More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1970 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 388 aa  799    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  77.63 
 
 		 389 aa  637    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  76.29 
 
 		 388 aa  623  1e-177  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  57.92 
 
 		 388 aa  473  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  58.29 
 
 		 387 aa  467  9.999999999999999e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.4 
 
 		 385 aa  436  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.71 
 
 		 389 aa  429  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.88 
 
 		 385 aa  423  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  52.37 
 
 		 382 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  51.98 
 
 		 384 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.43 
 
 		 392 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  51.18 
 
 		 390 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  50.65 
 
 		 388 aa  408  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  50.65 
 
 		 382 aa  409  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  50.52 
 
 		 382 aa  410  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.18 
 
 		 388 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.56 
 
 		 390 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  49.61 
 
 		 384 aa  404  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  50.26 
 
 		 382 aa  392  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  50.26 
 
 		 391 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  48.03 
 
 		 403 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  49.74 
 
 		 401 aa  390  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.74 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  46.75 
 
 		 402 aa  383  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  48.29 
 
 		 390 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  46.97 
 
 		 391 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  44.16 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  48.95 
 
 		 387 aa  365  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  44.24 
 
 		 391 aa  360  2e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  43.27 
 
 		 400 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  44.21 
 
 		 386 aa  358  6e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  44.74 
 
 		 392 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  43.83 
 
 		 389 aa  348  6e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  44.06 
 
 		 394 aa  348  9e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  43.8 
 
 		 394 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  44.06 
 
 		 389 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  41.24 
 
 		 392 aa  330  4e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  40.78 
 
 		 388 aa  328  8e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  40.72 
 
 		 392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  37.92 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  41.93 
 
 		 399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  40.72 
 
 		 392 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  40.72 
 
 		 392 aa  327  3e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  40.72 
 
 		 392 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  40.72 
 
 		 392 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  40.46 
 
 		 392 aa  325  9e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  39.95 
 
 		 409 aa  325  9e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  40.72 
 
 		 406 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  40.46 
 
 		 396 aa  324  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  40.47 
 
 		 399 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  40.15 
 
 		 397 aa  323  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  40.21 
 
 		 392 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  38.2 
 
 		 395 aa  323  4e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  40.15 
 
 		 397 aa  322  5e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  39.69 
 
 		 393 aa  322  6e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  41.65 
 
 		 390 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0292  aminotransferase class I and II  39.43 
 
 		 391 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  38.9 
 
 		 397 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  40.05 
 
 		 399 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  42.93 
 
 		 392 aa  321  9.999999999999999e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  40.31 
 
 		 399 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2278  aminotransferase  39.21 
 
 		 405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874685  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3016  aminotransferase  40.42 
 
 		 406 aa  321  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562115  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  40 
 
 		 400 aa  320  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  40.26 
 
 		 400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3284  aminotransferase  40.72 
 
 		 406 aa  319  6e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.081713 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  39.95 
 
 		 392 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  40.36 
 
 		 399 aa  318  9e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  43.96 
 
 		 393 aa  318  1e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  40.05 
 
 		 399 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  39.74 
 
 		 400 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3995  aminotransferase  41.49 
 
 		 406 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3411  aminotransferase  40.21 
 
 		 406 aa  317  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3091  aminotransferase  40.21 
 
 		 406 aa  317  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.974806 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2899  aspartate aminotransferase  39.79 
 
 		 399 aa  316  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  38.36 
 
 		 394 aa  315  6e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5806  aminotransferase  39.95 
 
 		 406 aa  315  7e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.658046  decreased coverage  0.00092388 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0598  aminotransferase  39.43 
 
 		 394 aa  315  9e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1454  aminotransferase  38.42 
 
 		 405 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  hitchhiker  0.000434542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1923  aminotransferase  38.68 
 
 		 405 aa  315  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351936  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  38.62 
 
 		 393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  40.21 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  38.42 
 
 		 394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2310  aminotransferase  40.69 
 
 		 405 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  39.53 
 
 		 399 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6029  aminotransferase  39.95 
 
 		 406 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0777497  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1544  aminotransferase  38.16 
 
 		 405 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553471  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  39.53 
 
 		 399 aa  311  9e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  39.59 
 
 		 412 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  39.59 
 
 		 412 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  39.59 
 
 		 412 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  39.59 
 
 		 412 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  39.59 
 
 		 412 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1648  aminotransferase  40.69 
 
 		 405 aa  310  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  38.8 
 
 		 393 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  38.8 
 
 		 393 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  39.33 
 
 		 412 aa  310  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  39.33 
 
 		 411 aa  311  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5073  aminotransferase  40.21 
 
 		 409 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  38.7 
 
 		 391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>