More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1021 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  100 
 
 
386 aa  780    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  60.97 
 
 
409 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  56.85 
 
 
393 aa  448  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  48.31 
 
 
391 aa  368  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  45.36 
 
 
393 aa  363  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  43.96 
 
 
393 aa  362  7.0000000000000005e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  43.96 
 
 
393 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  44.22 
 
 
393 aa  361  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  41.49 
 
 
390 aa  347  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  42.78 
 
 
401 aa  346  3e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  42.34 
 
 
386 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  44.65 
 
 
386 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  46.41 
 
 
398 aa  338  9.999999999999999e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  40.21 
 
 
393 aa  338  9.999999999999999e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  44.59 
 
 
400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  38.8 
 
 
383 aa  331  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  39.05 
 
 
383 aa  330  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  38.52 
 
 
383 aa  330  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  38.52 
 
 
383 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  38.52 
 
 
383 aa  328  9e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  38.26 
 
 
383 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  38.26 
 
 
383 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  41.24 
 
 
394 aa  325  6e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  38.26 
 
 
383 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  38.52 
 
 
383 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  38.26 
 
 
383 aa  324  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  38.26 
 
 
383 aa  323  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  40.46 
 
 
391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  42.78 
 
 
372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  40.46 
 
 
397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  43.81 
 
 
391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  40.21 
 
 
521 aa  307  2.0000000000000002e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  40.98 
 
 
394 aa  305  7e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  38.18 
 
 
386 aa  299  6e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  41.54 
 
 
392 aa  295  7e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  42.26 
 
 
393 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  38.82 
 
 
395 aa  294  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  36.18 
 
 
389 aa  293  2e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  41.82 
 
 
390 aa  293  3e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  38.24 
 
 
392 aa  292  6e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  40.91 
 
 
396 aa  290  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  42.09 
 
 
392 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  42.09 
 
 
385 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  38.32 
 
 
397 aa  287  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  41.51 
 
 
385 aa  288  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  40.67 
 
 
385 aa  285  8e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  40.67 
 
 
385 aa  285  8e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  38.4 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  36.32 
 
 
397 aa  283  4.0000000000000003e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  37.63 
 
 
383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  39.02 
 
 
412 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  40.55 
 
 
405 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  38.72 
 
 
393 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  38.42 
 
 
396 aa  273  3e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0648  aminotransferase, class I and II  41.39 
 
 
394 aa  273  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756968  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  37.92 
 
 
394 aa  271  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  37.24 
 
 
392 aa  270  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  37.24 
 
 
392 aa  270  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0147  aminotransferase, class I and II  41.37 
 
 
390 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.9689 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  40.31 
 
 
390 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  40.05 
 
 
390 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  39.13 
 
 
390 aa  265  8.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  41.6 
 
 
383 aa  264  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0327  aminotransferase, class II  33.68 
 
 
388 aa  264  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0342316  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0264  aminotransferase class I and II  35.94 
 
 
399 aa  263  3e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000105319  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  40.15 
 
 
387 aa  261  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  39.33 
 
 
381 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  35.99 
 
 
390 aa  261  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  39.13 
 
 
390 aa  260  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  34.46 
 
 
390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  40.56 
 
 
385 aa  256  5e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1669  aminotransferase class I and II  38.22 
 
 
400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  36.69 
 
 
389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1786  aminotransferase  38.22 
 
 
400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2106  aminotransferase class I and II  36.91 
 
 
400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  41.77 
 
 
386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1001  aminotransferase, class II  32.39 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000156908  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1671  aminotransferase class I and II  37.96 
 
 
400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.505152  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1734  aminotransferase class I and II  37.96 
 
 
400 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.550482  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  39.32 
 
 
399 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1608  aminotransferase class I and II  37.96 
 
 
400 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  37.82 
 
 
384 aa  246  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  34.82 
 
 
387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  35.49 
 
 
379 aa  243  5e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  33.68 
 
 
393 aa  242  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4437  aminotransferase class I and II  36.91 
 
 
402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3426  aminotransferase class I and II  37.16 
 
 
402 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1912  aminotransferase, class I and II  33.59 
 
 
386 aa  239  6.999999999999999e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4900  aminotransferase, class I and II  36.41 
 
 
402 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  34.75 
 
 
387 aa  236  4e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3263  aminotransferase, class I and II  36.41 
 
 
402 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0613421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  36.99 
 
 
395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1786  aminotransferase class I and II  37.4 
 
 
386 aa  235  8e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  33.07 
 
 
390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6907  aminotransferase, class I and II  36.16 
 
 
402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  33.89 
 
 
389 aa  233  6e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2960  aminotransferase, classes I and II  32.64 
 
 
391 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01594  Aminotransferase, class I and II  34.58 
 
 
391 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2643  aminotransferase, class I and II  37.36 
 
 
514 aa  230  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  37.24 
 
 
383 aa  229  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.232198 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>