More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5610 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5610  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 468 aa  910    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2586  putative transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 478 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0905182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0615  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.34 
 
 		 491 aa  209  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6790  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.99 
 
 		 487 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2248  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.1 
 
 		 486 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000288373  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1408  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.47 
 
 		 488 aa  193  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1043  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.78 
 
 		 486 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2093  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.03 
 
 		 503 aa  188  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.619312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0748  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.04 
 
 		 493 aa  185  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4172  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  35.68 
 
 		 488 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03897  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3373  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 478 aa  183  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576212  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0925  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 485 aa  182  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2700  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  33.48 
 
 		 475 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0691632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5956  putative transcriptional regulator, GntR family  34.09 
 
 		 486 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.072408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3924  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.06 
 
 		 468 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3184  regulatory protein GntR, HTH  33.63 
 
 		 485 aa  170  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2369  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.59 
 
 		 505 aa  169  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0620  GntR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 496 aa  167  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1854  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3410  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 485 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.723571  decreased coverage  0.0095682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1835  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.422733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1901  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 340 aa  163  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2441  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 449 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.25 
 
 		 468 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  31.21 
 
 		 498 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  33.05 
 
 		 484 aa  156  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1217  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.43 
 
 		 466 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 477 aa  153  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.24 
 
 		 517 aa  153  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2084  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 504 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.87186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4275  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 480 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.310254  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.72 
 
 		 477 aa  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4144  putative transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 472 aa  149  8e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.805557 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.49 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  28.38 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  32.99 
 
 		 493 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 477 aa  148  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  27.94 
 
 		 477 aa  148  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 477 aa  148  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.94 
 
 		 477 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 477 aa  148  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.72 
 
 		 477 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  35.74 
 
 		 406 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  36.7 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 403 aa  144  5e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 395 aa  143  7e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 480 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 411 aa  141  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  31.39 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  36.82 
 
 		 394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  38.41 
 
 		 406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  37.63 
 
 		 416 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 		 414 aa  140  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  34.85 
 
 		 416 aa  140  6e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 398 aa  140  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3402  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.89 
 
 		 515 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000368024  hitchhiker  0.000012724 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 503 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 480 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 480 aa  139  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 411 aa  138  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 480 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.78 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  32.66 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 		 402 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  35.14 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 468 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  27.14 
 
 		 480 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  36.61 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  34.26 
 
 		 396 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  34.26 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.06 
 
 		 480 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  32.89 
 
 		 393 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  28.06 
 
 		 480 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.78 
 
 		 480 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2212  GntR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 468 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 480 aa  137  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 480 aa  137  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  33.94 
 
 		 440 aa  137  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 406 aa  137  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  35.65 
 
 		 420 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  32.55 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69750  putative transcriptional regulator  28.67 
 
 		 458 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.477513  normal  0.557474 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  32.55 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  25.32 
 
 		 477 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  33 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  34.28 
 
 		 402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  36.21 
 
 		 417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  32.14 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  31.54 
 
 		 386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6026  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 461 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 441 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  35.84 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>