More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3451 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3451  aminotransferase class I and II  100 
 
 
380 aa  768    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00028237 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  29.59 
 
 
374 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.679406 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  29.77 
 
 
409 aa  159  9e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  29.44 
 
 
374 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  28.99 
 
 
372 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  27.27 
 
 
372 aa  154  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  31.16 
 
 
377 aa  153  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  26.7 
 
 
373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  26.56 
 
 
377 aa  146  6e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  28.53 
 
 
374 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  32.49 
 
 
379 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  26.88 
 
 
372 aa  143  6e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0212  hypothetical protein  26.67 
 
 
362 aa  142  9e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  26.43 
 
 
369 aa  142  9e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  28.3 
 
 
356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1447  aminotransferase class I and II  31.5 
 
 
368 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0268591  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  31.42 
 
 
385 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0643  aminotransferase class I and II  28.3 
 
 
399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  27.35 
 
 
393 aa  133  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  30.03 
 
 
393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_515  aminotransferase, DapL-like protein  27.4 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  29.97 
 
 
412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  29.85 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  31.23 
 
 
382 aa  130  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.12368 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50446  Aspartate aminotransferase (Transaminase A) (AspAT)  26.53 
 
 
404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  27.91 
 
 
404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2796  aminotransferase class I and II  30.72 
 
 
409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482676  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0576  aminotransferase, classes I and II  27.37 
 
 
383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  25.41 
 
 
392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2317  transaminase  24.27 
 
 
376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  29.06 
 
 
362 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3605  aminotransferase  28.84 
 
 
395 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  25.41 
 
 
392 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  26.09 
 
 
388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0549  aminotransferase  27.68 
 
 
380 aa  126  6e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  29.14 
 
 
405 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 
401 aa  123  6e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  27.61 
 
 
391 aa  123  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  26.88 
 
 
374 aa  122  7e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  25.84 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  28.81 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  29.24 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  29.72 
 
 
395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07291  aminotransferases class-I  25.62 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.122313  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  27.55 
 
 
393 aa  120  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  24.42 
 
 
401 aa  120  3e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1088  aminotransferase class I and II  29.41 
 
 
399 aa  120  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.226699  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  27.03 
 
 
386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  27.6 
 
 
389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  29.19 
 
 
393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  29.85 
 
 
410 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5434  aminotransferase class I and II  29.19 
 
 
392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  24.32 
 
 
387 aa  120  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1338  aminotransferase class I and II  30.95 
 
 
377 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0674  L-aspartate aminotransferase  24.85 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  27.6 
 
 
401 aa  118  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  28.99 
 
 
395 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07271  aminotransferases class-I  24.69 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.232753  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  27.18 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  26.67 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  26.33 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 
381 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  26.54 
 
 
400 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  28.82 
 
 
401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  28.99 
 
 
403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1173  L-aspartate aminotransferase  29.19 
 
 
392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.241415 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  24.93 
 
 
388 aa  116  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  26.24 
 
 
387 aa  117  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  25.75 
 
 
388 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  25.75 
 
 
390 aa  116  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  26.44 
 
 
387 aa  116  6e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  25.85 
 
 
393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  25.75 
 
 
388 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01751  putative aminotransferase protein  33.03 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.787087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  25.95 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  30.61 
 
 
390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  25.56 
 
 
377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  26.78 
 
 
385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  25.56 
 
 
377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  23.88 
 
 
392 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  28 
 
 
379 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  25.73 
 
 
410 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  30.36 
 
 
382 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  29.08 
 
 
393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1904  aminotransferase, class I and II  25.21 
 
 
392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  26.04 
 
 
402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  23.88 
 
 
392 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  30.86 
 
 
377 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  27.7 
 
 
380 aa  113  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  29.04 
 
 
396 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  26.37 
 
 
370 aa  113  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1475  aminotransferase  26.48 
 
 
363 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  28.95 
 
 
393 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  28.93 
 
 
386 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  27.71 
 
 
400 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  25 
 
 
411 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  27.41 
 
 
392 aa  112  9e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  27.27 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  27.19 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  30.12 
 
 
383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>