More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05340 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  100 
 
 		 377 aa  787    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  46.77 
 
 		 374 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  46.79 
 
 		 374 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.679406 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  46.79 
 
 		 374 aa  346  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  38.98 
 
 		 373 aa  293  2e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  39.26 
 
 		 372 aa  290  4e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2317  transaminase  36.17 
 
 		 376 aa  274  1.0000000000000001e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  37.1 
 
 		 369 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  36.6 
 
 		 372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  35.29 
 
 		 372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  38.23 
 
 		 409 aa  249  4e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50446  Aspartate aminotransferase (Transaminase A) (AspAT)  33.33 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.566303 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  32.62 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  31.42 
 
 		 362 aa  182  9.000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1447  aminotransferase class I and II  28.88 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0268591  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  26.8 
 
 		 377 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3451  aminotransferase class I and II  27.25 
 
 		 380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  26.54 
 
 		 379 aa  146  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1338  aminotransferase class I and II  28.24 
 
 		 377 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01751  putative aminotransferase protein  28.96 
 
 		 374 aa  139  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.787087 
 
 
-
 
NC_002936  DET0576  aminotransferase, classes I and II  26.05 
 
 		 383 aa  139  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  28.09 
 
 		 382 aa  139  8.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.12368 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_515  aminotransferase, DapL-like protein  26.05 
 
 		 382 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0549  aminotransferase  26.25 
 
 		 380 aa  135  9e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1475  aminotransferase  28.13 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  30.52 
 
 		 383 aa  129  7.000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0178  aminotransferase class I and II  30.64 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  27.25 
 
 		 396 aa  123  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4480  aminotransferase  26.89 
 
 		 386 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  24.77 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  27.9 
 
 		 400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  25.16 
 
 		 392 aa  119  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  27.76 
 
 		 403 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  25.41 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4902  aminotransferase class I and II  26.59 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000774086 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  24.53 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1973  aminotransferase, class I and II  27.76 
 
 		 429 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238227  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  25.15 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  24.84 
 
 		 392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  25.45 
 
 		 385 aa  116  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  27.81 
 
 		 408 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3605  aminotransferase  30.77 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  26.44 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  25.77 
 
 		 397 aa  113  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  28.83 
 
 		 400 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  26.43 
 
 		 408 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  24.34 
 
 		 395 aa  112  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  28.95 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  28.95 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  28.76 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  28.76 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  28.95 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  28.76 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1173  L-aspartate aminotransferase  28.1 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  26.69 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4249  aminotransferase, class I and II  24.37 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  29.47 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  26.23 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  29.28 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  28.38 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  28.03 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  25.4 
 
 		 397 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  25.16 
 
 		 379 aa  111  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2213  aminotransferase, class I and II  26.1 
 
 		 408 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  28.43 
 
 		 387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  25.93 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  25.67 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  25.6 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  26.18 
 
 		 383 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  25.32 
 
 		 405 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  26.32 
 
 		 395 aa  109  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  25.16 
 
 		 393 aa  110  6e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  26.35 
 
 		 398 aa  110  6e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  27.78 
 
 		 375 aa  109  7.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5434  aminotransferase class I and II  27.12 
 
 		 392 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  27.24 
 
 		 388 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  26.44 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  27.05 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  25.32 
 
 		 393 aa  109  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  25.96 
 
 		 402 aa  107  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  27.43 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  26.71 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  28.41 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  27.27 
 
 		 381 aa  107  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  28.48 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  26.62 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  24.71 
 
 		 397 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  25.17 
 
 		 393 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  24.69 
 
 		 392 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  26.18 
 
 		 393 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  27.62 
 
 		 387 aa  106  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  26.67 
 
 		 392 aa  106  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  24.11 
 
 		 388 aa  106  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  25.08 
 
 		 390 aa  106  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  27.76 
 
 		 400 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  23.71 
 
 		 390 aa  106  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  27.76 
 
 		 400 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  25 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1274  aspartate aminotransferase  23.72 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.175604  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  24.85 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>