More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1217 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1217  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 
466 aa  880    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4172  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  40.04 
 
 
488 aa  219  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03897  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0615  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.51 
 
 
491 aa  217  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736452  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1408  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.86 
 
 
488 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2586  putative transcriptional regulator, GntR family  39.66 
 
 
478 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0905182 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2093  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.46 
 
 
503 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.619312  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2248  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.96 
 
 
486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000288373  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0925  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
485 aa  185  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.447964  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3184  regulatory protein GntR, HTH  36.29 
 
 
485 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1043  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.96 
 
 
486 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1835  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
478 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.422733  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  31.2 
 
 
477 aa  176  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1854  GntR family transcriptional regulator  33.55 
 
 
478 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1901  GntR family transcriptional regulator  33.55 
 
 
478 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0748  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.26 
 
 
493 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6790  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.69 
 
 
487 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3410  transcriptional regulator  36.42 
 
 
485 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.723571  decreased coverage  0.0095682 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0620  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
496 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2700  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  35.4 
 
 
475 aa  173  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0691632 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
477 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.06 
 
 
477 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.06 
 
 
477 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
477 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
477 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.91 
 
 
477 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  29.91 
 
 
477 aa  170  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.91 
 
 
477 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
477 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4144  putative transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 
472 aa  168  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.805557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5956  putative transcriptional regulator, GntR family  32.44 
 
 
486 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.072408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3924  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.33 
 
 
468 aa  166  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3373  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
478 aa  166  9e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576212  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 
480 aa  163  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2084  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
504 aa  161  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.87186  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2441  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
449 aa  160  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  33.64 
 
 
397 aa  160  5e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5610  putative transcriptional regulator, GntR family  35.87 
 
 
468 aa  160  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4275  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
480 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.310254  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2369  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.8 
 
 
505 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 
394 aa  156  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  37.1 
 
 
417 aa  156  8e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  28.67 
 
 
480 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  26.4 
 
 
480 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
480 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
480 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
480 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
480 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.7 
 
 
480 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.73 
 
 
483 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  28.47 
 
 
480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.45 
 
 
480 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  28.93 
 
 
480 aa  153  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.1 
 
 
517 aa  153  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 
480 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  33.54 
 
 
438 aa  152  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0695  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
508 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0519778  hitchhiker  0.00612564 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
481 aa  150  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06858  transcriptional regulator  30 
 
 
478 aa  149  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  31.73 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1870  GntR family transcriptional regulator  25.97 
 
 
476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1567  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  31.41 
 
 
498 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  30.89 
 
 
482 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 
395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  29.53 
 
 
480 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  32.32 
 
 
404 aa  146  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  32.62 
 
 
398 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  26.46 
 
 
480 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 
377 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
547 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  34.38 
 
 
396 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  34.38 
 
 
396 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3344  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.7 
 
 
482 aa  144  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  32.04 
 
 
436 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  32.94 
 
 
397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  26.57 
 
 
477 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 
393 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  32.51 
 
 
393 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  32.51 
 
 
393 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  32.51 
 
 
393 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  27.54 
 
 
485 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
478 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  28.15 
 
 
503 aa  140  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
340 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 
398 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  29.42 
 
 
477 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 
463 aa  139  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4374  putative transcriptional regulator, GntR family  29.18 
 
 
508 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
393 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2022  transcriptional regulator  31.78 
 
 
509 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190123  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  31.69 
 
 
398 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  31.58 
 
 
393 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1052  putative transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 
398 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
477 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>