More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2060 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2060  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 405 aa  815    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255815  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3082  aspartate aminotransferase  93.1 
 
 		 406 aa  750    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.180666  normal  0.410031 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3437  aspartate aminotransferase  92.36 
 
 		 406 aa  751    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3422  aspartate aminotransferase  77.32 
 
 		 410 aa  642    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9152  aspartate aminotransferase  68.81 
 
 		 409 aa  555  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1393  aminotransferase class I and II  30.79 
 
 		 373 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  25.68 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  26.87 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  25.89 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  23.72 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  29.82 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0627  aminotransferase class I and II  27.81 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  28.74 
 
 		 385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  28.24 
 
 		 395 aa  116  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  26.22 
 
 		 400 aa  116  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  29.82 
 
 		 386 aa  116  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0901  putative aminotransferase  27.32 
 
 		 382 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  26.98 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  25.71 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  27.75 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  26.49 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  24.85 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  24.85 
 
 		 375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  29.1 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  26.69 
 
 		 396 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  26.69 
 
 		 396 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  26.69 
 
 		 396 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  26.69 
 
 		 396 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  26.39 
 
 		 396 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  26.39 
 
 		 396 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  25.07 
 
 		 390 aa  113  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  27.15 
 
 		 399 aa  113  6e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  29.17 
 
 		 367 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  24.15 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  27.89 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  26.98 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  26.39 
 
 		 396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  27.56 
 
 		 393 aa  111  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  27.69 
 
 		 399 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  26.4 
 
 		 397 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  26.2 
 
 		 389 aa  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  29.36 
 
 		 393 aa  109  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  25.14 
 
 		 402 aa  109  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0858  putative aminotransferase  27.32 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2213  aminotransferase, class I and II  25.25 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0888  putative aminotransferase  27.32 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.533677 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  26.1 
 
 		 396 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4320  putative aminotransferase  26.78 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  27.19 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  25.81 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  27.93 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  27.01 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  26.08 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2022  aspartate aminotransferase  28.81 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  26.62 
 
 		 394 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1235  aminotransferase class I and II  25.14 
 
 		 393 aa  107  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  27.98 
 
 		 404 aa  106  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2905  L-aspartate aminotransferase  25.63 
 
 		 395 aa  106  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  28.15 
 
 		 405 aa  106  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  27.03 
 
 		 395 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  27.03 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  26.27 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1502  aminotransferase class I and II  27.12 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000290558  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  25.32 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  26.74 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  26.74 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  26.74 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  26.74 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  26.74 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  26.74 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  23.66 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07471  aminotransferases class-I  24.77 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.503554  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  29.08 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1983  aminotransferase class I and II  28.92 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  25.9 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  26.32 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  25.68 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  22.75 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  25.15 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  29.5 
 
 		 393 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0994  aminotransferase  28.36 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.462278 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  26.47 
 
 		 389 aa  103  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  26.51 
 
 		 379 aa  103  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  26.75 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0877  aminotransferase  27.19 
 
 		 417 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.706864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  29.05 
 
 		 400 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  25.88 
 
 		 392 aa  103  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  27.69 
 
 		 400 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  22.12 
 
 		 375 aa  103  8e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1729  aminotransferase  25.89 
 
 		 385 aa  103  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118879  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  29.59 
 
 		 386 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  28.44 
 
 		 393 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5434  aminotransferase class I and II  27.65 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  24.16 
 
 		 388 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  28.4 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  25.45 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1623  aspartate aminotransferase  29.63 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.399039  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  26.45 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  26.54 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  27.15 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>