More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1080 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  100 
 
 
401 aa  811    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.9 
 
 
391 aa  455  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  53.83 
 
 
382 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  55.56 
 
 
390 aa  444  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.14 
 
 
389 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.11 
 
 
392 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.07 
 
 
385 aa  434  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  55 
 
 
382 aa  433  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  54.47 
 
 
384 aa  433  1e-120  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  51.59 
 
 
382 aa  429  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.18 
 
 
385 aa  424  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.04 
 
 
388 aa  416  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.86 
 
 
390 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  50.92 
 
 
382 aa  412  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  48.69 
 
 
388 aa  413  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  50.78 
 
 
388 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.29 
 
 
392 aa  409  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  50 
 
 
390 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.85 
 
 
387 aa  402  1e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  50.26 
 
 
391 aa  400  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.04 
 
 
388 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  50.39 
 
 
389 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  46.23 
 
 
392 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  49.74 
 
 
388 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  46.23 
 
 
386 aa  382  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  47.78 
 
 
403 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  47.53 
 
 
389 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  47 
 
 
402 aa  371  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  44.24 
 
 
400 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  47.53 
 
 
384 aa  366  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  45.85 
 
 
389 aa  363  4e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  47.15 
 
 
387 aa  362  6e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  44.65 
 
 
392 aa  360  2e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  45.17 
 
 
391 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  44.13 
 
 
394 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  43.86 
 
 
394 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1923  aminotransferase  42.6 
 
 
405 aa  339  5e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351936  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2278  aminotransferase  42.53 
 
 
405 aa  339  5.9999999999999996e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874685  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  43.65 
 
 
390 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  43.01 
 
 
409 aa  338  8e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  40.21 
 
 
395 aa  338  9e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  41.9 
 
 
393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  43.52 
 
 
397 aa  336  3.9999999999999995e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  42.56 
 
 
388 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  43.26 
 
 
397 aa  333  3e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1454  aminotransferase  42.01 
 
 
405 aa  333  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  hitchhiker  0.000434542 
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  41.22 
 
 
406 aa  330  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1544  aminotransferase  41.49 
 
 
405 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553471  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1916  aminotransferase  41.48 
 
 
407 aa  330  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  41.22 
 
 
406 aa  330  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  41.86 
 
 
400 aa  329  7e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  41.98 
 
 
399 aa  328  8e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1738  aminotransferase  41.24 
 
 
405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.990718  normal  0.152146 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1252  aminotransferase  41.07 
 
 
396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000164192  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  42.71 
 
 
421 aa  327  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5431  aminotransferase  40 
 
 
411 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  43.9 
 
 
392 aa  326  4.0000000000000003e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  40 
 
 
411 aa  325  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1394  aminotransferase class I and II  41.13 
 
 
408 aa  325  6e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  40.15 
 
 
402 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  40 
 
 
412 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  40 
 
 
412 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  40 
 
 
412 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  40 
 
 
412 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  40 
 
 
412 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  39.79 
 
 
391 aa  324  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  40.26 
 
 
403 aa  324  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2411  aminotransferase  42.04 
 
 
413 aa  322  6e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.306249  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  39.74 
 
 
412 aa  322  7e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  39.74 
 
 
412 aa  322  7e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  39.74 
 
 
412 aa  322  7e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  39.49 
 
 
411 aa  322  7e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  39.74 
 
 
412 aa  322  7e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  39.74 
 
 
412 aa  322  7e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  39.74 
 
 
412 aa  322  7e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  39.74 
 
 
411 aa  322  8e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1334  aminotransferase  39.74 
 
 
411 aa  322  8e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  39.74 
 
 
411 aa  322  8e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  39.74 
 
 
411 aa  322  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  39.74 
 
 
412 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  41.62 
 
 
392 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1823  aminotransferase  40.82 
 
 
407 aa  322  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  39.74 
 
 
412 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  42.67 
 
 
392 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  37.24 
 
 
390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  38.99 
 
 
402 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  43.73 
 
 
395 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  41.62 
 
 
392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  41.62 
 
 
392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  41.62 
 
 
392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  41.62 
 
 
392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  39.74 
 
 
412 aa  320  3e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  39.69 
 
 
393 aa  320  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4201  aminotransferase  40.77 
 
 
405 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2505  aminotransferase  41.18 
 
 
407 aa  320  3e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784571  normal  0.124527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2583  aminotransferase  38.94 
 
 
409 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117889  normal  0.0369649 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0292  aminotransferase class I and II  38.82 
 
 
391 aa  319  5e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1407  aminotransferase  39.23 
 
 
413 aa  319  5e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  41.36 
 
 
392 aa  319  6e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  39.49 
 
 
411 aa  319  6e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>