393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  38.15 
 
 
394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  35.53 
 
 
397 aa  245  8e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  38.98 
 
 
395 aa  245  9e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  38.52 
 
 
388 aa  244  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  35.37 
 
 
385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  39.55 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  38.4 
 
 
394 aa  244  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  36.83 
 
 
388 aa  242  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1450  putative aminotransferase  35.57 
 
 
391 aa  241  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  37.87 
 
 
394 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.27 
 
 
387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  36.41 
 
 
392 aa  239  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  37.16 
 
 
384 aa  239  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1969  putative aminotransferase  34.08 
 
 
389 aa  239  5e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  36.51 
 
 
384 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  38.33 
 
 
382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  36.24 
 
 
391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  36.24 
 
 
384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0109  putative aminotransferase  35.57 
 
 
384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  36.24 
 
 
391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  36.24 
 
 
391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  36.24 
 
 
391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  36.24 
 
 
391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  37.2 
 
 
391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  35.93 
 
 
384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  35.87 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  38.48 
 
 
387 aa  233  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  35.75 
 
 
387 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  35.54 
 
 
390 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0778  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 
380 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  36.06 
 
 
383 aa  233  6e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  36.49 
 
 
409 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0627  aminotransferase class I and II  38.32 
 
 
369 aa  232  8.000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0119  putative aminotransferase  35.29 
 
 
384 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  35.11 
 
 
385 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3299  putative aminotransferase  34.73 
 
 
384 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0118  putative aminotransferase  35.85 
 
 
384 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2936  putative aminotransferase  35.01 
 
 
384 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0119  putative aminotransferase  35.01 
 
 
384 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.234511  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  37.89 
 
 
393 aa  230  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  36.24 
 
 
391 aa  229  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  36.83 
 
 
386 aa  229  5e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0133  putative aminotransferase  35.01 
 
 
384 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  36.64 
 
 
395 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  35.65 
 
 
384 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  38.2 
 
 
413 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  35.1 
 
 
384 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  37.63 
 
 
395 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  33.69 
 
 
390 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  33.42 
 
 
396 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3334  putative aminotransferase  36.14 
 
 
385 aa  226  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.946068  hitchhiker  0.000376908 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0014  putative aminotransferase  32.21 
 
 
384 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  33.69 
 
 
390 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  33.69 
 
 
390 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4804  aminotransferase class I and II  31.71 
 
 
413 aa  226  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.607245 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  38.04 
 
 
391 aa  226  6e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  33.16 
 
 
390 aa  226  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  33.69 
 
 
390 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2490  putative aminotransferase  32.02 
 
 
391 aa  225  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.228647  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  34.22 
 
 
390 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0031  putative aminotransferase  32.87 
 
 
384 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4435  putative aminotransferase  33.15 
 
 
384 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  37.57 
 
 
381 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  34.79 
 
 
388 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  34.65 
 
 
384 aa  223  6e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1783  aminotransferase class I and II  36.6 
 
 
390 aa  222  9e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  35.68 
 
 
394 aa  222  9e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  33.16 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  34.22 
 
 
399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3442  aminotransferase  34.95 
 
 
393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  33.88 
 
 
386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  33.16 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  34.73 
 
 
398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  36.76 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  36.22 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  33.16 
 
 
389 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  37.8 
 
 
401 aa  220  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3291  putative aminotransferase  35.25 
 
 
385 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.205581  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  32.97 
 
 
386 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  32.97 
 
 
386 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  34.77 
 
 
391 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2072  aminotransferase class I and II  30.33 
 
 
381 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.235336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>