More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1277 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 
390 aa  810    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  67.18 
 
 
391 aa  575  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.81 
 
 
385 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  52.63 
 
 
388 aa  444  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.07 
 
 
392 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.57 
 
 
390 aa  434  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  50.51 
 
 
389 aa  432  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.34 
 
 
388 aa  429  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  53.28 
 
 
401 aa  429  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  51.7 
 
 
390 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.05 
 
 
391 aa  421  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.48 
 
 
387 aa  424  1e-117  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.03 
 
 
388 aa  423  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.18 
 
 
385 aa  419  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  51.81 
 
 
384 aa  421  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  50.79 
 
 
382 aa  412  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  49.48 
 
 
403 aa  408  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  52.11 
 
 
382 aa  408  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  51.18 
 
 
382 aa  411  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  50.13 
 
 
388 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  49.74 
 
 
389 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  48.45 
 
 
400 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  50.39 
 
 
382 aa  396  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  48.7 
 
 
402 aa  397  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.37 
 
 
392 aa  395  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  48.29 
 
 
388 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  47.38 
 
 
386 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  46.63 
 
 
392 aa  385  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  46.89 
 
 
391 aa  381  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  48.71 
 
 
387 aa  383  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  47.67 
 
 
384 aa  378  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  46.89 
 
 
394 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  46.63 
 
 
394 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  43.38 
 
 
389 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  43.27 
 
 
392 aa  363  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  43.31 
 
 
388 aa  361  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  44.33 
 
 
389 aa  358  7e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  41.56 
 
 
390 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  42.15 
 
 
392 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  43.09 
 
 
396 aa  342  5e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  40.47 
 
 
395 aa  342  7e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  41.62 
 
 
392 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  41.62 
 
 
392 aa  341  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  41.62 
 
 
392 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  41.62 
 
 
392 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  41.36 
 
 
392 aa  341  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  41.36 
 
 
392 aa  339  4e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  41.76 
 
 
392 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  41.49 
 
 
392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  41.76 
 
 
406 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  39.27 
 
 
391 aa  334  2e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  40.48 
 
 
394 aa  332  8e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  40.41 
 
 
421 aa  332  8e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1923  aminotransferase  40.93 
 
 
405 aa  331  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351936  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1916  aminotransferase  41.21 
 
 
407 aa  329  6e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  41.21 
 
 
406 aa  328  8e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  41.21 
 
 
406 aa  328  8e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  42.52 
 
 
392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  39.79 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  42.63 
 
 
393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3869  succinyldiaminopimelate transaminase  41.86 
 
 
392 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  40.42 
 
 
409 aa  325  6e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0911  class I/II aminotransferase  40.92 
 
 
400 aa  324  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.638659  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  41.56 
 
 
388 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3918  succinyldiaminopimelate transaminase  41.09 
 
 
392 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000686397  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  41.3 
 
 
395 aa  322  5e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  38.32 
 
 
390 aa  322  8e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0082  aminotransferase  39.63 
 
 
428 aa  322  9.000000000000001e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0510162 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1252  aminotransferase  40.47 
 
 
396 aa  321  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000164192  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  40.68 
 
 
399 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1299  aminotransferase  39.63 
 
 
403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  39.11 
 
 
394 aa  319  5e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2505  aminotransferase  39.79 
 
 
407 aa  318  7.999999999999999e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784571  normal  0.124527 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  38.7 
 
 
399 aa  317  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  38.96 
 
 
400 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2278  aminotransferase  38.86 
 
 
405 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874685  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1394  aminotransferase class I and II  40 
 
 
408 aa  317  2e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0598  aminotransferase  39.28 
 
 
394 aa  317  3e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  39.22 
 
 
399 aa  317  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  38.96 
 
 
400 aa  316  4e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0159  succinyldiaminopimelate transaminase  39.21 
 
 
407 aa  316  4e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.899498  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2899  aspartate aminotransferase  38.96 
 
 
399 aa  316  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  38.58 
 
 
403 aa  316  4e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0944  succinyldiaminopimelate transaminase  39.22 
 
 
390 aa  316  4e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.989177  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  39.15 
 
 
393 aa  316  5e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1544  aminotransferase  39.12 
 
 
405 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553471  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  38.44 
 
 
399 aa  315  6e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  40.73 
 
 
425 aa  315  6e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5101  succinyldiaminopimelate transaminase  40.89 
 
 
390 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.26447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0864  aminotransferase  41.21 
 
 
402 aa  315  8e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.565347  normal  0.675575 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  38.7 
 
 
399 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0840  aminotransferase  39.42 
 
 
402 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450019  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  38.96 
 
 
399 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  39.42 
 
 
402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  39.22 
 
 
399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  38.44 
 
 
400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5073  aminotransferase  40.42 
 
 
409 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2411  aminotransferase  40.42 
 
 
413 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.306249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  38.18 
 
 
399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  38.6 
 
 
393 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>