More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4228 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_0165  class I/II aminotransferase  70.31 
 
 		 427 aa  637    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0914098  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4228  valine--pyruvate transaminase  100 
 
 		 419 aa  861    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1090  valine--pyruvate transaminase  72.45 
 
 		 427 aa  655    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.294762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3688  valine--pyruvate transaminase  67.38 
 
 		 421 aa  619  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2258  valine--pyruvate transaminase  66.03 
 
 		 427 aa  586  1e-166  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.782201  normal  0.105483 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2500  valine--pyruvate transaminase  39.86 
 
 		 418 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0035  valine--pyruvate transaminase  39.18 
 
 		 418 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2635  valine--pyruvate transaminase  40.67 
 
 		 416 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1586  valine--pyruvate transaminase  39.04 
 
 		 419 aa  319  6e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1771  valine--pyruvate transaminase  38.85 
 
 		 424 aa  319  6e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0050  valine--pyruvate transaminase  39.42 
 
 		 417 aa  318  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0943  valine--pyruvate transaminase  39.33 
 
 		 425 aa  317  3e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.784655  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00447  valine--pyruvate transaminase  39.28 
 
 		 417 aa  316  5e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002002  valine--pyruvate aminotransferase  39.04 
 
 		 417 aa  312  7.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0055  valine--pyruvate transaminase  38.94 
 
 		 416 aa  309  6.999999999999999e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0062  valine--pyruvate transaminase  38.5 
 
 		 417 aa  308  9e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0149  valine--pyruvate transaminase  38.44 
 
 		 416 aa  306  4.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4140  valine--pyruvate transaminase  38.31 
 
 		 421 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0014  valine--pyruvate transaminase  38.07 
 
 		 456 aa  306  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3895  valine--pyruvate transaminase  38.69 
 
 		 417 aa  306  6e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03424  valine-pyruvate transaminase  38.44 
 
 		 417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0138  aminotransferase class I and II  38.44 
 
 		 417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3950  valine--pyruvate transaminase  38.44 
 
 		 417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4069  valine--pyruvate transaminase  38.44 
 
 		 417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4948  valine--pyruvate transaminase  38.44 
 
 		 417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.458288 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3775  valine--pyruvate transaminase  38.44 
 
 		 417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0142  valine--pyruvate transaminase  38.44 
 
 		 417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03375  hypothetical protein  38.44 
 
 		 417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3063  valine--pyruvate transaminase  38.19 
 
 		 420 aa  302  9e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0126603 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2963  valine--pyruvate transaminase  37.71 
 
 		 415 aa  301  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3725  valine--pyruvate transaminase  36.6 
 
 		 417 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2118  valine--pyruvate transaminase  37.33 
 
 		 443 aa  293  3e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0053  valine--pyruvate transaminase  37.74 
 
 		 440 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.100706 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2440  valine--pyruvate transaminase  36.84 
 
 		 444 aa  293  3e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1487  valine--pyruvate transaminase  36.9 
 
 		 424 aa  293  4e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.41369 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3988  valine--pyruvate transaminase  37.26 
 
 		 416 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3943  valine--pyruvate transaminase  37.26 
 
 		 416 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.796758 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3863  valine--pyruvate transaminase  37.26 
 
 		 416 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3792  valine--pyruvate transaminase  38.94 
 
 		 402 aa  290  4e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3879  valine--pyruvate transaminase  37.02 
 
 		 416 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4049  valine--pyruvate transaminase  37.02 
 
 		 416 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.714309 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1678  aminotransferase class I and II  35.39 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0089  valine--pyruvate transaminase  37.01 
 
 		 434 aa  276  5e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0903  valine--pyruvate transaminase  36.54 
 
 		 421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.176446  decreased coverage  0.0000000925124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  30.61 
 
 		 393 aa  99.8  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 395 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  28.79 
 
 		 393 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 393 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  28.79 
 
 		 393 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 398 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 393 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  29.05 
 
 		 393 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  29.1 
 
 		 398 aa  96.7  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  28.1 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 393 aa  94.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3605  aminotransferase  27.55 
 
 		 395 aa  94  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  28.5 
 
 		 393 aa  92.8  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 408 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  21.61 
 
 		 400 aa  92  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  25.11 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  24.68 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07271  aminotransferases class-I  24.49 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.232753  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  28.24 
 
 		 393 aa  88.6  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  25.7 
 
 		 410 aa  87.8  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  25.7 
 
 		 410 aa  87.4  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  24.42 
 
 		 405 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  28.5 
 
 		 393 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  28.5 
 
 		 393 aa  86.7  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  28.5 
 
 		 393 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  28.5 
 
 		 393 aa  86.7  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  28.5 
 
 		 393 aa  86.7  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  28.5 
 
 		 393 aa  86.7  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07291  aminotransferases class-I  24.49 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.122313  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  23.31 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  22.38 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  24.41 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 482 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 482 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  25.36 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3278  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  26.5 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  24.69 
 
 		 482 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  24 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 482 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  24.12 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1088  aminotransferase class I and II  24.94 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.226699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  26.5 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 482 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 482 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  24.92 
 
 		 482 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>