More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0348 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  100 
 
 		 392 aa  794    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  68.88 
 
 		 393 aa  556  1e-157  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0018  transaminase  66.67 
 
 		 394 aa  543  1e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  60.26 
 
 		 390 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  59.49 
 
 		 392 aa  489  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  61.99 
 
 		 395 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  60.26 
 
 		 396 aa  488  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  59.9 
 
 		 406 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  59.64 
 
 		 392 aa  491  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  59.38 
 
 		 392 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  59.38 
 
 		 392 aa  487  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  59.13 
 
 		 392 aa  485  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  59.38 
 
 		 392 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  59.38 
 
 		 392 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  58.72 
 
 		 392 aa  482  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  59.13 
 
 		 392 aa  484  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  53.35 
 
 		 391 aa  422  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  44.42 
 
 		 392 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  44.42 
 
 		 391 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  44.33 
 
 		 389 aa  351  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  44.64 
 
 		 388 aa  346  4e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  44.13 
 
 		 382 aa  340  2e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  45.27 
 
 		 387 aa  338  9e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  44.16 
 
 		 385 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  45.71 
 
 		 392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  45.62 
 
 		 390 aa  334  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  43.19 
 
 		 391 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  45.24 
 
 		 388 aa  330  3e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  43.9 
 
 		 401 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  41.99 
 
 		 388 aa  324  1e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  41.67 
 
 		 382 aa  324  1e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  42.08 
 
 		 384 aa  325  1e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  43.54 
 
 		 403 aa  323  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  41.13 
 
 		 390 aa  323  5e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  42.93 
 
 		 388 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  41.95 
 
 		 400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  41.47 
 
 		 388 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  41.36 
 
 		 385 aa  320  3e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  41.45 
 
 		 392 aa  319  3.9999999999999996e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  43.27 
 
 		 402 aa  319  5e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  41.56 
 
 		 382 aa  318  7.999999999999999e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  42.97 
 
 		 389 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  41.56 
 
 		 394 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  41.56 
 
 		 382 aa  316  4e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  41.3 
 
 		 394 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  42.52 
 
 		 390 aa  315  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.84 
 
 		 391 aa  312  5.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  40.87 
 
 		 394 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  40.94 
 
 		 389 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  42.71 
 
 		 387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  42.41 
 
 		 388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  39.48 
 
 		 386 aa  301  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  38.93 
 
 		 399 aa  300  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2505  aminotransferase  39.79 
 
 		 407 aa  299  7e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784571  normal  0.124527 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  40.67 
 
 		 388 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  38.17 
 
 		 400 aa  296  4e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  38.27 
 
 		 399 aa  295  9e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246294 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  36.99 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  38.27 
 
 		 400 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  37.5 
 
 		 399 aa  293  5e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2899  aspartate aminotransferase  38.27 
 
 		 399 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  38.68 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  37.08 
 
 		 397 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  37.22 
 
 		 400 aa  290  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  37.5 
 
 		 399 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  39.48 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  37.15 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  36.5 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0159  succinyldiaminopimelate transaminase  38.42 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.899498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  37.24 
 
 		 394 aa  286  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  36.62 
 
 		 399 aa  285  8e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  39.58 
 
 		 389 aa  285  9e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0911  class I/II aminotransferase  40.15 
 
 		 400 aa  285  9e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.638659  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1923  aminotransferase  38.05 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351936  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  41.41 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  39.84 
 
 		 384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  38.56 
 
 		 397 aa  282  8.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1299  aminotransferase  37.92 
 
 		 403 aa  282  9e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  37.69 
 
 		 393 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  37.69 
 
 		 393 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  36.81 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  40.16 
 
 		 406 aa  280  3e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  40.16 
 
 		 406 aa  280  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  38.05 
 
 		 397 aa  279  6e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  36.41 
 
 		 421 aa  279  8e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2582  aminotransferase, class I and II  40.78 
 
 		 384 aa  278  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3869  succinyldiaminopimelate transaminase  39.11 
 
 		 392 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2636  aminotransferase class I and II  40.78 
 
 		 384 aa  278  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1916  aminotransferase  39.89 
 
 		 407 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1794  succinyldiaminopimelate transaminase  38.14 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.455812  decreased coverage  0.0036927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  37.82 
 
 		 403 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  38.38 
 
 		 411 aa  276  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  37.5 
 
 		 409 aa  276  6e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  35.48 
 
 		 390 aa  275  8e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  37.82 
 
 		 411 aa  275  9e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  37.56 
 
 		 411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1334  aminotransferase  37.56 
 
 		 411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  37.56 
 
 		 411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  38.08 
 
 		 412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  38.08 
 
 		 412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>