More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2069 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  100 
 
 		 374 aa  766    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  78.86 
 
 		 374 aa  618  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.679406 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  69.38 
 
 		 374 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  46.77 
 
 		 377 aa  345  7e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  41.94 
 
 		 369 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  45.94 
 
 		 409 aa  309  5e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2317  transaminase  40.48 
 
 		 376 aa  305  6e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  39.78 
 
 		 373 aa  295  9e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  41.08 
 
 		 372 aa  291  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  37.1 
 
 		 372 aa  275  8e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  37.47 
 
 		 372 aa  270  4e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50446  Aspartate aminotransferase (Transaminase A) (AspAT)  38.06 
 
 		 404 aa  260  3e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  35.14 
 
 		 362 aa  215  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  31.21 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1447  aminotransferase class I and II  32.62 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0268591  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  31.09 
 
 		 382 aa  170  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.12368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  31.36 
 
 		 379 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  30 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_515  aminotransferase, DapL-like protein  30.6 
 
 		 382 aa  163  6e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01751  putative aminotransferase protein  31.65 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.787087 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0549  aminotransferase  29.66 
 
 		 380 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3451  aminotransferase class I and II  28.91 
 
 		 380 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028237 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  32.07 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_002936  DET0576  aminotransferase, classes I and II  28.01 
 
 		 383 aa  140  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  29.17 
 
 		 388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0212  hypothetical protein  25.62 
 
 		 362 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  28.83 
 
 		 373 aa  130  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  26.71 
 
 		 390 aa  125  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  27.27 
 
 		 387 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  25.85 
 
 		 388 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  25.85 
 
 		 388 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  30.11 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  27.41 
 
 		 385 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  28.09 
 
 		 379 aa  122  9e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  28.49 
 
 		 390 aa  122  9e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  27.49 
 
 		 405 aa  122  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1173  L-aspartate aminotransferase  28.34 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241415 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  29.36 
 
 		 396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  27.27 
 
 		 403 aa  119  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  26.2 
 
 		 414 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4480  aminotransferase  31.2 
 
 		 386 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  27.39 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  27.38 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  28.57 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  29.38 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  25.29 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  30.55 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  27.11 
 
 		 375 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4902  aminotransferase class I and II  29.93 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000774086 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  25.21 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  26.75 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  26.75 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  26.18 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  27 
 
 		 379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_19738  predicted protein  29.56 
 
 		 387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.242691  normal  0.116612 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  26.72 
 
 		 405 aa  116  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  29.28 
 
 		 408 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  28.9 
 
 		 402 aa  116  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2932  aminotransferase class I and II  30.21 
 
 		 386 aa  116  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.805427  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  27.94 
 
 		 402 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2419  aminotransferase  27.99 
 
 		 396 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181004  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  26.93 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  25.38 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  29.48 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1475  aminotransferase  27.2 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5434  aminotransferase class I and II  27.89 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  23.84 
 
 		 456 aa  114  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  25.21 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  25.21 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  26.81 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  27.03 
 
 		 388 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  28.35 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  27.19 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  27.53 
 
 		 395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2410  aminotransferase class I and II  30.14 
 
 		 370 aa  113  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  27.99 
 
 		 397 aa  113  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  27.44 
 
 		 395 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0535  aminotransferase class I and II  27.86 
 
 		 401 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169316  normal  0.0112885 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  26.59 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  25.28 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  26.82 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  26.52 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  29.25 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  27.3 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  26.67 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  28.32 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  27.69 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2905  L-aspartate aminotransferase  27.33 
 
 		 395 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  28.95 
 
 		 384 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1458  aminotransferase  28.42 
 
 		 404 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  26.95 
 
 		 393 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  29.7 
 
 		 399 aa  110  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  28.27 
 
 		 391 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  27.35 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  23.81 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0633  aminotransferase, class I  24.5 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0813459  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  29.72 
 
 		 410 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  27.25 
 
 		 393 aa  109  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  27.22 
 
 		 388 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  25.98 
 
 		 398 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.768016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>