More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3140 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3140  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 385 aa  800    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6544  aminotransferase class I and II  70.69 
 
 		 403 aa  583  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0516  aminotransferase, class I and II  52.36 
 
 		 381 aa  420  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.883743  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0765  aminotransferase  51.95 
 
 		 391 aa  421  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1938  aminotransferase class I and II  50.78 
 
 		 388 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3792  aminotransferase class I and II  51.45 
 
 		 381 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07380  aminotransferase  49.21 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  41.65 
 
 		 392 aa  296  5e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.78 
 
 		 388 aa  286  5.999999999999999e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  40.57 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  44.35 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  40.1 
 
 		 403 aa  282  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.16 
 
 		 388 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.79 
 
 		 388 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  41.24 
 
 		 392 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  40.31 
 
 		 382 aa  280  3e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  39.32 
 
 		 402 aa  279  6e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  41.71 
 
 		 390 aa  276  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.63 
 
 		 389 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  37.96 
 
 		 386 aa  275  8e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.06 
 
 		 387 aa  275  8e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.92 
 
 		 389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.47 
 
 		 385 aa  271  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  37.66 
 
 		 388 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  39.63 
 
 		 388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.47 
 
 		 385 aa  270  4e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  38.54 
 
 		 394 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  36.88 
 
 		 399 aa  268  8e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  37.89 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  37.37 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.64 
 
 		 391 aa  266  5e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  38.02 
 
 		 392 aa  265  7e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  37.76 
 
 		 391 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  38.21 
 
 		 390 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  36.1 
 
 		 399 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  35.58 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  36.81 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  35.58 
 
 		 399 aa  259  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  38.7 
 
 		 391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  37.92 
 
 		 400 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  38.76 
 
 		 382 aa  259  6e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  35.58 
 
 		 399 aa  259  6e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  35.84 
 
 		 400 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  36.36 
 
 		 399 aa  257  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  38.9 
 
 		 387 aa  257  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  36.98 
 
 		 401 aa  257  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  39.15 
 
 		 389 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  36.04 
 
 		 392 aa  257  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.11 
 
 		 388 aa  257  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  38.38 
 
 		 382 aa  257  3e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  38.28 
 
 		 395 aa  255  7e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  40 
 
 		 392 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  35.77 
 
 		 392 aa  254  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  35.06 
 
 		 400 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  35.5 
 
 		 392 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  35.5 
 
 		 392 aa  253  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.5 
 
 		 390 aa  253  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2899  aspartate aminotransferase  35.06 
 
 		 399 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  35.5 
 
 		 392 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  35.5 
 
 		 392 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  35.5 
 
 		 392 aa  253  6e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  35.5 
 
 		 392 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  39.01 
 
 		 387 aa  252  9.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  35.5 
 
 		 406 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.79 
 
 		 391 aa  251  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  35.32 
 
 		 399 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  35.5 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  34.81 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  36.04 
 
 		 396 aa  249  6e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  36.98 
 
 		 394 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  36.98 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  33.95 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  33.95 
 
 		 397 aa  234  3e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  35.49 
 
 		 393 aa  231  2e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  33.77 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  34.29 
 
 		 403 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3016  aminotransferase  34.12 
 
 		 406 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562115  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1447  aminotransferase class I and II  34.61 
 
 		 398 aa  228  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000395976  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  34.92 
 
 		 388 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  34.96 
 
 		 412 aa  225  9e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  35.48 
 
 		 412 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  35.48 
 
 		 412 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  33.68 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  35.48 
 
 		 412 aa  225  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  35.48 
 
 		 412 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  35.48 
 
 		 412 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  34.96 
 
 		 411 aa  225  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  35.48 
 
 		 412 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  33.42 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1454  aminotransferase  34.96 
 
 		 405 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  hitchhiker  0.000434542 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4201  aminotransferase  33.33 
 
 		 405 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  34.79 
 
 		 412 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  35.31 
 
 		 412 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.890867 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  34.7 
 
 		 412 aa  223  6e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  34.7 
 
 		 412 aa  223  6e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  34.7 
 
 		 412 aa  223  6e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  34.7 
 
 		 412 aa  223  6e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  34.7 
 
 		 412 aa  223  6e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4268  aminotransferase  33.59 
 
 		 418 aa  222  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0567  aminotransferase class I and II  33.68 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>