More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1938 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1938  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 388 aa  807    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3792  aminotransferase class I and II  63.76 
 
 		 381 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0516  aminotransferase, class I and II  55.26 
 
 		 381 aa  439  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.883743  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07380  aminotransferase  51.97 
 
 		 385 aa  411  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0765  aminotransferase  51.41 
 
 		 391 aa  402  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6544  aminotransferase class I and II  49.36 
 
 		 403 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3140  aminotransferase class I and II  50.78 
 
 		 385 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.93 
 
 		 387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.94 
 
 		 388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  41.33 
 
 		 388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  40.41 
 
 		 390 aa  301  1e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.8 
 
 		 389 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.74 
 
 		 388 aa  291  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.41 
 
 		 389 aa  290  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.64 
 
 		 392 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.95 
 
 		 390 aa  289  5.0000000000000004e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  38.86 
 
 		 387 aa  289  6e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  37.82 
 
 		 386 aa  286  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  37.82 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.64 
 
 		 391 aa  281  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.38 
 
 		 388 aa  279  5e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  40.74 
 
 		 392 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  38.54 
 
 		 382 aa  276  3e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  38.28 
 
 		 391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  37.98 
 
 		 388 aa  273  4.0000000000000004e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  37.73 
 
 		 382 aa  272  6e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  40 
 
 		 394 aa  273  6e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  38.32 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  37.92 
 
 		 382 aa  270  4e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.7 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.32 
 
 		 385 aa  266  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  38.16 
 
 		 384 aa  265  1e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  35.23 
 
 		 399 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  35.92 
 
 		 399 aa  262  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  36.48 
 
 		 402 aa  261  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  34.72 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  35.4 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  36.01 
 
 		 400 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  36.36 
 
 		 391 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  36.01 
 
 		 400 aa  259  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  36.01 
 
 		 399 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246294 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  36.05 
 
 		 388 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  35 
 
 		 382 aa  259  7e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  35.49 
 
 		 393 aa  259  7e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  35.49 
 
 		 393 aa  259  7e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  35.84 
 
 		 392 aa  259  8e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  35.84 
 
 		 399 aa  258  9e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  35.4 
 
 		 400 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2899  aspartate aminotransferase  35.4 
 
 		 399 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  38.62 
 
 		 389 aa  256  6e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  35.16 
 
 		 390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  35.05 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  34.88 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0567  aminotransferase class I and II  36.1 
 
 		 403 aa  253  3e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  32.99 
 
 		 395 aa  252  7e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  36.36 
 
 		 397 aa  252  8.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  35.34 
 
 		 400 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  35 
 
 		 385 aa  251  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  34.55 
 
 		 411 aa  249  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  34.55 
 
 		 403 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  35.14 
 
 		 384 aa  249  5e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  35.84 
 
 		 397 aa  249  7e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  34.46 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  34.55 
 
 		 412 aa  248  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  34.29 
 
 		 412 aa  246  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  35.73 
 
 		 401 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0864  aminotransferase  36.01 
 
 		 402 aa  245  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.565347  normal  0.675575 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1407  aminotransferase  34.19 
 
 		 413 aa  245  9e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  33.51 
 
 		 402 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4201  aminotransferase  33.77 
 
 		 405 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  34.03 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  34.03 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  34.03 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  34.03 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  34.03 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  34.03 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  33.77 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  34.03 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  34.03 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  34.03 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  34.03 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  34.03 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  34.03 
 
 		 402 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  34.03 
 
 		 402 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1823  aminotransferase  36.27 
 
 		 407 aa  243  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  35.58 
 
 		 387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0840  aminotransferase  33.25 
 
 		 402 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450019  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  34.47 
 
 		 390 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  35.05 
 
 		 409 aa  242  7e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 		 390 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4268  aminotransferase  33.51 
 
 		 418 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  34.03 
 
 		 412 aa  242  9e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  34.29 
 
 		 402 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  33.68 
 
 		 400 aa  241  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  33.25 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2866  aminotransferase  33.68 
 
 		 413 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  32.99 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  33.25 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  33.25 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  33.42 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>