More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2592 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  100 
 
 
394 aa  806    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  61.56 
 
 
399 aa  533  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  59.49 
 
 
400 aa  518  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  60.57 
 
 
399 aa  519  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  60.57 
 
 
399 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  60.42 
 
 
399 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  58.85 
 
 
399 aa  513  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  58.97 
 
 
400 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2899  aspartate aminotransferase  58.97 
 
 
399 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  58.46 
 
 
399 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  58.97 
 
 
399 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246294 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  58.85 
 
 
400 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  49.1 
 
 
389 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  49.47 
 
 
388 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  44.5 
 
 
392 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  43.54 
 
 
391 aa  338  8e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  44.97 
 
 
382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  44.5 
 
 
390 aa  335  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  45.03 
 
 
387 aa  333  3e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  43.04 
 
 
388 aa  333  4e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  43.01 
 
 
385 aa  333  4e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  43.15 
 
 
403 aa  331  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  42.82 
 
 
391 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.41 
 
 
389 aa  329  4e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  41.41 
 
 
402 aa  326  4.0000000000000003e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  41.99 
 
 
388 aa  324  1e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  42.56 
 
 
384 aa  324  2e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  41.47 
 
 
390 aa  323  3e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  40.16 
 
 
400 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  41.41 
 
 
390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  41.78 
 
 
382 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  42.06 
 
 
385 aa  319  5e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  39.43 
 
 
392 aa  313  2.9999999999999996e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  41.78 
 
 
392 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  40.87 
 
 
392 aa  312  6.999999999999999e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  40.16 
 
 
396 aa  311  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  40 
 
 
388 aa  311  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  40.31 
 
 
401 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  42.3 
 
 
389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  41.53 
 
 
382 aa  310  4e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  41.25 
 
 
382 aa  309  5e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.84 
 
 
387 aa  309  5.9999999999999995e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  40.68 
 
 
392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  40.68 
 
 
392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  40.68 
 
 
392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  40.68 
 
 
392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  40.57 
 
 
394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  40.68 
 
 
392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  40.31 
 
 
394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  38.32 
 
 
386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  39.9 
 
 
388 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.94 
 
 
388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  40.42 
 
 
392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.11 
 
 
388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  40.42 
 
 
392 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  40.42 
 
 
392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  39.9 
 
 
406 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.79 
 
 
390 aa  302  7.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  40.16 
 
 
392 aa  302  9e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.53 
 
 
389 aa  300  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  42.67 
 
 
395 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  39.74 
 
 
395 aa  299  5e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  40.47 
 
 
384 aa  298  1e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.85 
 
 
391 aa  296  3e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  43.19 
 
 
392 aa  296  4e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5101  succinyldiaminopimelate transaminase  40 
 
 
390 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.26447 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  39.37 
 
 
391 aa  294  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0911  class I/II aminotransferase  39.23 
 
 
400 aa  293  3e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.638659  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1447  aminotransferase class I and II  39.53 
 
 
398 aa  293  3e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000395976  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3869  succinyldiaminopimelate transaminase  39.58 
 
 
392 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3918  succinyldiaminopimelate transaminase  39.58 
 
 
392 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000686397  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  41.13 
 
 
393 aa  292  5e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2411  aminotransferase  41.25 
 
 
413 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.306249  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  38.89 
 
 
421 aa  291  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  41.31 
 
 
411 aa  290  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  42.34 
 
 
411 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5431  aminotransferase  42.39 
 
 
411 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0159  succinyldiaminopimelate transaminase  37.91 
 
 
407 aa  289  6e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.899498  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  40.21 
 
 
400 aa  288  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  40.67 
 
 
412 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  40.93 
 
 
412 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0567  aminotransferase class I and II  38.7 
 
 
403 aa  288  2e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  40.93 
 
 
412 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  40.93 
 
 
412 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  40.93 
 
 
412 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  40.93 
 
 
412 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0292  aspartate aminotransferase  38.89 
 
 
402 aa  288  2e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2866  aminotransferase  40.67 
 
 
413 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1407  aminotransferase  40.16 
 
 
413 aa  286  4e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1299  aminotransferase  40.58 
 
 
403 aa  286  4e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  40.68 
 
 
425 aa  286  5.999999999999999e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  40.41 
 
 
412 aa  285  7e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  40.41 
 
 
412 aa  285  7e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  40.41 
 
 
412 aa  285  7e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  40.41 
 
 
412 aa  285  7e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  41.56 
 
 
411 aa  285  7e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  40.41 
 
 
412 aa  285  7e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  40.41 
 
 
412 aa  285  7e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3010  aminotransferase class I and II  41.02 
 
 
388 aa  285  7e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0774933 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  40.67 
 
 
411 aa  285  8e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>