More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0576 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0576  aminotransferase, classes I and II  100 
 
 
383 aa  801    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_515  aminotransferase, DapL-like protein  83.25 
 
 
382 aa  674    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0549  aminotransferase  82.11 
 
 
380 aa  636    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1447  aminotransferase class I and II  42.93 
 
 
368 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0268591  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  39.08 
 
 
379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  35.03 
 
 
377 aa  252  8.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  33.16 
 
 
409 aa  199  5e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4902  aminotransferase class I and II  33.8 
 
 
375 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000774086 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  30.45 
 
 
373 aa  186  5e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  27.89 
 
 
369 aa  176  6e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2317  transaminase  28.37 
 
 
376 aa  171  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  30.83 
 
 
374 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  28.7 
 
 
372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  29.33 
 
 
372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  30.61 
 
 
372 aa  158  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  28.01 
 
 
374 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  27.59 
 
 
374 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.679406 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  28.35 
 
 
382 aa  144  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.12368 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50446  Aspartate aminotransferase (Transaminase A) (AspAT)  25.97 
 
 
404 aa  139  6e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  24.38 
 
 
377 aa  139  8.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  26.14 
 
 
362 aa  133  5e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  26.9 
 
 
356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0212  hypothetical protein  28.48 
 
 
362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  26.11 
 
 
397 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  29.63 
 
 
388 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3451  aminotransferase class I and II  27.37 
 
 
380 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00028237 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4480  aminotransferase  26.57 
 
 
386 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1338  aminotransferase class I and II  28.39 
 
 
377 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4249  aminotransferase, class I and II  27.92 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  26.54 
 
 
385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  25.73 
 
 
400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  27.24 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  26.32 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  24.77 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  26.21 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  24.49 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  25.23 
 
 
391 aa  110  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  26.96 
 
 
393 aa  109  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  24.92 
 
 
380 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  25 
 
 
402 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0642  aminotransferase class I and II  26.01 
 
 
380 aa  106  6e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  25.55 
 
 
388 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01751  putative aminotransferase protein  26.15 
 
 
374 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.787087 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  25.99 
 
 
399 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  24.94 
 
 
381 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  25.48 
 
 
410 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  23.4 
 
 
392 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  25.62 
 
 
386 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  23.1 
 
 
392 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  26.88 
 
 
392 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  25.38 
 
 
375 aa  101  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  23.08 
 
 
393 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  24.38 
 
 
387 aa  100  6e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  24.86 
 
 
385 aa  99.4  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  25.15 
 
 
396 aa  99.4  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  24.26 
 
 
390 aa  99  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  25.36 
 
 
404 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  24.62 
 
 
409 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  23.68 
 
 
400 aa  97.4  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  25 
 
 
456 aa  97.8  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  24.32 
 
 
375 aa  97.1  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2419  aminotransferase  25.57 
 
 
396 aa  97.1  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181004  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0583  aspartate aminotransferase  25 
 
 
388 aa  96.7  7e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.404967  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  25.18 
 
 
391 aa  96.3  8e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  24.53 
 
 
387 aa  96.3  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  25.08 
 
 
367 aa  95.5  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1393  aminotransferase class I and II  25.62 
 
 
373 aa  95.5  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07471  aminotransferases class-I  25.48 
 
 
393 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.503554  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  25 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  26.09 
 
 
390 aa  95.1  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1600  aminotransferase AlaT  24.78 
 
 
404 aa  94.7  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0619302  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  22.26 
 
 
393 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1973  aminotransferase, class I and II  25.23 
 
 
429 aa  94.7  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238227  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  24.36 
 
 
375 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  25 
 
 
387 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  24.76 
 
 
412 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  24.83 
 
 
400 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  26.3 
 
 
391 aa  94.4  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  23.65 
 
 
375 aa  94.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  25.93 
 
 
385 aa  94  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0877  aminotransferase  25.9 
 
 
417 aa  94  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.706864  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  23.87 
 
 
375 aa  93.6  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  24.76 
 
 
386 aa  93.2  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  23.12 
 
 
397 aa  93.2  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1475  aminotransferase  24.77 
 
 
363 aa  93.2  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  26.81 
 
 
409 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  25.88 
 
 
393 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  24.5 
 
 
400 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3133  aminotransferase  25.23 
 
 
370 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.475875 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  24.23 
 
 
399 aa  91.7  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  24.49 
 
 
400 aa  91.3  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  24.35 
 
 
380 aa  91.3  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0300  aspartate aminotransferase  26.75 
 
 
427 aa  90.9  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0401102 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  22.9 
 
 
395 aa  90.5  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  26.98 
 
 
409 aa  90.5  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  24.32 
 
 
389 aa  90.1  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  25.17 
 
 
402 aa  90.5  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  27.09 
 
 
384 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  22.95 
 
 
370 aa  90.1  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  25.91 
 
 
392 aa  89.7  8e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>