More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2317 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2317  transaminase  100 
 
 		 376 aa  777    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  57.22 
 
 		 373 aa  461  9.999999999999999e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  55.61 
 
 		 372 aa  434  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  50.27 
 
 		 372 aa  414  1e-114  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  52.82 
 
 		 369 aa  413  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  50 
 
 		 372 aa  402  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  40.48 
 
 		 374 aa  305  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  39.47 
 
 		 374 aa  299  6e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  39.95 
 
 		 374 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.679406 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  38.83 
 
 		 409 aa  272  8.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  36.17 
 
 		 377 aa  269  5.9999999999999995e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1447  aminotransferase class I and II  31.91 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0268591  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50446  Aspartate aminotransferase (Transaminase A) (AspAT)  31.89 
 
 		 404 aa  200  3e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.566303 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  31.64 
 
 		 356 aa  182  6e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  31.98 
 
 		 362 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0549  aminotransferase  30.79 
 
 		 380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_515  aminotransferase, DapL-like protein  29.13 
 
 		 382 aa  166  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0576  aminotransferase, classes I and II  29.77 
 
 		 383 aa  162  6e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  28.78 
 
 		 377 aa  159  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  29.31 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.12368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  26.74 
 
 		 379 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  28.22 
 
 		 456 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01751  putative aminotransferase protein  30.77 
 
 		 374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.787087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1475  aminotransferase  29.65 
 
 		 363 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4902  aminotransferase class I and II  26.45 
 
 		 375 aa  132  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000774086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3451  aminotransferase class I and II  24.27 
 
 		 380 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028237 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0178  aminotransferase class I and II  27.54 
 
 		 396 aa  122  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0212  hypothetical protein  25.27 
 
 		 362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2419  aminotransferase  26.5 
 
 		 396 aa  117  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181004  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4249  aminotransferase, class I and II  24.74 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0127  aminotransferase class I and II  29.18 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0749  aminotransferase class I and II  25.76 
 
 		 401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000245467  hitchhiker  0.0000000000666006 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  26.68 
 
 		 411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  25.58 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1781  aminotransferase class I and II  28.75 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  25.55 
 
 		 373 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1311  aminotransferase AlaT  28.75 
 
 		 508 aa  112  9e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1274  aspartate aminotransferase  26.25 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.175604  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  26.45 
 
 		 387 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  29.54 
 
 		 383 aa  110  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1338  aminotransferase class I and II  24.93 
 
 		 377 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  27.12 
 
 		 379 aa  109  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  24.71 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  26.13 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  28.49 
 
 		 404 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1326  aminotransferase AlaT  26.13 
 
 		 413 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0763036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  24.5 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1201  aminotransferase AlaT  26.72 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.895209  normal  0.0291272 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1803  aminotransferase class I and II  28.78 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1262  aminotransferase AlaT  26.72 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.30879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  26.33 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1458  aminotransferase  29.63 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  26.15 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  26.56 
 
 		 393 aa  107  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  26.14 
 
 		 409 aa  107  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  26.21 
 
 		 380 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  24.83 
 
 		 389 aa  106  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  26.1 
 
 		 385 aa  107  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  26.3 
 
 		 390 aa  106  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2387  aminotransferase AlaT  26.46 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  25.87 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  25.87 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2048  aminotransferase AlaT  25.08 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000163504  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  26.91 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2232  aminotransferase AlaT  26.53 
 
 		 407 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0248058  hitchhiker  0.00000226565 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1994  aminotransferase AlaT  26.65 
 
 		 427 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3605  aminotransferase  25.21 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0583  aspartate aminotransferase  25.91 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.404967  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  24.81 
 
 		 409 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0167  aminotransferase AlaT  26.63 
 
 		 404 aa  103  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  27.78 
 
 		 395 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  24.78 
 
 		 444 aa  103  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1173  L-aspartate aminotransferase  26.46 
 
 		 392 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241415 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  24.2 
 
 		 405 aa  103  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  24.58 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  24.25 
 
 		 388 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  28.8 
 
 		 412 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1468  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  27.13 
 
 		 534 aa  103  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  27.27 
 
 		 387 aa  103  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0642  aminotransferase class I and II  25.07 
 
 		 380 aa  102  8e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1088  aminotransferase class I and II  27.84 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.226699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2238  aminotransferase class I and II  25.71 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05990  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  27.13 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.338799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  27.5 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  24.41 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5220  aminotransferase AlaT  25.14 
 
 		 411 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0739506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1830  aminotransferase AlaT  26.39 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  25 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5434  aminotransferase class I and II  25.31 
 
 		 392 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  24.87 
 
 		 409 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1600  aminotransferase AlaT  26.76 
 
 		 404 aa  100  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0619302  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  25.68 
 
 		 385 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  25.37 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16560  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  25.54 
 
 		 505 aa  100  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0044181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1697  aminotransferase AlaT  24.3 
 
 		 404 aa  100  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00135773  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2340  aminotransferase AlaT  24.21 
 
 		 404 aa  99.8  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599264  hitchhiker  0.0000284015 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  26.99 
 
 		 408 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  26.62 
 
 		 402 aa  99.8  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  25.07 
 
 		 393 aa  99.8  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  24.14 
 
 		 388 aa  99.4  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>