More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0903 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0903  valine--pyruvate transaminase  100 
 
 		 421 aa  859    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.176446  decreased coverage  0.0000000925124 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2963  valine--pyruvate transaminase  43.72 
 
 		 415 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00447  valine--pyruvate transaminase  43.72 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002002  valine--pyruvate aminotransferase  43.96 
 
 		 417 aa  368  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2635  valine--pyruvate transaminase  43.96 
 
 		 416 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1586  valine--pyruvate transaminase  43.72 
 
 		 419 aa  365  1e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3063  valine--pyruvate transaminase  42.58 
 
 		 420 aa  353  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0126603 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2500  valine--pyruvate transaminase  42.13 
 
 		 418 aa  353  4e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1771  valine--pyruvate transaminase  40.29 
 
 		 424 aa  346  5e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0035  valine--pyruvate transaminase  42.37 
 
 		 418 aa  341  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3725  valine--pyruvate transaminase  39.52 
 
 		 417 aa  341  1e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0055  valine--pyruvate transaminase  41.65 
 
 		 416 aa  338  8e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0050  valine--pyruvate transaminase  41.79 
 
 		 417 aa  338  9e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0062  valine--pyruvate transaminase  41.16 
 
 		 417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4140  valine--pyruvate transaminase  40.82 
 
 		 421 aa  336  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0014  valine--pyruvate transaminase  40.58 
 
 		 456 aa  335  7.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0943  valine--pyruvate transaminase  38.85 
 
 		 425 aa  334  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.784655  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4948  valine--pyruvate transaminase  40.58 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.458288 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4069  valine--pyruvate transaminase  40.58 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0053  valine--pyruvate transaminase  40.34 
 
 		 440 aa  327  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.100706 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03424  valine-pyruvate transaminase  40.58 
 
 		 417 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0138  aminotransferase class I and II  40.58 
 
 		 417 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0142  valine--pyruvate transaminase  40.58 
 
 		 417 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3775  valine--pyruvate transaminase  40.58 
 
 		 417 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3950  valine--pyruvate transaminase  40.58 
 
 		 417 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03375  hypothetical protein  40.58 
 
 		 417 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3895  valine--pyruvate transaminase  40.34 
 
 		 417 aa  325  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0149  valine--pyruvate transaminase  39.61 
 
 		 416 aa  324  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2118  valine--pyruvate transaminase  39.41 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1678  aminotransferase class I and II  40.62 
 
 		 426 aa  323  3e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0089  valine--pyruvate transaminase  41.07 
 
 		 434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2440  valine--pyruvate transaminase  39.17 
 
 		 444 aa  320  3e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3792  valine--pyruvate transaminase  40.81 
 
 		 402 aa  317  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3879  valine--pyruvate transaminase  39.86 
 
 		 416 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3988  valine--pyruvate transaminase  39.61 
 
 		 416 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4049  valine--pyruvate transaminase  39.61 
 
 		 416 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.714309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3943  valine--pyruvate transaminase  39.61 
 
 		 416 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.796758 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3863  valine--pyruvate transaminase  39.37 
 
 		 416 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1487  valine--pyruvate transaminase  39.05 
 
 		 424 aa  309  8e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.41369 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4228  valine--pyruvate transaminase  36.54 
 
 		 419 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420595 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0165  class I/II aminotransferase  34.93 
 
 		 427 aa  263  4e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0914098  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2258  valine--pyruvate transaminase  34.53 
 
 		 427 aa  262  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.782201  normal  0.105483 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1090  valine--pyruvate transaminase  34.21 
 
 		 427 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.294762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3688  valine--pyruvate transaminase  34.3 
 
 		 421 aa  249  8e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  28.4 
 
 		 410 aa  99.8  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  28.4 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  26.18 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  26.85 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1664  aminotransferase, class I and II  25.74 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  25.87 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  28.37 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  24.11 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  29.02 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  29.02 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 477 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  31.39 
 
 		 478 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  21.77 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  26.33 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  27.76 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2869  GntR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.400609  hitchhiker  0.00117486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  26.12 
 
 		 503 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  26.93 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0892  GntR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  26.33 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  25.86 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  23.86 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  29.88 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  24.62 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  24.56 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  24.38 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  28.16 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  23.55 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  23.91 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  24.62 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  26.33 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  26.33 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  25.49 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  26.33 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  26.33 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  26.33 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  26.33 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  27.56 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  24.57 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4380  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.207674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>