More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0487 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 391 aa  808    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  67.18 
 
 		 390 aa  561  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.05 
 
 		 385 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  49.49 
 
 		 389 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  47.51 
 
 		 388 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  49.34 
 
 		 385 aa  401  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 		 401 aa  400  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  49.22 
 
 		 384 aa  396  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  49.22 
 
 		 390 aa  395  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  47.64 
 
 		 382 aa  395  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  48.56 
 
 		 382 aa  394  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  47.79 
 
 		 388 aa  389  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  45.95 
 
 		 392 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  46.74 
 
 		 391 aa  391  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  48.04 
 
 		 388 aa  390  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  48.7 
 
 		 387 aa  389  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  47.26 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  46.88 
 
 		 388 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  46.25 
 
 		 389 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  44.7 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  43.93 
 
 		 403 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  45.81 
 
 		 382 aa  374  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  46.21 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  44.19 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  48.56 
 
 		 392 aa  371  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  43.93 
 
 		 402 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  44.24 
 
 		 388 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  46.51 
 
 		 384 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  42.38 
 
 		 389 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  42.12 
 
 		 391 aa  352  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  43.81 
 
 		 387 aa  350  3e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  42.89 
 
 		 394 aa  349  6e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  43.6 
 
 		 386 aa  348  9e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  42.64 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  43.19 
 
 		 389 aa  346  4e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  41.1 
 
 		 392 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  42.15 
 
 		 388 aa  340  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  43.25 
 
 		 392 aa  329  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  43.25 
 
 		 392 aa  328  8e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  42.42 
 
 		 392 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  42.42 
 
 		 392 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  42.42 
 
 		 392 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  42.42 
 
 		 392 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  42.7 
 
 		 392 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  42.7 
 
 		 392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  42.15 
 
 		 392 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  41.87 
 
 		 390 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  42.15 
 
 		 406 aa  318  7e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  43.25 
 
 		 396 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  42.08 
 
 		 393 aa  318  1e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  39.84 
 
 		 392 aa  312  5.999999999999999e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  40.93 
 
 		 395 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1923  aminotransferase  39.02 
 
 		 405 aa  310  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351936  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  39.79 
 
 		 421 aa  310  4e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  36.29 
 
 		 391 aa  309  6.999999999999999e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  40.31 
 
 		 409 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  37.17 
 
 		 395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  40.84 
 
 		 425 aa  308  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2505  aminotransferase  40.58 
 
 		 407 aa  305  9.000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784571  normal  0.124527 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1916  aminotransferase  39.27 
 
 		 407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  39.01 
 
 		 406 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  39.01 
 
 		 406 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1299  aminotransferase  39.01 
 
 		 403 aa  301  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2411  aminotransferase  40.58 
 
 		 413 aa  300  4e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.306249  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  37.7 
 
 		 393 aa  299  7e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2278  aminotransferase  38.5 
 
 		 405 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874685  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3869  succinyldiaminopimelate transaminase  39.69 
 
 		 392 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1454  aminotransferase  37.47 
 
 		 405 aa  296  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  hitchhiker  0.000434542 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  37.85 
 
 		 394 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1267  aspartate aminotransferase  38.58 
 
 		 404 aa  296  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  36.91 
 
 		 394 aa  296  5e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3918  succinyldiaminopimelate transaminase  39.43 
 
 		 392 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000686397  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1544  aminotransferase  37.73 
 
 		 405 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  38.74 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5101  succinyldiaminopimelate transaminase  37.92 
 
 		 390 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.26447 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  37.56 
 
 		 399 aa  294  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5806  aminotransferase  38.38 
 
 		 406 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.658046  decreased coverage  0.00092388 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  37.17 
 
 		 397 aa  294  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  38.6 
 
 		 388 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1252  aminotransferase  37.76 
 
 		 396 aa  292  6e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000164192  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  39.27 
 
 		 397 aa  291  9e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1738  aminotransferase  37.47 
 
 		 405 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.990718  normal  0.152146 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0018  transaminase  39.18 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6029  aminotransferase  38.4 
 
 		 406 aa  291  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0777497  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  39.27 
 
 		 397 aa  290  3e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0911  class I/II aminotransferase  37.24 
 
 		 400 aa  290  3e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.638659  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  38.22 
 
 		 411 aa  290  3e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5073  aminotransferase  37.7 
 
 		 409 aa  290  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1027  aspartate aminotransferase  38.05 
 
 		 400 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000262896  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0957  aspartate aminotransferase  37.56 
 
 		 404 aa  289  7e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000423208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0292  aminotransferase class I and II  36.67 
 
 		 391 aa  288  8e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1308  aspartate aminotransferase  37.53 
 
 		 400 aa  288  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.698251  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1106  aspartate aminotransferase  37.79 
 
 		 411 aa  288  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.584654 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1394  aminotransferase class I and II  37.82 
 
 		 408 aa  288  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0598  aminotransferase  37.11 
 
 		 394 aa  288  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3016  aminotransferase  38.74 
 
 		 406 aa  287  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562115  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1263  aspartate aminotransferase  37.53 
 
 		 425 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2310  aminotransferase  37.5 
 
 		 405 aa  286  5.999999999999999e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  36.91 
 
 		 394 aa  285  7e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  37.43 
 
 		 412 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>