More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1744 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  100 
 
 
395 aa  802    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  77.32 
 
 
390 aa  633  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  68.81 
 
 
406 aa  578  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  70.47 
 
 
396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  68.65 
 
 
392 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  68.91 
 
 
392 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  68.91 
 
 
392 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  68.65 
 
 
392 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  68.65 
 
 
392 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  68.91 
 
 
392 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  68.91 
 
 
392 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  68.65 
 
 
392 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  68.39 
 
 
392 aa  569  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  61.99 
 
 
392 aa  496  1e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0018  transaminase  60.66 
 
 
394 aa  483  1e-135  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  58.03 
 
 
391 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  57.47 
 
 
393 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  46.07 
 
 
382 aa  369  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  46.83 
 
 
391 aa  364  1e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  46.09 
 
 
384 aa  360  2e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  45.87 
 
 
392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  43.39 
 
 
389 aa  356  5e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  45.19 
 
 
385 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  45.41 
 
 
388 aa  353  2.9999999999999997e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  45.57 
 
 
382 aa  353  4e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  45.03 
 
 
388 aa  352  7e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  45.55 
 
 
385 aa  347  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  45.05 
 
 
382 aa  346  4e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  43.56 
 
 
390 aa  343  2e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  44.59 
 
 
387 aa  343  2.9999999999999997e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  43.81 
 
 
388 aa  343  4e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  48.83 
 
 
392 aa  342  9e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  45.24 
 
 
390 aa  342  9e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  45.95 
 
 
403 aa  341  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  43.57 
 
 
397 aa  339  5e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  44.97 
 
 
392 aa  338  8e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  44.33 
 
 
382 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  45.48 
 
 
425 aa  335  5.999999999999999e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  44.39 
 
 
402 aa  333  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  43.19 
 
 
399 aa  333  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  43.19 
 
 
399 aa  334  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  44.41 
 
 
389 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  43.86 
 
 
400 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  42.67 
 
 
399 aa  333  4e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  46.03 
 
 
389 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  44.97 
 
 
391 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  42.38 
 
 
389 aa  330  3e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  42.52 
 
 
392 aa  328  9e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  43.73 
 
 
401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  43.19 
 
 
400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2899  aspartate aminotransferase  43.19 
 
 
399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  41.28 
 
 
395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  42.67 
 
 
399 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  42.93 
 
 
400 aa  326  5e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  43.68 
 
 
400 aa  325  6e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  42.67 
 
 
399 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  42.67 
 
 
399 aa  324  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  42.67 
 
 
399 aa  324  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246294 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1299  aminotransferase  42.86 
 
 
403 aa  323  4e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  41.99 
 
 
394 aa  322  7e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  42.12 
 
 
397 aa  320  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  43.08 
 
 
393 aa  320  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0833  aspartate aminotransferase  41.81 
 
 
401 aa  320  3e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  43.08 
 
 
393 aa  320  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  42.75 
 
 
384 aa  320  3e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  41.73 
 
 
394 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2505  aminotransferase  42.59 
 
 
407 aa  319  3.9999999999999996e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784571  normal  0.124527 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.93 
 
 
391 aa  319  3.9999999999999996e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  46.44 
 
 
387 aa  319  5e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2411  aminotransferase  41.78 
 
 
413 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.306249  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  41.86 
 
 
397 aa  318  1e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3016  aminotransferase  41.1 
 
 
406 aa  317  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562115  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  43.05 
 
 
409 aa  316  4e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  41.3 
 
 
390 aa  316  6e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1145  aspartate aminotransferase  41.81 
 
 
402 aa  315  7e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  45.57 
 
 
387 aa  315  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2582  aminotransferase, class I and II  43.34 
 
 
384 aa  314  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2636  aminotransferase class I and II  43.34 
 
 
384 aa  314  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0218  aspartate aminotransferase  41.31 
 
 
401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0292  aspartate aminotransferase  41.56 
 
 
402 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.99 
 
 
388 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  42.3 
 
 
394 aa  312  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  42.04 
 
 
394 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1027  aspartate aminotransferase  41.1 
 
 
400 aa  311  2e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000262896  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1252  aminotransferase  41.39 
 
 
396 aa  310  2e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000164192  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  39.63 
 
 
421 aa  311  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  41.19 
 
 
406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1916  aminotransferase  41.45 
 
 
407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  41.19 
 
 
406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1267  aspartate aminotransferase  40.7 
 
 
404 aa  310  4e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  43.47 
 
 
388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  40.64 
 
 
390 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  43.01 
 
 
399 aa  308  6.999999999999999e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0165  aspartate aminotransferase  40.57 
 
 
400 aa  308  8e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  43.85 
 
 
403 aa  307  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  42.67 
 
 
394 aa  307  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0501  aminotransferase  40.79 
 
 
413 aa  306  5.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0186  aspartate aminotransferase  39.8 
 
 
400 aa  306  5.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2134  aminotransferase, class I  42.01 
 
 
386 aa  305  6e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3995  aminotransferase  40.83 
 
 
406 aa  305  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>