More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4275 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4275  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 480 aa  934    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.310254  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2084  GntR family transcriptional regulator  83.33 
 
 		 504 aa  701    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.87186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1835  GntR family transcriptional regulator  70.29 
 
 		 478 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.422733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1854  GntR family transcriptional regulator  70.29 
 
 		 478 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1901  GntR family transcriptional regulator  70.29 
 
 		 478 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0748  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.4 
 
 		 493 aa  362  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3184  regulatory protein GntR, HTH  46.02 
 
 		 485 aa  354  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1043  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.32 
 
 		 486 aa  353  5e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0620  GntR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 496 aa  347  4e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0925  GntR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 485 aa  346  5e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3410  transcriptional regulator  45.59 
 
 		 485 aa  340  4e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.723571  decreased coverage  0.0095682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2700  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  45.97 
 
 		 475 aa  339  5e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0691632 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2441  GntR family transcriptional regulator  40.05 
 
 		 449 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6790  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.23 
 
 		 487 aa  323  4e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3373  GntR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 478 aa  323  5e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576212  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3344  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.41 
 
 		 482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5956  putative transcriptional regulator, GntR family  45.12 
 
 		 486 aa  320  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.072408 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2093  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.05 
 
 		 503 aa  317  3e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.619312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1408  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.67 
 
 		 488 aa  311  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4144  putative transcriptional regulator, GntR family  45.07 
 
 		 472 aa  308  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.805557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2369  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.71 
 
 		 505 aa  302  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3402  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.8 
 
 		 515 aa  300  4e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000368024  hitchhiker  0.000012724 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2248  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.75 
 
 		 486 aa  289  9e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000288373  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3924  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.18 
 
 		 468 aa  268  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2586  putative transcriptional regulator, GntR family  36.65 
 
 		 478 aa  236  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0905182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0615  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.08 
 
 		 491 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4172  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  33.2 
 
 		 488 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03897  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1217  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.4 
 
 		 466 aa  180  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5610  putative transcriptional regulator, GntR family  33.56 
 
 		 468 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 477 aa  167  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  31.39 
 
 		 484 aa  167  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  26.56 
 
 		 485 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6330  putative transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 437 aa  164  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00057428  hitchhiker  0.00168096 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 481 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  25.99 
 
 		 477 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  32.34 
 
 		 493 aa  160  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  26.4 
 
 		 477 aa  159  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  24.52 
 
 		 482 aa  159  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  25.73 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  26.11 
 
 		 480 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  24.31 
 
 		 482 aa  157  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  24.57 
 
 		 482 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  25.83 
 
 		 480 aa  156  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 482 aa  156  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 482 aa  156  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 482 aa  156  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  24.35 
 
 		 482 aa  156  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 482 aa  156  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 477 aa  156  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  23.99 
 
 		 482 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  26.57 
 
 		 480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  26.15 
 
 		 480 aa  153  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 477 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  25.62 
 
 		 503 aa  150  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0931  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 477 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30 
 
 		 470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 397 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 480 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3572  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  28.07 
 
 		 517 aa  144  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0915  GntR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 470 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 395 aa  143  6e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3448  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 470 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  26.42 
 
 		 461 aa  143  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25 
 
 		 468 aa  142  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01396  fused predicted DNA-binding transcriptional regulator/predicted amino transferase  29.52 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.52 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2220  transcriptional regulator  29.52 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01407  hypothetical protein  29.52 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1618  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2044  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  29.52 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00402201  hitchhiker  0.0000000000000583102 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 480 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 480 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 480 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.09 
 
 		 480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.74 
 
 		 484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.09 
 
 		 480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 480 aa  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  28.09 
 
 		 480 aa  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.09 
 
 		 483 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  29.15 
 
 		 463 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 487 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0367  GntR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 473 aa  140  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  29.02 
 
 		 500 aa  140  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.92 
 
 		 477 aa  140  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  25.92 
 
 		 477 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  25.92 
 
 		 477 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  25.92 
 
 		 477 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  26.78 
 
 		 480 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.81 
 
 		 477 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0347  GntR family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 519 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.42 
 
 		 475 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6904  transcriptional regulator  28.76 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 480 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 473 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1523  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 468 aa  138  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1735  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 468 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453488  hitchhiker  0.0000000000634797 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1049  putative GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>