More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1272 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  100 
 
 
386 aa  800    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  49.47 
 
 
391 aa  417  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  48.29 
 
 
392 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  50.53 
 
 
392 aa  394  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  49.34 
 
 
390 aa  393  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  47.63 
 
 
382 aa  395  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  47.67 
 
 
388 aa  389  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  46.72 
 
 
389 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  50.26 
 
 
387 aa  388  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  46.83 
 
 
388 aa  388  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  47.38 
 
 
390 aa  382  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  46.23 
 
 
401 aa  382  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  47.14 
 
 
388 aa  383  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  47.14 
 
 
390 aa  380  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  45.77 
 
 
385 aa  378  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  45.77 
 
 
382 aa  378  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  47.77 
 
 
388 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  46.17 
 
 
382 aa  372  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  45.77 
 
 
403 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  46.98 
 
 
382 aa  369  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  46.05 
 
 
384 aa  370  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  45.93 
 
 
389 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  45.89 
 
 
402 aa  366  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  45.24 
 
 
385 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  42.04 
 
 
388 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  44.21 
 
 
388 aa  358  6e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  44.91 
 
 
384 aa  355  8.999999999999999e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  43.16 
 
 
400 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  43.42 
 
 
392 aa  352  5e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  43.6 
 
 
391 aa  348  9e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  42.78 
 
 
391 aa  346  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2278  aminotransferase  42.16 
 
 
405 aa  345  5e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874685  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1544  aminotransferase  41.9 
 
 
405 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553471  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1923  aminotransferase  41.39 
 
 
405 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351936  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  42.34 
 
 
406 aa  340  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  42.34 
 
 
406 aa  340  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1454  aminotransferase  41.39 
 
 
405 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  hitchhiker  0.000434542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1738  aminotransferase  41.65 
 
 
405 aa  339  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.990718  normal  0.152146 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1916  aminotransferase  42.34 
 
 
407 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2411  aminotransferase  42.45 
 
 
413 aa  335  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.306249  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  42.26 
 
 
394 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3411  aminotransferase  41.9 
 
 
406 aa  334  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  41.44 
 
 
392 aa  333  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  42.26 
 
 
394 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3091  aminotransferase  41.9 
 
 
406 aa  333  3e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.974806 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3284  aminotransferase  41.9 
 
 
406 aa  332  6e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.081713 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3522  aminotransferase  40.89 
 
 
406 aa  332  6e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0878596  normal  0.459618 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  42.82 
 
 
387 aa  332  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5806  aminotransferase  41.13 
 
 
406 aa  329  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.658046  decreased coverage  0.00092388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  40.79 
 
 
425 aa  329  4e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  39.43 
 
 
409 aa  329  6e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  38.54 
 
 
395 aa  326  3e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5073  aminotransferase  40.46 
 
 
409 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6029  aminotransferase  40.62 
 
 
406 aa  326  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0777497  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  41.09 
 
 
389 aa  325  6e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2505  aminotransferase  40.26 
 
 
407 aa  325  6e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784571  normal  0.124527 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  41.44 
 
 
389 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2310  aminotransferase  40.72 
 
 
405 aa  322  5e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1267  aspartate aminotransferase  39.64 
 
 
404 aa  322  6e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  37.79 
 
 
421 aa  322  8e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0082  aminotransferase  39.95 
 
 
428 aa  322  9.000000000000001e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0510162 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  39.69 
 
 
393 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1648  aminotransferase  40.72 
 
 
405 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23430  Aminotransferase, class I and II  39.16 
 
 
414 aa  321  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  39.69 
 
 
393 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  38.54 
 
 
397 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1299  aminotransferase  38.7 
 
 
403 aa  320  3e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0833  aspartate aminotransferase  39.59 
 
 
401 aa  320  3e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3995  aminotransferase  40.62 
 
 
406 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0957  aspartate aminotransferase  39.13 
 
 
404 aa  319  3.9999999999999996e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000423208  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  38.9 
 
 
402 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  39.16 
 
 
412 aa  319  6e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  39.69 
 
 
403 aa  318  9e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0501  aminotransferase  39.58 
 
 
413 aa  318  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0840  aminotransferase  38.64 
 
 
402 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450019  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  38.64 
 
 
402 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2782  aminotransferase  40.1 
 
 
406 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1203  aspartate aminotransferase  38.46 
 
 
403 aa  317  3e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0124735  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  38.9 
 
 
412 aa  316  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  38.9 
 
 
412 aa  316  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  38.9 
 
 
412 aa  316  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  38.9 
 
 
412 aa  316  4e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  38.9 
 
 
412 aa  316  4e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0864  aminotransferase  39.58 
 
 
402 aa  316  5e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.565347  normal  0.675575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  38.38 
 
 
402 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  38.9 
 
 
412 aa  315  6e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1106  aspartate aminotransferase  38.97 
 
 
411 aa  315  6e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.584654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  38.38 
 
 
411 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2967  aminotransferase  39.85 
 
 
406 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5431  aminotransferase  38.38 
 
 
411 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  38.12 
 
 
402 aa  315  9e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  38.9 
 
 
412 aa  315  9e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  38.89 
 
 
399 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  40.58 
 
 
390 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  38.64 
 
 
412 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2817  aminotransferase  39.59 
 
 
406 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2494  aminotransferase  40.1 
 
 
406 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.260589 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  38.82 
 
 
394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  38.64 
 
 
412 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  38.12 
 
 
411 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>