More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_50446 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_50446  Aspartate aminotransferase (Transaminase A) (AspAT)  100 
 
 		 404 aa  832    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.566303 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  39.76 
 
 		 409 aa  278  8e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  38.06 
 
 		 374 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  36.75 
 
 		 374 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.679406 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  36.39 
 
 		 374 aa  249  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  33.33 
 
 		 377 aa  212  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  32.91 
 
 		 373 aa  206  7e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2317  transaminase  31.89 
 
 		 376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  31.58 
 
 		 369 aa  193  4e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  31.62 
 
 		 372 aa  182  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  30.95 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  30.75 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1447  aminotransferase class I and II  28.35 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0268591  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  29.69 
 
 		 362 aa  152  8.999999999999999e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  30.03 
 
 		 356 aa  152  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_515  aminotransferase, DapL-like protein  26.74 
 
 		 382 aa  139  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  26.41 
 
 		 379 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1338  aminotransferase class I and II  27.62 
 
 		 377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  28.61 
 
 		 373 aa  134  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0549  aminotransferase  26.89 
 
 		 380 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  25.39 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  30.7 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.12368 
 
 
-
 
NC_002936  DET0576  aminotransferase, classes I and II  27.5 
 
 		 383 aa  131  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  26.63 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3451  aminotransferase class I and II  26.53 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4902  aminotransferase class I and II  24.68 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000774086 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  25.74 
 
 		 390 aa  117  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0212  hypothetical protein  28.3 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4480  aminotransferase  24.35 
 
 		 386 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  28.53 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  28.53 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  27.35 
 
 		 393 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  26.86 
 
 		 393 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01751  putative aminotransferase protein  26.53 
 
 		 374 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.787087 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  22.56 
 
 		 456 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  27.66 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1475  aminotransferase  26.71 
 
 		 363 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  25 
 
 		 395 aa  106  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  25 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4249  aminotransferase, class I and II  27.97 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  24.34 
 
 		 401 aa  103  6e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  22.91 
 
 		 392 aa  103  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  29.01 
 
 		 398 aa  103  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  26.05 
 
 		 379 aa  103  8e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00370  aminotransferase  23.06 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  27.13 
 
 		 396 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2062  aminotransferase class I and II  25.52 
 
 		 374 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.422192 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2905  L-aspartate aminotransferase  25.79 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  24.61 
 
 		 396 aa  101  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2042  aminotransferase, class I and II  27.62 
 
 		 396 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  28.15 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3721  aspartate aminotransferase  26.93 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.764242 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0181  aminotransferase class I and II  23.12 
 
 		 388 aa  100  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  22.47 
 
 		 400 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  24.72 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  25 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2213  aminotransferase, class I and II  24.87 
 
 		 408 aa  97.8  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  25.37 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1956  aminotransferase  25.31 
 
 		 398 aa  97.4  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.476214  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  23.83 
 
 		 395 aa  97.1  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  26.14 
 
 		 384 aa  96.3  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1173  L-aspartate aminotransferase  24.44 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241415 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  26.53 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  25.36 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0727  aminotransferase class I and II  24.85 
 
 		 382 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  22.85 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2796  aminotransferase class I and II  25.4 
 
 		 409 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  26.24 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5434  aminotransferase class I and II  23.96 
 
 		 392 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  22.07 
 
 		 389 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  22.62 
 
 		 409 aa  94.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  30.09 
 
 		 395 aa  94.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  21.97 
 
 		 400 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  21.97 
 
 		 400 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1973  aminotransferase, class I and II  24.23 
 
 		 429 aa  94  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238227  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  23.71 
 
 		 444 aa  93.6  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1479  aminotransferase  25.08 
 
 		 397 aa  93.6  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2419  aminotransferase  24.46 
 
 		 396 aa  93.6  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181004  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2069  aminotransferase, class I and II  27.46 
 
 		 375 aa  93.6  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.708727 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0045  aromatic amino acid aminotransferase  23.75 
 
 		 391 aa  93.6  6e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  23.18 
 
 		 407 aa  93.2  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  23.17 
 
 		 402 aa  93.2  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1872  aminotransferase AlaT  26.38 
 
 		 404 aa  92.8  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  24.93 
 
 		 392 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  23.42 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  24.81 
 
 		 388 aa  92.8  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  27.09 
 
 		 393 aa  92.8  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  23.91 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  24.65 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  25.74 
 
 		 398 aa  91.7  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  29.23 
 
 		 409 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  25.07 
 
 		 401 aa  92  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  25.55 
 
 		 396 aa  90.9  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  25.75 
 
 		 393 aa  90.9  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  22.62 
 
 		 387 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  30.41 
 
 		 374 aa  90.5  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5610  putative transcriptional regulator, GntR family  25.37 
 
 		 468 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  23.62 
 
 		 389 aa  90.5  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00190  aminotransferase, putative  29.41 
 
 		 460 aa  90.5  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00967249  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0039  aminotransferase class I and II  23.06 
 
 		 389 aa  90.5  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>