More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1558 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1558  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 386 aa  795    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0317788  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0798  aspartate aminotransferase  69.35 
 
 		 387 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1729  aminotransferase  69.87 
 
 		 385 aa  566  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118879  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1353  aspartate aminotransferase  67.53 
 
 		 385 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1502  aminotransferase class I and II  61.92 
 
 		 388 aa  494  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000290558  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2793  aminotransferase  52.67 
 
 		 386 aa  412  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  42.4 
 
 		 397 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  41.82 
 
 		 390 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  40.05 
 
 		 393 aa  280  3e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  39.74 
 
 		 379 aa  280  4e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  40.64 
 
 		 400 aa  276  6e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  38.67 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1235  aminotransferase class I and II  38.22 
 
 		 393 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  39.57 
 
 		 386 aa  262  8e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3813  aminotransferase  39.73 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  37.31 
 
 		 397 aa  253  6e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  39.06 
 
 		 421 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  36.89 
 
 		 389 aa  247  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  36.26 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  38.04 
 
 		 394 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  39.02 
 
 		 382 aa  243  6e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0627  aminotransferase class I and II  38.32 
 
 		 369 aa  242  7e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  36.95 
 
 		 402 aa  242  7e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  38.64 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  37.77 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  35.66 
 
 		 394 aa  236  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  37.93 
 
 		 387 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  38.03 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  35.12 
 
 		 394 aa  234  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  34.15 
 
 		 383 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  36.39 
 
 		 397 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  34.25 
 
 		 384 aa  230  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1783  aminotransferase class I and II  38.32 
 
 		 390 aa  229  4e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  37.94 
 
 		 387 aa  229  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  36.24 
 
 		 390 aa  229  8e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1450  putative aminotransferase  35.9 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  36.36 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  36.24 
 
 		 382 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  38.03 
 
 		 413 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  35.5 
 
 		 387 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  37.13 
 
 		 405 aa  227  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  34.17 
 
 		 409 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1969  putative aminotransferase  34.52 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  34.23 
 
 		 394 aa  226  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  33.79 
 
 		 385 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  31.52 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  36.36 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  36.51 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  33.94 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  35.97 
 
 		 391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  34.88 
 
 		 382 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0778  aminotransferase class I and II  31.42 
 
 		 380 aa  223  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  35.14 
 
 		 384 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  35.14 
 
 		 384 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2490  putative aminotransferase  35.01 
 
 		 391 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.228647  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  35.42 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  35.94 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  34.5 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  35.29 
 
 		 391 aa  220  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  36.56 
 
 		 388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  34.44 
 
 		 396 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  37.15 
 
 		 389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  35.04 
 
 		 387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  34.79 
 
 		 390 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  35.97 
 
 		 382 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  34.52 
 
 		 391 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  34.52 
 
 		 391 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  34.52 
 
 		 391 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  34.72 
 
 		 396 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  34.72 
 
 		 396 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  34.72 
 
 		 396 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  34.72 
 
 		 396 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  34.52 
 
 		 391 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  34.52 
 
 		 391 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  34.44 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  34.52 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  34.52 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  34.51 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  34.44 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  35.22 
 
 		 391 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  36.14 
 
 		 393 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  34.72 
 
 		 396 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  36.09 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  37.63 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  33.42 
 
 		 390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  36.59 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  36.36 
 
 		 389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  34.44 
 
 		 396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  36.36 
 
 		 389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  33.7 
 
 		 398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  34.17 
 
 		 396 aa  216  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  33.79 
 
 		 382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  34.17 
 
 		 396 aa  216  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  34.88 
 
 		 394 aa  215  9e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  36.46 
 
 		 413 aa  215  9e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  34.6 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  35.89 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  33.42 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  33.42 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  33.42 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>