More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1405 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 362 aa  729    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  48.17 
 
 		 356 aa  338  9.999999999999999e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  35.14 
 
 		 374 aa  215  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  35.43 
 
 		 374 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.679406 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  33.15 
 
 		 374 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  29.95 
 
 		 369 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  33.42 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2317  transaminase  31.98 
 
 		 376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  34.44 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  31.15 
 
 		 377 aa  176  8e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  31.71 
 
 		 409 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  33.15 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.12368 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  31.03 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50446  Aspartate aminotransferase (Transaminase A) (AspAT)  29.69 
 
 		 404 aa  152  8e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1447  aminotransferase class I and II  33.7 
 
 		 368 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0268591  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  29.39 
 
 		 372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
NC_003296  RS01751  putative aminotransferase protein  30.48 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.787087 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1088  aminotransferase class I and II  29.18 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.226699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  29.6 
 
 		 374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  29.92 
 
 		 379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0127  aminotransferase class I and II  29.73 
 
 		 399 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0576  aminotransferase, classes I and II  26.14 
 
 		 383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0643  aminotransferase class I and II  27.02 
 
 		 399 aa  125  8.000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  31.04 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  29.18 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1338  aminotransferase class I and II  30.42 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1904  aminotransferase, class I and II  29.82 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  30.53 
 
 		 380 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_515  aminotransferase, DapL-like protein  24.36 
 
 		 382 aa  124  4e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  28.66 
 
 		 393 aa  123  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  30.35 
 
 		 377 aa  124  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  30.35 
 
 		 377 aa  124  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0549  aminotransferase  25.21 
 
 		 380 aa  122  9e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0749  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 		 401 aa  122  9e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000245467  hitchhiker  0.0000000000666006 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0212  hypothetical protein  24.56 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3451  aminotransferase class I and II  29.3 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1475  aminotransferase  28.12 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  27.85 
 
 		 385 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0673  aspartate aminotransferase  31.38 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  30.46 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  31.27 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4480  aminotransferase  28.8 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  28.84 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4249  aminotransferase, class I and II  28.98 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  26.99 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  29.23 
 
 		 414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  28.91 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  27.87 
 
 		 399 aa  116  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3164  aspartate aminotransferase  29.34 
 
 		 460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808038  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  27.27 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  29.13 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  29.34 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  30.09 
 
 		 385 aa  113  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  28.61 
 
 		 411 aa  113  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  28.61 
 
 		 377 aa  113  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  29.32 
 
 		 397 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  28.39 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1801  aminotransferase class I and II  26.38 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000372137  normal  0.409693 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  28.16 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  28.14 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  28.44 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  29.78 
 
 		 415 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  27.5 
 
 		 391 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  26.43 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  27.88 
 
 		 408 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  28.97 
 
 		 402 aa  110  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  24.92 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  27.96 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  27.24 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  28.4 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  27.79 
 
 		 395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  30.31 
 
 		 379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  27.91 
 
 		 400 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1973  aminotransferase, class I and II  27.99 
 
 		 429 aa  109  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  24.6 
 
 		 388 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  28.61 
 
 		 406 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  25.91 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  28.81 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  27.19 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  30.87 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  27.57 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  30.56 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  28.29 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0535  aminotransferase class I and II  30.43 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169316  normal  0.0112885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4902  aminotransferase class I and II  32.92 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000774086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  26.83 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  22.95 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  29.72 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  27.12 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  27.13 
 
 		 413 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  28.53 
 
 		 393 aa  106  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  27.25 
 
 		 387 aa  106  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  29.2 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  27.24 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00370  aminotransferase  29.05 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  27.48 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  26.91 
 
 		 400 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  24.7 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  26.42 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2213  aminotransferase, class I and II  27.36 
 
 		 408 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>