More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0516 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0516  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
381 aa  787    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.883743  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07380  aminotransferase  59.04 
 
 
385 aa  485  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1938  aminotransferase class I and II  55.41 
 
 
388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0765  aminotransferase  54.31 
 
 
391 aa  437  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3140  aminotransferase class I and II  52.36 
 
 
385 aa  411  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3792  aminotransferase class I and II  53.05 
 
 
381 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6544  aminotransferase class I and II  49.61 
 
 
403 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  41.91 
 
 
387 aa  324  1e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  40.9 
 
 
390 aa  318  1e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.37 
 
 
388 aa  317  3e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.84 
 
 
388 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.05 
 
 
389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  40.21 
 
 
384 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.32 
 
 
388 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  39.63 
 
 
386 aa  295  8e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.99 
 
 
389 aa  291  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.06 
 
 
388 aa  289  6e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.36 
 
 
385 aa  288  1e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.3 
 
 
392 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  38.1 
 
 
382 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.15 
 
 
385 aa  286  4e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  38.12 
 
 
392 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  36.51 
 
 
382 aa  286  5e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  39.36 
 
 
389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.42 
 
 
391 aa  282  6.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  37.08 
 
 
402 aa  282  7.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  37.73 
 
 
387 aa  281  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  37.34 
 
 
392 aa  279  5e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.58 
 
 
390 aa  278  9e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  37.08 
 
 
391 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  36.58 
 
 
382 aa  276  6e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  37.43 
 
 
401 aa  273  3e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  36.39 
 
 
403 aa  273  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  35.45 
 
 
391 aa  273  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  35.98 
 
 
388 aa  273  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  37.04 
 
 
382 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  36.51 
 
 
389 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  37.3 
 
 
388 aa  269  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  36.91 
 
 
384 aa  268  1e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  35.53 
 
 
388 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.13 
 
 
391 aa  265  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  35.6 
 
 
400 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  35.51 
 
 
394 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  36 
 
 
390 aa  259  6e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.15 
 
 
390 aa  259  7e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  34.74 
 
 
402 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3918  succinyldiaminopimelate transaminase  33.95 
 
 
392 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000686397  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  34.3 
 
 
399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  34.74 
 
 
402 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3869  succinyldiaminopimelate transaminase  34.47 
 
 
392 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.94 
 
 
392 aa  252  6e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  35.05 
 
 
392 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  35.05 
 
 
392 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  35.05 
 
 
392 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  35.05 
 
 
392 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  34.47 
 
 
402 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  34.51 
 
 
392 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  34.78 
 
 
392 aa  250  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  34.78 
 
 
406 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  34.56 
 
 
399 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  34.04 
 
 
399 aa  251  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  34.13 
 
 
396 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  33.24 
 
 
402 aa  250  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0911  class I/II aminotransferase  35.92 
 
 
400 aa  249  4e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.638659  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  33.51 
 
 
402 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  33.51 
 
 
399 aa  250  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2583  aminotransferase  33.51 
 
 
409 aa  250  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117889  normal  0.0369649 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  35.96 
 
 
395 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  34.3 
 
 
399 aa  249  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  34.51 
 
 
392 aa  249  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  34.51 
 
 
392 aa  249  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23430  Aminotransferase, class I and II  34.04 
 
 
414 aa  249  6e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0840  aminotransferase  34.47 
 
 
402 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450019  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  34.04 
 
 
400 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0159  succinyldiaminopimelate transaminase  33.59 
 
 
407 aa  248  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.899498  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  35.84 
 
 
394 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  33.86 
 
 
411 aa  248  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  33.95 
 
 
407 aa  247  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1334  aminotransferase  33.86 
 
 
411 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  35.58 
 
 
394 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  33.86 
 
 
411 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  33.68 
 
 
402 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0567  aminotransferase class I and II  34.91 
 
 
403 aa  246  3e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  34.51 
 
 
392 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  33.78 
 
 
412 aa  247  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  33.77 
 
 
400 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1407  aminotransferase  33.24 
 
 
413 aa  246  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  33.77 
 
 
400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2899  aspartate aminotransferase  33.77 
 
 
399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  32.89 
 
 
411 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  33.77 
 
 
399 aa  245  8e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246294 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 
390 aa  245  9e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5431  aminotransferase  32.89 
 
 
411 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  32.98 
 
 
411 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5101  succinyldiaminopimelate transaminase  32.98 
 
 
390 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.26447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0864  aminotransferase  35.11 
 
 
402 aa  245  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.565347  normal  0.675575 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  33.51 
 
 
412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  33.51 
 
 
412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  33.51 
 
 
412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  35.4 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>