More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2084 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1835  GntR family transcriptional regulator  70.29 
 
 		 478 aa  642    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.422733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4275  GntR family transcriptional regulator  83.33 
 
 		 480 aa  714    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.310254  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1854  GntR family transcriptional regulator  70.5 
 
 		 478 aa  644    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1901  GntR family transcriptional regulator  70.5 
 
 		 478 aa  644    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2084  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 504 aa  988    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.87186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0748  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.74 
 
 		 493 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0925  GntR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 485 aa  360  4e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1043  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.29 
 
 		 486 aa  356  5e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0620  GntR family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 496 aa  355  7.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3184  regulatory protein GntR, HTH  47.06 
 
 		 485 aa  347  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2093  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.94 
 
 		 503 aa  342  8e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.619312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3410  transcriptional regulator  46.41 
 
 		 485 aa  340  4e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.723571  decreased coverage  0.0095682 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3344  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.11 
 
 		 482 aa  330  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2700  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  44.88 
 
 		 475 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0691632 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2441  GntR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5956  putative transcriptional regulator, GntR family  46.81 
 
 		 486 aa  327  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.072408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6790  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.11 
 
 		 487 aa  325  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1408  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.26 
 
 		 488 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3373  GntR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 478 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576212  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4144  putative transcriptional regulator, GntR family  45.88 
 
 		 472 aa  316  7e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.805557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2369  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.4 
 
 		 505 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3402  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.72 
 
 		 515 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000368024  hitchhiker  0.000012724 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2248  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.17 
 
 		 486 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000288373  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3924  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.32 
 
 		 468 aa  286  8e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0615  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.5 
 
 		 491 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2586  putative transcriptional regulator, GntR family  35.16 
 
 		 478 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0905182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4172  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  35.05 
 
 		 488 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03897  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1217  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.45 
 
 		 466 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5610  putative transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 468 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  26.79 
 
 		 480 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 480 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 481 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 477 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  26.78 
 
 		 480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  26.51 
 
 		 480 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 477 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  26.5 
 
 		 485 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  26.09 
 
 		 477 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6330  putative transcriptional regulator, GntR family  35.74 
 
 		 437 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00057428  hitchhiker  0.00168096 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  25.93 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.77 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 480 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  30.77 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  28.12 
 
 		 480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.12 
 
 		 480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 480 aa  154  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.12 
 
 		 483 aa  154  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  25.87 
 
 		 503 aa  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.48 
 
 		 470 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  23.67 
 
 		 482 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  32.33 
 
 		 493 aa  150  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 480 aa  150  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3572  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 470 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  29.72 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  23.92 
 
 		 482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  28.99 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  27.71 
 
 		 480 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  23.14 
 
 		 482 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  23.24 
 
 		 482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 477 aa  148  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  23.45 
 
 		 482 aa  148  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0915  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 470 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0931  GntR family transcriptional regulator  27.29 
 
 		 479 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3448  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.35 
 
 		 468 aa  147  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  27.9 
 
 		 498 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.17 
 
 		 477 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 477 aa  144  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.24 
 
 		 473 aa  144  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.19 
 
 		 475 aa  143  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 477 aa  143  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  27.91 
 
 		 477 aa  143  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.91 
 
 		 477 aa  143  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 477 aa  143  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.09 
 
 		 490 aa  143  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  26.36 
 
 		 461 aa  143  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  28.82 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  28.78 
 
 		 500 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0965  GntR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 470 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 397 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 477 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 474 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  29.87 
 
 		 468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01396  fused predicted DNA-binding transcriptional regulator/predicted amino transferase  29.05 
 
 		 468 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.05 
 
 		 468 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01407  hypothetical protein  29.05 
 
 		 468 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2220  transcriptional regulator  29.05 
 
 		 468 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2661  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 483 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0327795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1618  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 468 aa  140  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 473 aa  140  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.4 
 
 		 483 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>