More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_646 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  92.21 
 
 		 388 aa  747    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  91.24 
 
 		 388 aa  745    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  100 
 
 		 390 aa  805    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.86 
 
 		 392 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  54.09 
 
 		 384 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.86 
 
 		 390 aa  440  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.68 
 
 		 391 aa  440  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.28 
 
 		 389 aa  436  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  53.44 
 
 		 382 aa  437  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  52.11 
 
 		 382 aa  428  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  56.07 
 
 		 392 aa  429  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  51.32 
 
 		 388 aa  429  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  50.39 
 
 		 382 aa  426  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  50.65 
 
 		 382 aa  422  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.7 
 
 		 390 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.18 
 
 		 388 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  48.94 
 
 		 385 aa  412  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  50 
 
 		 385 aa  410  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  50 
 
 		 401 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  50 
 
 		 389 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.49 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  48.83 
 
 		 388 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  49.62 
 
 		 389 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  50.26 
 
 		 384 aa  390  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  47.26 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  47.14 
 
 		 386 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  48.7 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  44.71 
 
 		 403 aa  362  6e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  43.39 
 
 		 392 aa  358  6e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  43.92 
 
 		 402 aa  358  9.999999999999999e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  43.92 
 
 		 400 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  43.27 
 
 		 390 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  43.68 
 
 		 390 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  42.97 
 
 		 393 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  42.48 
 
 		 395 aa  355  5.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  42.52 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  43.12 
 
 		 393 aa  350  2e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  43.49 
 
 		 409 aa  351  2e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  42.86 
 
 		 392 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  42.26 
 
 		 391 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  42.41 
 
 		 394 aa  345  8e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  42.64 
 
 		 388 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  41.98 
 
 		 397 aa  345  1e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  42.15 
 
 		 394 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1252  aminotransferase  43.5 
 
 		 396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000164192  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  42.86 
 
 		 399 aa  342  5e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  44.39 
 
 		 392 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  44.18 
 
 		 389 aa  342  8e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  44.01 
 
 		 406 aa  341  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  41.41 
 
 		 394 aa  341  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  44.39 
 
 		 392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  44.39 
 
 		 392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  44.39 
 
 		 392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  44.39 
 
 		 392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  43.32 
 
 		 425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  40.1 
 
 		 391 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  44.18 
 
 		 392 aa  338  7e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  44.13 
 
 		 392 aa  338  9e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  43.56 
 
 		 395 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  43.24 
 
 		 393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  43.38 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  43.24 
 
 		 393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  41.54 
 
 		 394 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  43.65 
 
 		 392 aa  334  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1823  aminotransferase  44.41 
 
 		 407 aa  333  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  44.01 
 
 		 392 aa  332  5e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  40.62 
 
 		 411 aa  332  7.000000000000001e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3016  aminotransferase  41.97 
 
 		 406 aa  332  8e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562115  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  40.31 
 
 		 421 aa  330  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  41.97 
 
 		 397 aa  330  3e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  42.08 
 
 		 400 aa  330  3e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  42.18 
 
 		 403 aa  330  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1299  aminotransferase  40.84 
 
 		 403 aa  330  3e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  40.62 
 
 		 412 aa  329  7e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0598  aminotransferase  41.13 
 
 		 394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0159  succinyldiaminopimelate transaminase  40.94 
 
 		 407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.899498  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  41.45 
 
 		 397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4268  aminotransferase  42.34 
 
 		 418 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  40.36 
 
 		 412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  40.36 
 
 		 412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  40.36 
 
 		 412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1923  aminotransferase  40.31 
 
 		 405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351936  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  40.36 
 
 		 412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  40.36 
 
 		 412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1544  aminotransferase  41.34 
 
 		 405 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553471  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  40.36 
 
 		 412 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  40.36 
 
 		 412 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1447  aminotransferase class I and II  39.8 
 
 		 398 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000395976  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  40.36 
 
 		 412 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  40.36 
 
 		 412 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  40.36 
 
 		 412 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  40.36 
 
 		 412 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  40.96 
 
 		 412 aa  326  5e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  41.09 
 
 		 412 aa  325  6e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4201  aminotransferase  41.41 
 
 		 405 aa  325  6e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2505  aminotransferase  41.36 
 
 		 407 aa  324  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784571  normal  0.124527 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0944  succinyldiaminopimelate transaminase  40.31 
 
 		 390 aa  324  1e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.989177  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2278  aminotransferase  40.83 
 
 		 405 aa  325  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874685  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0082  aminotransferase  41.91 
 
 		 428 aa  324  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0510162 
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  40.58 
 
 		 406 aa  324  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>