More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0031 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1369  putative aminotransferase  78.39 
 
 
384 aa  638    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3299  putative aminotransferase  83.07 
 
 
384 aa  658    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0133  putative aminotransferase  83.07 
 
 
384 aa  658    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0031  putative aminotransferase  100 
 
 
384 aa  787    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4435  putative aminotransferase  95.57 
 
 
384 aa  754    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0014  putative aminotransferase  87.5 
 
 
384 aa  700    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0118  putative aminotransferase  84.9 
 
 
384 aa  665    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2936  putative aminotransferase  83.33 
 
 
384 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0109  putative aminotransferase  82.55 
 
 
384 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0119  putative aminotransferase  83.59 
 
 
384 aa  662    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.234511  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0119  putative aminotransferase  82.55 
 
 
384 aa  653    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3295  putative aminotransferase  77.86 
 
 
384 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2971  putative aminotransferase  77.6 
 
 
384 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3953  putative aminotransferase  77.6 
 
 
384 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0157  putative aminotransferase  77.86 
 
 
384 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3032  putative aminotransferase  77.6 
 
 
384 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4026  putative aminotransferase  77.86 
 
 
384 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1570  putative aminotransferase  77.6 
 
 
384 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3339  putative aminotransferase  77.6 
 
 
384 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1450  putative aminotransferase  69.27 
 
 
391 aa  558  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2490  putative aminotransferase  68.49 
 
 
391 aa  555  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.228647  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1969  putative aminotransferase  68.49 
 
 
389 aa  556  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  53.42 
 
 
390 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  53.46 
 
 
390 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  52.93 
 
 
390 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  53.19 
 
 
390 aa  424  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  53.46 
 
 
390 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3291  putative aminotransferase  56.57 
 
 
385 aa  422  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.205581  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  52.93 
 
 
389 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  52.66 
 
 
390 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  52.66 
 
 
390 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  52.6 
 
 
390 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3182  putative aminotransferase  51.86 
 
 
390 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429076  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  52.66 
 
 
390 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  51.82 
 
 
391 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  51.56 
 
 
384 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  51.82 
 
 
384 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1373  putative aminotransferase  51.33 
 
 
390 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  51.82 
 
 
391 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  51.82 
 
 
391 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  51.82 
 
 
391 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  51.82 
 
 
391 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  51.06 
 
 
396 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  51.06 
 
 
390 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0778  aminotransferase class I and II  48.94 
 
 
380 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2072  aminotransferase class I and II  47.75 
 
 
381 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  52.13 
 
 
383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  51.86 
 
 
383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  51.86 
 
 
400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  51.06 
 
 
399 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3334  putative aminotransferase  49.35 
 
 
385 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.946068  hitchhiker  0.000376908 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  50.53 
 
 
390 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  50.27 
 
 
388 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  52.79 
 
 
391 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  52.24 
 
 
394 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  52.39 
 
 
389 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4927  putative aminotransferase  50.89 
 
 
393 aa  396  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4804  aminotransferase class I and II  47.13 
 
 
413 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.607245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2403  putative aminotransferase  49.35 
 
 
391 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.121886  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  49.6 
 
 
386 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2600  aminotransferase class I and II  52.51 
 
 
396 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.492563 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  49.47 
 
 
386 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  49.35 
 
 
385 aa  375  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  49.47 
 
 
386 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0694  2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  45.09 
 
 
396 aa  375  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.519768  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0752  aminotransferase, class I and II  46.13 
 
 
399 aa  375  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0621  putative aminotransferase  49.47 
 
 
386 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  48.94 
 
 
386 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0941  putative aminotransferase  48.83 
 
 
386 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.922283  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  48.94 
 
 
386 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  49.21 
 
 
386 aa  373  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0700  putative aminotransferase  48.94 
 
 
386 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330763  normal  0.0611004 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  48.94 
 
 
386 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0761  putative aminotransferase  48.94 
 
 
386 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405415  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  48.68 
 
 
386 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0715  putative aminotransferase  48.94 
 
 
386 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0642  putative aminotransferase  48.68 
 
 
389 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2834  aminotransferase class I and II  50.53 
 
 
386 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0656  putative aminotransferase  48.94 
 
 
389 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1144  putative aminotransferase  49.2 
 
 
386 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  49.34 
 
 
385 aa  368  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1317  putative aminotransferase  47.89 
 
 
382 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0858  putative aminotransferase  47.37 
 
 
382 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0888  putative aminotransferase  47.37 
 
 
382 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.533677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0901  putative aminotransferase  46.84 
 
 
382 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  46.44 
 
 
382 aa  361  9e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  47.37 
 
 
382 aa  362  9e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  48.28 
 
 
386 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  48.28 
 
 
386 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4320  putative aminotransferase  46.32 
 
 
382 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  46.17 
 
 
382 aa  358  7e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2698  putative aminotransferase  46.3 
 
 
382 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0852  aminotransferase class I and II  43.9 
 
 
384 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3332  putative aminotransferase  47.75 
 
 
386 aa  355  7.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.816568 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0884  putative aminotransferase  47.53 
 
 
385 aa  355  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  46.17 
 
 
382 aa  353  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0220  aminotransferase class I and II  47.41 
 
 
385 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  45.71 
 
 
385 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04720  putative aminotransferase  44.56 
 
 
381 aa  352  4e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291343  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  45.79 
 
 
382 aa  352  8.999999999999999e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>