More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07380 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_07380  aminotransferase  100 
 
 		 385 aa  801    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0516  aminotransferase, class I and II  59.04 
 
 		 381 aa  487  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.883743  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1938  aminotransferase class I and II  51.97 
 
 		 388 aa  421  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3792  aminotransferase class I and II  50.93 
 
 		 381 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0765  aminotransferase  51.18 
 
 		 391 aa  403  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3140  aminotransferase class I and II  49.21 
 
 		 385 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6544  aminotransferase class I and II  47.53 
 
 		 403 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  42.33 
 
 		 387 aa  320  3e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.47 
 
 		 388 aa  319  5e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  40.94 
 
 		 390 aa  318  7.999999999999999e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.9 
 
 		 388 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  39.9 
 
 		 386 aa  308  8e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.6 
 
 		 389 aa  306  3e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.14 
 
 		 392 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.16 
 
 		 388 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.56 
 
 		 389 aa  296  5e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  37.66 
 
 		 387 aa  293  3e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.38 
 
 		 388 aa  293  5e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.8 
 
 		 385 aa  291  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.37 
 
 		 391 aa  290  2e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.94 
 
 		 385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  36.46 
 
 		 391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  39.69 
 
 		 384 aa  281  2e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.08 
 
 		 390 aa  279  7e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  36.77 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  36.15 
 
 		 388 aa  278  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  36.72 
 
 		 403 aa  277  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  37.99 
 
 		 382 aa  278  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  36.29 
 
 		 401 aa  276  4e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  37.71 
 
 		 394 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  37.8 
 
 		 406 aa  272  7e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  37.53 
 
 		 392 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  37.53 
 
 		 392 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  37.53 
 
 		 392 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  37.53 
 
 		 392 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  37.53 
 
 		 392 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  38.06 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  38.52 
 
 		 384 aa  270  4e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.03 
 
 		 390 aa  270  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  37.53 
 
 		 392 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  35.96 
 
 		 400 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.72 
 
 		 391 aa  269  7e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  36.58 
 
 		 389 aa  269  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  37.27 
 
 		 392 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  35.42 
 
 		 402 aa  268  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  37.01 
 
 		 392 aa  266  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  37.2 
 
 		 382 aa  266  4e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  36.48 
 
 		 396 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  34.99 
 
 		 392 aa  265  8e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  36.05 
 
 		 399 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  35.79 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  37.47 
 
 		 382 aa  264  2e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  36.05 
 
 		 400 aa  263  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  35.28 
 
 		 392 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  35.2 
 
 		 390 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  35.79 
 
 		 400 aa  263  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  37.6 
 
 		 395 aa  262  8e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  35.79 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246294 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  37.47 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  34.38 
 
 		 388 aa  260  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  35.53 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  36.05 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  35.26 
 
 		 400 aa  260  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2899  aspartate aminotransferase  35.26 
 
 		 399 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  35.53 
 
 		 399 aa  259  6e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0567  aminotransferase class I and II  35.32 
 
 		 403 aa  259  6e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  35.53 
 
 		 399 aa  259  7e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  37.08 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  34.12 
 
 		 397 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.41 
 
 		 392 aa  255  8e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  35.26 
 
 		 393 aa  252  7e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  33.16 
 
 		 390 aa  250  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0018  transaminase  34.29 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  33.07 
 
 		 394 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  33.07 
 
 		 394 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  34.47 
 
 		 403 aa  249  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1454  aminotransferase  34.2 
 
 		 405 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  hitchhiker  0.000434542 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  33.16 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  34.03 
 
 		 393 aa  246  6e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1544  aminotransferase  34.29 
 
 		 405 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  35.58 
 
 		 389 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23430  Aminotransferase, class I and II  34.21 
 
 		 414 aa  243  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  34.38 
 
 		 399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  33.77 
 
 		 406 aa  243  5e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  33.25 
 
 		 393 aa  243  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  33.77 
 
 		 406 aa  243  5e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1916  aminotransferase  34.03 
 
 		 407 aa  242  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0082  aminotransferase  33.68 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0510162 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  33.6 
 
 		 412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  33.6 
 
 		 412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2278  aminotransferase  33.16 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874685  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  33.6 
 
 		 412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  33.6 
 
 		 412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  33.6 
 
 		 412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4201  aminotransferase  33.16 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  33.6 
 
 		 412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  33.6 
 
 		 412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  32.89 
 
 		 402 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  33.33 
 
 		 402 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  33.16 
 
 		 402 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>