More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1835 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1835  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
478 aa  938    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.422733  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1854  GntR family transcriptional regulator  99.58 
 
 
478 aa  935    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1901  GntR family transcriptional regulator  99.58 
 
 
478 aa  935    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4275  GntR family transcriptional regulator  69.96 
 
 
480 aa  608  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.310254  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2084  GntR family transcriptional regulator  71.13 
 
 
504 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.87186  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1043  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.49 
 
 
486 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0925  GntR family transcriptional regulator  42.77 
 
 
485 aa  372  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.447964  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2441  GntR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0748  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.61 
 
 
493 aa  352  1e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6790  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.33 
 
 
487 aa  348  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3184  regulatory protein GntR, HTH  45.32 
 
 
485 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0620  GntR family transcriptional regulator  44.47 
 
 
496 aa  340  5e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2700  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  42.95 
 
 
475 aa  339  5.9999999999999996e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0691632 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2093  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.67 
 
 
503 aa  332  1e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.619312  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3410  transcriptional regulator  44.66 
 
 
485 aa  331  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.723571  decreased coverage  0.0095682 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1408  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.76 
 
 
488 aa  323  4e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3373  GntR family transcriptional regulator  42.64 
 
 
478 aa  323  5e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576212  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4144  putative transcriptional regulator, GntR family  44.72 
 
 
472 aa  312  9e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.805557 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3344  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.18 
 
 
482 aa  309  5.9999999999999995e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5956  putative transcriptional regulator, GntR family  43.86 
 
 
486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.072408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2369  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.34 
 
 
505 aa  297  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2248  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.81 
 
 
486 aa  290  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000288373  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3402  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.89 
 
 
515 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000368024  hitchhiker  0.000012724 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3924  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.51 
 
 
468 aa  285  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2586  putative transcriptional regulator, GntR family  36.12 
 
 
478 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0905182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0615  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.89 
 
 
491 aa  236  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736452  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4172  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  35.7 
 
 
488 aa  223  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03897  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1217  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.53 
 
 
466 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5610  putative transcriptional regulator, GntR family  35.54 
 
 
468 aa  182  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  28.27 
 
 
480 aa  177  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6330  putative transcriptional regulator, GntR family  36.78 
 
 
437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00057428  hitchhiker  0.00168096 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.11 
 
 
468 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 
480 aa  170  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 
480 aa  171  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
481 aa  170  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  27.56 
 
 
480 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  26.93 
 
 
477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  27.14 
 
 
477 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  32.05 
 
 
493 aa  162  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  26.57 
 
 
477 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  24.3 
 
 
482 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  24.3 
 
 
482 aa  156  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  24.3 
 
 
477 aa  156  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  26.57 
 
 
478 aa  156  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  24.3 
 
 
482 aa  156  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
477 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  23.87 
 
 
482 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  23.87 
 
 
482 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  23.87 
 
 
482 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  23.87 
 
 
482 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  24.3 
 
 
482 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.9 
 
 
490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.84 
 
 
470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  23.87 
 
 
477 aa  154  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  24.4 
 
 
482 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.97 
 
 
483 aa  153  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  27.77 
 
 
480 aa  153  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  27.77 
 
 
480 aa  153  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  27.77 
 
 
480 aa  153  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  28.95 
 
 
463 aa  153  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  26.19 
 
 
485 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3572  transcriptional regulator  27.62 
 
 
470 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.77 
 
 
480 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
480 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 
480 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  27.77 
 
 
480 aa  152  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.56 
 
 
480 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3448  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
470 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  27.56 
 
 
480 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  30.26 
 
 
484 aa  151  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0915  GntR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
470 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.98 
 
 
475 aa  150  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0965  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
470 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  25.57 
 
 
477 aa  150  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.27 
 
 
477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  26.57 
 
 
503 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0931  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
479 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  27.07 
 
 
468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0367  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.88 
 
 
484 aa  146  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
397 aa  146  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  28.54 
 
 
517 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
473 aa  146  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
482 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1567  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
397 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  27.19 
 
 
461 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
487 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  30.51 
 
 
478 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  29.04 
 
 
474 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.76 
 
 
483 aa  143  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1939  transcriptional regulator  27.93 
 
 
476 aa  143  9e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0234327  normal  0.0215976 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0929  GntR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
470 aa  142  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.892808  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01396  fused predicted DNA-binding transcriptional regulator/predicted amino transferase  29.31 
 
 
468 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.31 
 
 
468 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1618  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
468 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  28.94 
 
 
478 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01407  hypothetical protein  29.31 
 
 
468 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2220  transcriptional regulator  29.31 
 
 
468 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0347  GntR family transcriptional regulator  22.7 
 
 
519 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>