More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4902 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4902  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 375 aa  729    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000774086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  45.58 
 
 		 379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  42.63 
 
 		 377 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1447  aminotransferase class I and II  33.69 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0268591  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_515  aminotransferase, DapL-like protein  32.43 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0576  aminotransferase, classes I and II  32.88 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0549  aminotransferase  30.16 
 
 		 380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  27.46 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  31.97 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  26.27 
 
 		 372 aa  139  7e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2317  transaminase  26.45 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  26.04 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  28.3 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  28.48 
 
 		 409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01751  putative aminotransferase protein  34.81 
 
 		 374 aa  122  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.787087 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  31.58 
 
 		 374 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50446  Aspartate aminotransferase (Transaminase A) (AspAT)  24.68 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  29.93 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  28.08 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  32.41 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.12368 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0212  hypothetical protein  28.31 
 
 		 362 aa  112  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  24.23 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  28.06 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.679406 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  30.5 
 
 		 362 aa  109  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1479  aminotransferase  32.79 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  31.12 
 
 		 390 aa  100  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  31.58 
 
 		 400 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  35.48 
 
 		 393 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  35.48 
 
 		 393 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  31.58 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  31.58 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  28.74 
 
 		 377 aa  97.1  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  28.74 
 
 		 377 aa  97.1  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3451  aminotransferase class I and II  32.08 
 
 		 380 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028237 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  32.49 
 
 		 402 aa  96.3  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  30.77 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1338  aminotransferase class I and II  31.23 
 
 		 377 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  31.17 
 
 		 386 aa  94.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3721  aspartate aminotransferase  36.17 
 
 		 396 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.764242 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2069  aminotransferase, class I and II  36.27 
 
 		 375 aa  94  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.708727 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  29.6 
 
 		 385 aa  93.6  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2905  L-aspartate aminotransferase  34.67 
 
 		 395 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2042  aminotransferase, class I and II  36.17 
 
 		 396 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2062  aminotransferase class I and II  34.4 
 
 		 374 aa  92.8  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.422192 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  30.29 
 
 		 400 aa  92.8  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  28.38 
 
 		 391 aa  92  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  28.81 
 
 		 385 aa  92.8  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  31.25 
 
 		 404 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1353  L-aspartate aminotransferase  27.67 
 
 		 391 aa  91.7  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  24.4 
 
 		 456 aa  91.7  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0096  aspartate aminotransferase  32.38 
 
 		 402 aa  90.9  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  35.64 
 
 		 396 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  31.11 
 
 		 402 aa  89.7  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  28.36 
 
 		 388 aa  89.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0749  aminotransferase class I and II  25.45 
 
 		 401 aa  89  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000245467  hitchhiker  0.0000000000666006 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  26.65 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  27.52 
 
 		 379 aa  88.6  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  28.26 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  26.51 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  27.68 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  27.75 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  26.58 
 
 		 398 aa  88.2  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  26.38 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0894  aminotransferase  25.58 
 
 		 392 aa  87.8  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.992063  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0113  aspartate aminotransferase  31.97 
 
 		 402 aa  87.4  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  31.96 
 
 		 387 aa  87  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2419  aminotransferase  29.47 
 
 		 396 aa  86.3  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181004  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  34.34 
 
 		 396 aa  86.3  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4249  aminotransferase, class I and II  28 
 
 		 360 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00190  aminotransferase, putative  24.12 
 
 		 460 aa  86.3  9e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00967249  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  27.56 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2796  aminotransferase class I and II  35.48 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  30.03 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  28 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  27.76 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  32.44 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  32.75 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  27.86 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  28.18 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  27.49 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0178  aminotransferase class I and II  30.22 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  22.65 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  29.82 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  27.44 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  29.13 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  26.51 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  26.05 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1518  aminotransferase class I and II  31.65 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.489896 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  30.81 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  31.86 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  24.68 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0411  aspartate aminotransferase  29 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  29.38 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  28.21 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  27.68 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  27.68 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  22.3 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  25.88 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  29.78 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>