More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1408 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1408  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 488 aa  956    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2248  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  54.3 
 
 		 486 aa  432  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000288373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5956  putative transcriptional regulator, GntR family  53.28 
 
 		 486 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.072408 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3184  regulatory protein GntR, HTH  51.72 
 
 		 485 aa  398  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3410  transcriptional regulator  50.43 
 
 		 485 aa  388  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.723571  decreased coverage  0.0095682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6790  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.29 
 
 		 487 aa  357  3.9999999999999996e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2093  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.62 
 
 		 503 aa  338  9.999999999999999e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.619312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3373  GntR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 478 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576212  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0748  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.9 
 
 		 493 aa  335  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2369  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.54 
 
 		 505 aa  329  8e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3924  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.71 
 
 		 468 aa  326  6e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2441  GntR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 449 aa  325  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1043  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.04 
 
 		 486 aa  323  5e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2700  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  43.72 
 
 		 475 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0691632 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4144  putative transcriptional regulator, GntR family  50.23 
 
 		 472 aa  319  7e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.805557 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1901  GntR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 478 aa  310  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1854  GntR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 478 aa  310  5e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3402  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.09 
 
 		 515 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000368024  hitchhiker  0.000012724 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1835  GntR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 478 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.422733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0620  GntR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 496 aa  305  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3344  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.81 
 
 		 482 aa  300  5e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0925  GntR family transcriptional regulator  40.92 
 
 		 485 aa  298  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4275  GntR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 480 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.310254  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2084  GntR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 504 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.87186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2586  putative transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 478 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0905182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4172  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  39.53 
 
 		 488 aa  241  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03897  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0615  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.07 
 
 		 491 aa  217  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1217  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.86 
 
 		 466 aa  214  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5610  putative transcriptional regulator, GntR family  37.47 
 
 		 468 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  30.88 
 
 		 498 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.1 
 
 		 517 aa  179  7e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  29.43 
 
 		 500 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6330  putative transcriptional regulator, GntR family  36.52 
 
 		 437 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00057428  hitchhiker  0.00168096 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  31.91 
 
 		 493 aa  169  9e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 477 aa  167  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 477 aa  167  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 477 aa  167  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 477 aa  167  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 477 aa  167  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.67 
 
 		 477 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  26.33 
 
 		 480 aa  166  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 483 aa  166  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  25.88 
 
 		 480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.44 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  28.3 
 
 		 477 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  26.15 
 
 		 480 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 480 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 481 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 480 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  27.85 
 
 		 480 aa  160  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 480 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 480 aa  160  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 480 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.65 
 
 		 477 aa  160  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.51 
 
 		 483 aa  160  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  27.29 
 
 		 480 aa  159  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.01 
 
 		 480 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 480 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.65 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  25.39 
 
 		 480 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.45 
 
 		 480 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 547 aa  156  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  26.91 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 477 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  29.65 
 
 		 484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  35.76 
 
 		 377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 471 aa  153  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.78 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 478 aa  151  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  26.52 
 
 		 477 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.06 
 
 		 471 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  28.22 
 
 		 478 aa  150  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  25.63 
 
 		 477 aa  150  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5787  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.86 
 
 		 483 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  34.56 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.01 
 
 		 490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6904  transcriptional regulator  30 
 
 		 483 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3572  transcriptional regulator  32.82 
 
 		 470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  36.28 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  34.56 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.82 
 
 		 470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  33.24 
 
 		 397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  27.44 
 
 		 474 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  26.5 
 
 		 473 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.36 
 
 		 483 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  26.25 
 
 		 477 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  30.7 
 
 		 463 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.36 
 
 		 483 aa  146  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  27.41 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  31.42 
 
 		 468 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1567  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 397 aa  146  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 477 aa  144  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 477 aa  144  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 520 aa  143  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0915  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 470 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>