More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1431 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  84.32 
 
 		 389 aa  686    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 388 aa  799    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  76.29 
 
 		 388 aa  623  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  60 
 
 		 387 aa  474  1e-133  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  58.66 
 
 		 388 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.45 
 
 		 385 aa  443  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.93 
 
 		 385 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.09 
 
 		 389 aa  429  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  53.56 
 
 		 384 aa  428  1e-118  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.36 
 
 		 392 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  52.22 
 
 		 382 aa  419  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  53.32 
 
 		 382 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  52.33 
 
 		 384 aa  414  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.66 
 
 		 390 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.04 
 
 		 391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  51.05 
 
 		 382 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  48.83 
 
 		 388 aa  404  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  48.83 
 
 		 390 aa  403  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  55.35 
 
 		 392 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  51.04 
 
 		 401 aa  399  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  50.26 
 
 		 382 aa  398  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  48.04 
 
 		 388 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  50.13 
 
 		 390 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  48.29 
 
 		 403 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  46.88 
 
 		 391 aa  384  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  47.77 
 
 		 402 aa  381  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  47.77 
 
 		 386 aa  375  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  50.52 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  45.41 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  46.25 
 
 		 391 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  44.96 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  45.17 
 
 		 394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  44.91 
 
 		 394 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  45.38 
 
 		 392 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  43.6 
 
 		 389 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  44.27 
 
 		 389 aa  339  5e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  41.45 
 
 		 388 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  42.34 
 
 		 391 aa  334  2e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  43.86 
 
 		 409 aa  334  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  42.04 
 
 		 393 aa  334  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  45.24 
 
 		 392 aa  330  3e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0292  aminotransferase class I and II  41.69 
 
 		 391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  42.3 
 
 		 400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2505  aminotransferase  44.91 
 
 		 407 aa  325  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784571  normal  0.124527 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  42.04 
 
 		 399 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  41.62 
 
 		 388 aa  323  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  38.38 
 
 		 390 aa  322  5e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  40.73 
 
 		 393 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  41.51 
 
 		 421 aa  321  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  41.9 
 
 		 390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3016  aminotransferase  40.73 
 
 		 406 aa  320  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562115  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1394  aminotransferase class I and II  42.71 
 
 		 408 aa  319  5e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  41.67 
 
 		 412 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  41.67 
 
 		 412 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  41.67 
 
 		 412 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  41.67 
 
 		 412 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  41.41 
 
 		 412 aa  318  7e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  41.67 
 
 		 412 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  41.36 
 
 		 399 aa  317  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1299  aminotransferase  42.37 
 
 		 403 aa  316  4e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1267  aspartate aminotransferase  41.94 
 
 		 404 aa  316  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259449 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  41.15 
 
 		 412 aa  316  5e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  41.15 
 
 		 412 aa  316  5e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  41.15 
 
 		 412 aa  316  5e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  41.15 
 
 		 412 aa  316  5e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  41.15 
 
 		 412 aa  316  5e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  43.85 
 
 		 393 aa  316  5e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  38.2 
 
 		 395 aa  315  8e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  41.15 
 
 		 403 aa  315  8e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  41.15 
 
 		 412 aa  315  9e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  41.15 
 
 		 412 aa  315  9e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  41.15 
 
 		 412 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3918  succinyldiaminopimelate transaminase  40.31 
 
 		 392 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000686397  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  39.69 
 
 		 397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  39.16 
 
 		 394 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  40.89 
 
 		 393 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  39.22 
 
 		 400 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  40.89 
 
 		 393 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  40.62 
 
 		 411 aa  312  6.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  39.69 
 
 		 396 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  40.62 
 
 		 402 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3869  succinyldiaminopimelate transaminase  39.79 
 
 		 392 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0911  class I/II aminotransferase  38.89 
 
 		 400 aa  310  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.638659  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  40.94 
 
 		 402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3284  aminotransferase  39.69 
 
 		 406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.081713 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  40.73 
 
 		 397 aa  309  4e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3995  aminotransferase  40.21 
 
 		 406 aa  310  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  38.96 
 
 		 400 aa  309  5e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1334  aminotransferase  41.41 
 
 		 411 aa  309  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  41.41 
 
 		 411 aa  309  5e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  41.41 
 
 		 411 aa  309  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  41.41 
 
 		 411 aa  308  8e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  40.73 
 
 		 397 aa  308  9e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  40.62 
 
 		 402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0598  aminotransferase  40.58 
 
 		 394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  39.01 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  39.01 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2899  aspartate aminotransferase  39.01 
 
 		 399 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  40.36 
 
 		 402 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2411  aminotransferase  42.11 
 
 		 413 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.306249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>