More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0014 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03424  valine-pyruvate transaminase  79.33 
 
 		 417 aa  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0138  aminotransferase class I and II  79.09 
 
 		 417 aa  701    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0062  valine--pyruvate transaminase  82.57 
 
 		 417 aa  738    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3950  valine--pyruvate transaminase  79.33 
 
 		 417 aa  702    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0149  valine--pyruvate transaminase  80.24 
 
 		 416 aa  710    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3895  valine--pyruvate transaminase  79.33 
 
 		 417 aa  702    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4948  valine--pyruvate transaminase  79.09 
 
 		 417 aa  699    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.458288 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0014  valine--pyruvate transaminase  100 
 
 		 456 aa  943    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0142  valine--pyruvate transaminase  79.33 
 
 		 417 aa  702    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4140  valine--pyruvate transaminase  99.52 
 
 		 421 aa  865    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3775  valine--pyruvate transaminase  79.33 
 
 		 417 aa  702    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0035  valine--pyruvate transaminase  79.09 
 
 		 418 aa  715    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4049  valine--pyruvate transaminase  79.57 
 
 		 416 aa  693    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.714309 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4069  valine--pyruvate transaminase  79.09 
 
 		 417 aa  699    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0050  valine--pyruvate transaminase  79.62 
 
 		 417 aa  705    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0055  valine--pyruvate transaminase  82.21 
 
 		 416 aa  737    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3988  valine--pyruvate transaminase  80.05 
 
 		 416 aa  696    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3943  valine--pyruvate transaminase  79.81 
 
 		 416 aa  695    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.796758 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03375  hypothetical protein  79.33 
 
 		 417 aa  702    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3792  valine--pyruvate transaminase  99.5 
 
 		 402 aa  827    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0053  valine--pyruvate transaminase  86.07 
 
 		 440 aa  768    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.100706 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3863  valine--pyruvate transaminase  79.81 
 
 		 416 aa  695    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3879  valine--pyruvate transaminase  79.57 
 
 		 416 aa  694    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00447  valine--pyruvate transaminase  64.03 
 
 		 417 aa  586  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002002  valine--pyruvate aminotransferase  64.03 
 
 		 417 aa  586  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2963  valine--pyruvate transaminase  64.34 
 
 		 415 aa  579  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2500  valine--pyruvate transaminase  62.59 
 
 		 418 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3063  valine--pyruvate transaminase  63.07 
 
 		 420 aa  565  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0126603 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1586  valine--pyruvate transaminase  63.68 
 
 		 419 aa  566  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2635  valine--pyruvate transaminase  62.17 
 
 		 416 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3725  valine--pyruvate transaminase  55.31 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0943  valine--pyruvate transaminase  50.71 
 
 		 425 aa  455  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.784655  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1771  valine--pyruvate transaminase  47.63 
 
 		 424 aa  421  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2440  valine--pyruvate transaminase  45.68 
 
 		 444 aa  396  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0089  valine--pyruvate transaminase  44.37 
 
 		 434 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2118  valine--pyruvate transaminase  44.32 
 
 		 443 aa  383  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1678  aminotransferase class I and II  44.84 
 
 		 426 aa  373  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1487  valine--pyruvate transaminase  41.75 
 
 		 424 aa  348  2e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.41369 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0903  valine--pyruvate transaminase  40.58 
 
 		 421 aa  335  9e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.176446  decreased coverage  0.0000000925124 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2258  valine--pyruvate transaminase  38.26 
 
 		 427 aa  315  9e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.782201  normal  0.105483 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1090  valine--pyruvate transaminase  37.68 
 
 		 427 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.294762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4228  valine--pyruvate transaminase  38.07 
 
 		 419 aa  306  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420595 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0165  class I/II aminotransferase  37.26 
 
 		 427 aa  301  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0914098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3688  valine--pyruvate transaminase  36.3 
 
 		 421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 450 aa  90.9  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  26.78 
 
 		 406 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 411 aa  87.8  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  24.77 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  26.29 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4612  aminotransferase  25 
 
 		 480 aa  80.9  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  27.14 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  25.84 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  25.06 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  26.36 
 
 		 401 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 410 aa  79.7  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 406 aa  79.7  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  26.17 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  25.5 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  25.64 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  23.59 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  25.27 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  25.89 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  23.91 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  26.56 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  24.94 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  25.89 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  25.43 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  23.76 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  25.92 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 483 aa  73.6  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  23.27 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07471  aminotransferases class-I  22.64 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.503554  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  25 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  24.43 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1870  GntR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  26.84 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  28.95 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  25.25 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0059  aminotransferase  25.58 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.419945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  24.4 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 477 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  26.58 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 477 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  26.38 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  24.88 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 547 aa  70.1  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  32.39 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  22.5 
 
 		 446 aa  69.7  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>