More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2134 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2134  aminotransferase, class I  100 
 
 		 386 aa  802    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2582  aminotransferase, class I and II  79.37 
 
 		 384 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2636  aminotransferase class I and II  79.37 
 
 		 384 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  39.79 
 
 		 390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  41.3 
 
 		 392 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  41.3 
 
 		 392 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  41.3 
 
 		 392 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  41.3 
 
 		 392 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  41.3 
 
 		 392 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  41.3 
 
 		 392 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  41.04 
 
 		 392 aa  299  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  41.04 
 
 		 406 aa  300  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  42.01 
 
 		 395 aa  298  8e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  40.78 
 
 		 392 aa  298  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  40.67 
 
 		 392 aa  297  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  39.84 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  37.76 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  39.53 
 
 		 393 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0018  transaminase  39.49 
 
 		 394 aa  276  5e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  38.32 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  38.78 
 
 		 392 aa  266  4e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.86 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  37.31 
 
 		 403 aa  260  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.65 
 
 		 385 aa  259  7e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.39 
 
 		 389 aa  259  7e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  35.75 
 
 		 401 aa  259  8e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.2 
 
 		 385 aa  258  9e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  36.5 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  37.31 
 
 		 384 aa  257  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  35.58 
 
 		 388 aa  257  3e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  34.73 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  36.18 
 
 		 392 aa  255  7e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  37.46 
 
 		 392 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  35.09 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  35.86 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  35.48 
 
 		 388 aa  252  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  35.4 
 
 		 388 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  35.6 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  35.86 
 
 		 388 aa  250  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  36.69 
 
 		 402 aa  249  4e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  35.38 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  35.38 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  35.16 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  35.14 
 
 		 389 aa  243  5e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  34.46 
 
 		 386 aa  239  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  33.94 
 
 		 382 aa  240  4e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  34.9 
 
 		 391 aa  239  8e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  36.02 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  37.17 
 
 		 387 aa  236  6e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  35.9 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  34.28 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  34.92 
 
 		 392 aa  232  8.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  33.07 
 
 		 388 aa  232  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  33.59 
 
 		 382 aa  231  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  34.46 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  34.29 
 
 		 399 aa  229  9e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  33.33 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  33.51 
 
 		 382 aa  224  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  34.28 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  32.98 
 
 		 389 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  34.28 
 
 		 400 aa  222  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  33.05 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  33.05 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  34.56 
 
 		 399 aa  219  7e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  32.11 
 
 		 395 aa  219  8.999999999999998e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1106  aspartate aminotransferase  31.96 
 
 		 411 aa  218  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.584654 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1794  succinyldiaminopimelate transaminase  32.9 
 
 		 392 aa  218  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.455812  decreased coverage  0.0036927 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  34 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  33.99 
 
 		 400 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  33.71 
 
 		 400 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  33.71 
 
 		 399 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07380  aminotransferase  32.63 
 
 		 385 aa  216  5e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2899  aspartate aminotransferase  33.99 
 
 		 399 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  33.99 
 
 		 399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246294 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  31.19 
 
 		 393 aa  215  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5101  succinyldiaminopimelate transaminase  32.47 
 
 		 390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.26447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0159  succinyldiaminopimelate transaminase  33.42 
 
 		 407 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.899498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  31.88 
 
 		 388 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  31.65 
 
 		 397 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0833  aspartate aminotransferase  32.07 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1267  aspartate aminotransferase  32.78 
 
 		 404 aa  210  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1027  aspartate aminotransferase  32.88 
 
 		 400 aa  210  4e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000262896  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  31.93 
 
 		 394 aa  209  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0292  aminotransferase class I and II  31.74 
 
 		 391 aa  209  7e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1145  aspartate aminotransferase  32.61 
 
 		 402 aa  209  7e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0165  aspartate aminotransferase  30.53 
 
 		 400 aa  209  8e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0957  aspartate aminotransferase  31.96 
 
 		 404 aa  208  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000423208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  30.53 
 
 		 390 aa  207  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  32.02 
 
 		 400 aa  206  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0506  aminotransferase  30.9 
 
 		 406 aa  206  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0194715  normal  0.65304 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0168  aminotransferase class I and II  31.78 
 
 		 403 aa  206  4e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.391722  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1308  aspartate aminotransferase  31.96 
 
 		 400 aa  206  5e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.698251  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  32.3 
 
 		 421 aa  206  5e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1203  aspartate aminotransferase  31.68 
 
 		 403 aa  206  6e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0124735  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0292  aspartate aminotransferase  32.07 
 
 		 402 aa  206  7e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4201  aminotransferase  32.3 
 
 		 405 aa  206  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0186  aspartate aminotransferase  31.25 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1415  aspartate aminotransferase  32.79 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0911  class I/II aminotransferase  31.65 
 
 		 400 aa  204  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.638659  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0146  aspartate aminotransferase  30.98 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.126801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>