More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5695 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  100 
 
 		 374 aa  766    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.679406 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  78.86 
 
 		 374 aa  618  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  69.46 
 
 		 374 aa  551  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  46.79 
 
 		 377 aa  344  2e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  41.89 
 
 		 369 aa  330  2e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2317  transaminase  39.95 
 
 		 376 aa  297  2e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  43.91 
 
 		 409 aa  293  5e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  38.54 
 
 		 373 aa  289  6e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  40.7 
 
 		 372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  36.12 
 
 		 372 aa  270  4e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  36.93 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50446  Aspartate aminotransferase (Transaminase A) (AspAT)  36.75 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  35.43 
 
 		 362 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  32.97 
 
 		 356 aa  197  3e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1447  aminotransferase class I and II  33.51 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0268591  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  32.14 
 
 		 382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.12368 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  30.38 
 
 		 377 aa  165  9e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  32.05 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_003296  RS01751  putative aminotransferase protein  32.62 
 
 		 374 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.787087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3451  aminotransferase class I and II  29.59 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028237 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_515  aminotransferase, DapL-like protein  29.32 
 
 		 382 aa  153  4e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0549  aminotransferase  29.12 
 
 		 380 aa  150  5e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0576  aminotransferase, classes I and II  27.06 
 
 		 383 aa  139  7e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  28.66 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  30.26 
 
 		 390 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4480  aminotransferase  32.15 
 
 		 386 aa  132  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  31.89 
 
 		 379 aa  130  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0212  hypothetical protein  24.39 
 
 		 362 aa  129  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  31.09 
 
 		 400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  27.83 
 
 		 388 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  27.83 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  26.69 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1173  L-aspartate aminotransferase  30.38 
 
 		 392 aa  126  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241415 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  28.66 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  26.79 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  28.41 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  27.6 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  31.38 
 
 		 400 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5434  aminotransferase class I and II  29.38 
 
 		 392 aa  123  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  31.99 
 
 		 383 aa  123  6e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  28.28 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  28.95 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  30.86 
 
 		 388 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  28.06 
 
 		 377 aa  121  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  28.06 
 
 		 377 aa  121  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  31.09 
 
 		 382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  29.76 
 
 		 402 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  27.46 
 
 		 388 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  28.99 
 
 		 395 aa  119  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  29.97 
 
 		 381 aa  119  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1338  aminotransferase class I and II  30.46 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2419  aminotransferase  28.19 
 
 		 396 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181004  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0127  aminotransferase class I and II  28.99 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  28.74 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1479  aminotransferase  28.03 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  26.65 
 
 		 388 aa  116  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  25.98 
 
 		 387 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  26.38 
 
 		 456 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  26.19 
 
 		 392 aa  115  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  26.98 
 
 		 389 aa  115  8.999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  27.54 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  27.78 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  27.54 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  27.48 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  27.99 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  26.19 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  28.32 
 
 		 403 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4902  aminotransferase class I and II  28.21 
 
 		 375 aa  112  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000774086 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  28.4 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4249  aminotransferase, class I and II  24.4 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  28.82 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  29.03 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  30.42 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  29.03 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_19738  predicted protein  29.26 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.242691  normal  0.116612 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0633  aminotransferase, class I  25.36 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0813459  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  26.09 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  28.12 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  26.61 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  30.4 
 
 		 384 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  26.67 
 
 		 388 aa  111  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  28.82 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  28.36 
 
 		 408 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  26.06 
 
 		 395 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1475  aminotransferase  28.72 
 
 		 363 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  27.15 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  29 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  27.54 
 
 		 379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  25.56 
 
 		 407 aa  110  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.08 
 
 		 388 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  28.06 
 
 		 380 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  27.54 
 
 		 395 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  25.21 
 
 		 400 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  27.35 
 
 		 394 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  28.45 
 
 		 384 aa  109  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  26.1 
 
 		 398 aa  109  7.000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  28.27 
 
 		 402 aa  109  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  25.73 
 
 		 383 aa  109  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  29.87 
 
 		 410 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  29.25 
 
 		 408 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0411376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>