More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2096 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
382 aa  790    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  74.87 
 
 
382 aa  618  1e-176  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  75.07 
 
 
382 aa  617  1e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  73.47 
 
 
382 aa  594  1e-169  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  69.37 
 
 
384 aa  579  1e-164  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  58.7 
 
 
385 aa  486  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  58.96 
 
 
385 aa  483  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  56.66 
 
 
388 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.23 
 
 
388 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.44 
 
 
388 aa  438  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  53.44 
 
 
390 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.28 
 
 
391 aa  433  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.99 
 
 
389 aa  431  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.88 
 
 
390 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  56.99 
 
 
392 aa  424  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.11 
 
 
392 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  50.92 
 
 
401 aa  412  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  52.73 
 
 
384 aa  413  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.86 
 
 
387 aa  407  1.0000000000000001e-112  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  50.26 
 
 
388 aa  398  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  50.13 
 
 
389 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  50 
 
 
389 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  50.26 
 
 
388 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  47.88 
 
 
403 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  50.39 
 
 
390 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  46.05 
 
 
402 aa  375  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  45.77 
 
 
400 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  45.81 
 
 
391 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  46.6 
 
 
392 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  45.77 
 
 
391 aa  368  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  45.34 
 
 
392 aa  369  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  46.98 
 
 
386 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  44.18 
 
 
394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  44.18 
 
 
394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  47.78 
 
 
387 aa  356  3.9999999999999996e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  42.41 
 
 
395 aa  356  3.9999999999999996e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  45.43 
 
 
388 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  42.15 
 
 
397 aa  354  1e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  43.34 
 
 
393 aa  354  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  43.46 
 
 
425 aa  354  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  42.15 
 
 
397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  42.41 
 
 
397 aa  352  4e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  45.17 
 
 
389 aa  352  5e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  43.6 
 
 
390 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  41.88 
 
 
394 aa  347  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  41.1 
 
 
390 aa  346  3e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2411  aminotransferase  44.47 
 
 
413 aa  345  6e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.306249  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  41.88 
 
 
394 aa  341  1e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  42.67 
 
 
400 aa  340  2e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  43.6 
 
 
396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  43.26 
 
 
393 aa  339  4e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  43.26 
 
 
393 aa  339  4e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2505  aminotransferase  42.67 
 
 
407 aa  339  5e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784571  normal  0.124527 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  41.62 
 
 
393 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  45.05 
 
 
395 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1299  aminotransferase  41.58 
 
 
403 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  41.62 
 
 
421 aa  338  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  41.62 
 
 
409 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0598  aminotransferase  42.15 
 
 
394 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0864  aminotransferase  41.47 
 
 
402 aa  335  5.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.565347  normal  0.675575 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1923  aminotransferase  41.62 
 
 
405 aa  335  7e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351936  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  41.62 
 
 
399 aa  335  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  41.69 
 
 
391 aa  334  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  41.62 
 
 
412 aa  333  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3016  aminotransferase  41.1 
 
 
406 aa  333  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562115  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2278  aminotransferase  42.41 
 
 
405 aa  333  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874685  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1916  aminotransferase  42.41 
 
 
407 aa  332  5e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  42.15 
 
 
406 aa  332  5e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  42.15 
 
 
406 aa  332  5e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1823  aminotransferase  42.23 
 
 
407 aa  332  6e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1252  aminotransferase  40.58 
 
 
396 aa  332  7.000000000000001e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000164192  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  40.73 
 
 
411 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5431  aminotransferase  40.73 
 
 
411 aa  332  9e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  41.36 
 
 
412 aa  331  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0944  succinyldiaminopimelate transaminase  41.47 
 
 
390 aa  331  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.989177  normal  0.168301 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  41.36 
 
 
412 aa  331  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  41.36 
 
 
412 aa  331  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  41.1 
 
 
412 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  40.47 
 
 
411 aa  330  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  41.36 
 
 
412 aa  330  2e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  41.1 
 
 
412 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  41.36 
 
 
412 aa  331  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  41.36 
 
 
412 aa  331  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  41.1 
 
 
412 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  41.36 
 
 
412 aa  331  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  41.1 
 
 
412 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  41.1 
 
 
412 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  41.36 
 
 
412 aa  330  3e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  40.79 
 
 
411 aa  328  7e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1407  aminotransferase  40.05 
 
 
413 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1544  aminotransferase  41.1 
 
 
405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553471  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1263  aspartate aminotransferase  39.07 
 
 
425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2866  aminotransferase  40.31 
 
 
413 aa  327  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  41.25 
 
 
402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0292  aminotransferase class I and II  39.16 
 
 
391 aa  326  5e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1267  aspartate aminotransferase  40.41 
 
 
404 aa  326  5e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  40.58 
 
 
407 aa  325  6e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  40.73 
 
 
402 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1738  aminotransferase  41.1 
 
 
405 aa  325  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.990718  normal  0.152146 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  40.73 
 
 
402 aa  325  9e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>