More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6053 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6053  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 472 aa  976    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2235  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  63.47 
 
 		 473 aa  644    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71743 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4138  GntR family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 470 aa  587  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4302  GntR family transcriptional regulator  39.14 
 
 		 521 aa  360  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1434  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 480 aa  332  7.000000000000001e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.515471 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0881  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 478 aa  329  6e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0573  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 470 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4437  GntR family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 469 aa  320  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1922  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 470 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2637  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.42 
 
 		 493 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7471  GntR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 449 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3314  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.72 
 
 		 494 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2912  transcriptional regulator, GntR family  36.91 
 
 		 485 aa  303  6.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.784119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3547  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.7 
 
 		 477 aa  296  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224357  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0559  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.87 
 
 		 508 aa  294  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0043  GntR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 492 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1191  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.68 
 
 		 489 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.419241  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0059  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.1 
 
 		 487 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.869186  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0047  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.26 
 
 		 482 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493151  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2642  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 496 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1025  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 499 aa  269  7e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.684124 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2148  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 498 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4623  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.39 
 
 		 489 aa  262  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.609617  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2755  putative transcriptional regulator, GntR family  35.7 
 
 		 456 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.243959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3187  transcriptional regulator  33.63 
 
 		 487 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.685376  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3935  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 503 aa  248  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3373  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 484 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.98747  normal  0.499869 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.98 
 
 		 488 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.59 
 
 		 488 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 490 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 491 aa  217  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 490 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 488 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4822  GntR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 496 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364543  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 504 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  27.18 
 
 		 498 aa  202  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  29.4 
 
 		 520 aa  200  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 475 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  29.31 
 
 		 489 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  29.51 
 
 		 470 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 504 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 517 aa  194  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 495 aa  194  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  28.66 
 
 		 509 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  28.87 
 
 		 496 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 477 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27 
 
 		 477 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 492 aa  190  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4350  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.11 
 
 		 509 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 477 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27 
 
 		 477 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  27.41 
 
 		 494 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 477 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  27 
 
 		 477 aa  189  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.26 
 
 		 477 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.11 
 
 		 497 aa  189  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 494 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.04 
 
 		 485 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 574 aa  189  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 509 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 477 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  30.92 
 
 		 520 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  30.14 
 
 		 509 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 477 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.81 
 
 		 485 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 494 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 494 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 503 aa  187  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 494 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 475 aa  187  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71680  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 491 aa  187  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  28.16 
 
 		 517 aa  186  6e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 477 aa  186  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 488 aa  186  9e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 485 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.87 
 
 		 497 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 509 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  28.05 
 
 		 475 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 473 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  26.87 
 
 		 477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  28.39 
 
 		 480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 501 aa  185  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.21 
 
 		 490 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1580  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 505 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 480 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.34 
 
 		 499 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  27.77 
 
 		 508 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  28.54 
 
 		 480 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 476 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  28.54 
 
 		 480 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 496 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 477 aa  183  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  28.54 
 
 		 480 aa  183  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 463 aa  183  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 477 aa  182  9.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.33 
 
 		 483 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  28.54 
 
 		 480 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.08 
 
 		 496 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.54 
 
 		 480 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 493 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.670433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>