More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_3010 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_3010  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 388 aa  773    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0774933 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3182  aminotransferase class I and II  69.27 
 
 		 384 aa  495  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0525687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  45.48 
 
 		 388 aa  349  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0911  class I/II aminotransferase  43.8 
 
 		 400 aa  341  1e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.638659  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1758  aminotransferase, class I and II  51.62 
 
 		 391 aa  341  1e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0944  succinyldiaminopimelate transaminase  45.14 
 
 		 390 aa  340  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.989177  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3869  succinyldiaminopimelate transaminase  44.41 
 
 		 392 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3918  succinyldiaminopimelate transaminase  43.88 
 
 		 392 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000686397  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1794  succinyldiaminopimelate transaminase  46.51 
 
 		 392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.455812  decreased coverage  0.0036927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5101  succinyldiaminopimelate transaminase  46.11 
 
 		 390 aa  332  6e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.26447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0159  succinyldiaminopimelate transaminase  42.79 
 
 		 407 aa  330  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.899498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  40.59 
 
 		 389 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  41.53 
 
 		 388 aa  290  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  42.9 
 
 		 403 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.19 
 
 		 385 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  42.44 
 
 		 387 aa  286  5.999999999999999e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  41.02 
 
 		 394 aa  285  7e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  41.34 
 
 		 402 aa  278  8e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  39.47 
 
 		 392 aa  277  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  38.81 
 
 		 400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  41.13 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.97 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  40.16 
 
 		 388 aa  269  7e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  36.39 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  35.41 
 
 		 389 aa  268  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  38.27 
 
 		 399 aa  267  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  37.84 
 
 		 382 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.77 
 
 		 388 aa  266  4e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  38.01 
 
 		 399 aa  266  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  38.27 
 
 		 399 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  39.39 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  38.01 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  38.27 
 
 		 399 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  39.39 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  36.84 
 
 		 390 aa  264  2e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1774  aminotransferase  41.78 
 
 		 396 aa  263  3e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.472622  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  35.83 
 
 		 388 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.43 
 
 		 385 aa  263  3e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  38.01 
 
 		 400 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2899  aspartate aminotransferase  38.01 
 
 		 399 aa  263  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  38.01 
 
 		 399 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246294 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  37.74 
 
 		 400 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  37.47 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.14 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.56 
 
 		 389 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  37.74 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.83 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.92 
 
 		 390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.33 
 
 		 391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.44 
 
 		 390 aa  256  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0644  aminotransferase  37.93 
 
 		 402 aa  256  5e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439805  normal  0.145502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  35.04 
 
 		 382 aa  256  7e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  35.95 
 
 		 382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  37.5 
 
 		 382 aa  253  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1447  aminotransferase class I and II  34.38 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000395976  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4268  aminotransferase  36.04 
 
 		 418 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4201  aminotransferase  36.04 
 
 		 405 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  36.04 
 
 		 412 aa  250  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  35.77 
 
 		 412 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  35.77 
 
 		 412 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  35.77 
 
 		 412 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  35.77 
 
 		 412 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  35.77 
 
 		 412 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.04 
 
 		 387 aa  249  7e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  35.58 
 
 		 397 aa  249  8e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  35.77 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  35.77 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  35.77 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  35.77 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  35.77 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  35.77 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  38.75 
 
 		 392 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  35.77 
 
 		 411 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  35.5 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  35.77 
 
 		 412 aa  246  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  35.5 
 
 		 412 aa  246  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  38.92 
 
 		 389 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  34.77 
 
 		 394 aa  246  4e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0590  aminotransferase  40.26 
 
 		 396 aa  246  6.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  34.42 
 
 		 395 aa  245  8e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  35.7 
 
 		 425 aa  244  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  35.01 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  35.01 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  34.75 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  35.77 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1334  aminotransferase  35.01 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5431  aminotransferase  35.77 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  36.63 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  35.77 
 
 		 407 aa  244  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.62 
 
 		 392 aa  243  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  35.5 
 
 		 402 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  35.5 
 
 		 402 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  35.23 
 
 		 411 aa  242  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2583  aminotransferase  35.5 
 
 		 409 aa  242  7e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117889  normal  0.0369649 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  35.23 
 
 		 402 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  34.96 
 
 		 411 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23430  Aminotransferase, class I and II  36.04 
 
 		 414 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  34.48 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  34.96 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0168  aminotransferase class I and II  32.3 
 
 		 403 aa  240  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.391722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>