More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0054 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 388 aa  795    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  60.84 
 
 		 385 aa  498  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  61.1 
 
 		 385 aa  497  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  58.64 
 
 		 390 aa  479  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  57.92 
 
 		 388 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  58.66 
 
 		 389 aa  474  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  58.66 
 
 		 388 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  56.4 
 
 		 382 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.59 
 
 		 389 aa  463  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.81 
 
 		 392 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  57.7 
 
 		 382 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  57.07 
 
 		 382 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  55.64 
 
 		 391 aa  455  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  56.66 
 
 		 382 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  55.15 
 
 		 387 aa  452  1.0000000000000001e-126  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  56.69 
 
 		 384 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  57.03 
 
 		 392 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.59 
 
 		 388 aa  432  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  51.32 
 
 		 390 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.63 
 
 		 390 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  50.79 
 
 		 388 aa  423  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  54.55 
 
 		 384 aa  418  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  50.13 
 
 		 389 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  48.69 
 
 		 401 aa  413  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  47.51 
 
 		 391 aa  406  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  47.89 
 
 		 403 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  48.96 
 
 		 391 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  48.68 
 
 		 402 aa  394  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  50.13 
 
 		 387 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  46.83 
 
 		 386 aa  388  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  46.46 
 
 		 400 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  45.79 
 
 		 392 aa  385  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  47.77 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  48.3 
 
 		 388 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  47.51 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  45.26 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  43.9 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  43.46 
 
 		 409 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  44.01 
 
 		 390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  44.04 
 
 		 392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  43.41 
 
 		 392 aa  352  5e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  43.78 
 
 		 406 aa  350  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  41.54 
 
 		 395 aa  349  4e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  42.75 
 
 		 392 aa  348  7e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  42.75 
 
 		 392 aa  348  7e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  42.75 
 
 		 392 aa  348  7e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  42.75 
 
 		 392 aa  348  7e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  43.19 
 
 		 393 aa  348  8e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  42.38 
 
 		 392 aa  347  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  42.3 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  43.01 
 
 		 392 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  42.49 
 
 		 392 aa  347  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  45.41 
 
 		 395 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  42.93 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  40.84 
 
 		 390 aa  347  3e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  44.64 
 
 		 392 aa  346  4e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  41.88 
 
 		 397 aa  342  5.999999999999999e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  42.93 
 
 		 400 aa  342  5.999999999999999e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  42.71 
 
 		 396 aa  342  7e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  41.88 
 
 		 397 aa  341  1e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0292  aminotransferase class I and II  42.15 
 
 		 391 aa  340  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  40.87 
 
 		 397 aa  338  7e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  42.15 
 
 		 393 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  41.75 
 
 		 425 aa  335  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  41.36 
 
 		 412 aa  333  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  41.36 
 
 		 394 aa  334  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  41.71 
 
 		 391 aa  333  2e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  40.84 
 
 		 402 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  41.82 
 
 		 400 aa  333  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  40.84 
 
 		 402 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  41.56 
 
 		 399 aa  333  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  41.25 
 
 		 393 aa  333  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  41.25 
 
 		 393 aa  333  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  40.05 
 
 		 394 aa  333  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  42.78 
 
 		 393 aa  333  4e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  40.58 
 
 		 411 aa  332  6e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0840  aminotransferase  40.58 
 
 		 402 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450019  normal  0.811052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  41.1 
 
 		 412 aa  331  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  41.1 
 
 		 412 aa  331  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  41.1 
 
 		 412 aa  331  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  41.1 
 
 		 402 aa  331  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2411  aminotransferase  42.86 
 
 		 413 aa  331  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.306249  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  41.1 
 
 		 412 aa  331  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  41.1 
 
 		 412 aa  331  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  41.1 
 
 		 412 aa  331  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  40.84 
 
 		 412 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0598  aminotransferase  41.25 
 
 		 394 aa  330  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  40.84 
 
 		 412 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  40.84 
 
 		 412 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  40.31 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  40.84 
 
 		 412 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  40.84 
 
 		 412 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  40.31 
 
 		 402 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  41.3 
 
 		 399 aa  330  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  41.1 
 
 		 412 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0018  transaminase  42.31 
 
 		 394 aa  330  3e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  40.84 
 
 		 412 aa  330  4e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  40.84 
 
 		 411 aa  329  4e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1544  aminotransferase  41.75 
 
 		 405 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553471  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  41.3 
 
 		 400 aa  329  6e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>