More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1487 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1487  valine--pyruvate transaminase  100 
 
 		 424 aa  873    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.41369 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2635  valine--pyruvate transaminase  44.55 
 
 		 416 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1771  valine--pyruvate transaminase  44.81 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3063  valine--pyruvate transaminase  44.21 
 
 		 420 aa  388  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0126603 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1586  valine--pyruvate transaminase  44.29 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2500  valine--pyruvate transaminase  43.5 
 
 		 418 aa  382  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0943  valine--pyruvate transaminase  43.9 
 
 		 425 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.784655  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00447  valine--pyruvate transaminase  42.86 
 
 		 417 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002002  valine--pyruvate aminotransferase  41.94 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2963  valine--pyruvate transaminase  41.94 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1678  aminotransferase class I and II  44.68 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3725  valine--pyruvate transaminase  42.22 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0014  valine--pyruvate transaminase  41.75 
 
 		 456 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03424  valine-pyruvate transaminase  41.37 
 
 		 417 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0138  aminotransferase class I and II  41.37 
 
 		 417 aa  347  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3775  valine--pyruvate transaminase  41.37 
 
 		 417 aa  347  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3950  valine--pyruvate transaminase  41.37 
 
 		 417 aa  347  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0142  valine--pyruvate transaminase  41.37 
 
 		 417 aa  347  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03375  hypothetical protein  41.37 
 
 		 417 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0062  valine--pyruvate transaminase  42.52 
 
 		 417 aa  347  3e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3895  valine--pyruvate transaminase  40.9 
 
 		 417 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0055  valine--pyruvate transaminase  42 
 
 		 416 aa  345  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0035  valine--pyruvate transaminase  42.24 
 
 		 418 aa  344  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4948  valine--pyruvate transaminase  41.13 
 
 		 417 aa  344  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.458288 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0089  valine--pyruvate transaminase  42.24 
 
 		 434 aa  343  2e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4140  valine--pyruvate transaminase  41.37 
 
 		 421 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4069  valine--pyruvate transaminase  41.13 
 
 		 417 aa  344  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0149  valine--pyruvate transaminase  41.13 
 
 		 416 aa  342  5e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0053  valine--pyruvate transaminase  42.32 
 
 		 440 aa  341  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.100706 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0050  valine--pyruvate transaminase  41.18 
 
 		 417 aa  338  8e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3988  valine--pyruvate transaminase  41.43 
 
 		 416 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3943  valine--pyruvate transaminase  41.43 
 
 		 416 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.796758 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3863  valine--pyruvate transaminase  41.43 
 
 		 416 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3879  valine--pyruvate transaminase  41.19 
 
 		 416 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4049  valine--pyruvate transaminase  41.19 
 
 		 416 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.714309 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2118  valine--pyruvate transaminase  40.62 
 
 		 443 aa  331  2e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2440  valine--pyruvate transaminase  40.86 
 
 		 444 aa  330  4e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3792  valine--pyruvate transaminase  41.83 
 
 		 402 aa  327  3e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0903  valine--pyruvate transaminase  39.05 
 
 		 421 aa  309  8e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.176446  decreased coverage  0.0000000925124 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4228  valine--pyruvate transaminase  36.9 
 
 		 419 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420595 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0165  class I/II aminotransferase  36.17 
 
 		 427 aa  293  6e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0914098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1090  valine--pyruvate transaminase  36.17 
 
 		 427 aa  290  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.294762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2258  valine--pyruvate transaminase  34.66 
 
 		 427 aa  283  3.0000000000000004e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.782201  normal  0.105483 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3688  valine--pyruvate transaminase  36.06 
 
 		 421 aa  277  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  24.38 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0356  GntR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 520 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.716166  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0347  GntR family transcriptional regulator  22.59 
 
 		 519 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  25.24 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1646  aspartate aminotransferase  29.29 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4380  GntR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  25.45 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  25.82 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  22.55 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1870  GntR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1664  aminotransferase, class I and II  25.82 
 
 		 403 aa  76.3  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  24.28 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 482 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 477 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 482 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  23.63 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 482 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1904  aminotransferase, class I and II  23.96 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  24.44 
 
 		 493 aa  74.3  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  24.78 
 
 		 482 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1987  GntR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.675546  hitchhiker  0.00431824 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 482 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  25.22 
 
 		 482 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  24.07 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6053  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.33 
 
 		 472 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  25.32 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  25.15 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  25 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0099  aminotransferase class I and II  23.7 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0095  GntR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  26.15 
 
 		 407 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  24.35 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  28.12 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1136  aspartate aminotransferase  26.69 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.358682  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 450 aa  72  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0994  aspartate aminotransferase  26.69 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  22.61 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1049  putative GntR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  26.11 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5148  GntR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  24.12 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  25.85 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  20.46 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  23.91 
 
 		 482 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00190  aminotransferase, putative  23.62 
 
 		 460 aa  69.3  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00967249  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  22.08 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  23.9 
 
 		 392 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  23.9 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  24.79 
 
 		 406 aa  69.7  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1479  aminotransferase  25.73 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  22.83 
 
 		 383 aa  69.7  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>