More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6330 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6330  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 437 aa  837    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00057428  hitchhiker  0.00168096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2369  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.24 
 
 		 505 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2093  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.93 
 
 		 503 aa  218  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.619312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6790  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.23 
 
 		 487 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1408  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.64 
 
 		 488 aa  189  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3373  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 478 aa  187  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576212  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3184  regulatory protein GntR, HTH  37.31 
 
 		 485 aa  183  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2700  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  38.17 
 
 		 475 aa  182  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0691632 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0620  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 496 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0925  GntR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 485 aa  180  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3410  transcriptional regulator  37.76 
 
 		 485 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.723571  decreased coverage  0.0095682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1854  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1901  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2441  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 449 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1835  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 478 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.422733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3924  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.46 
 
 		 468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2248  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.5 
 
 		 486 aa  172  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000288373  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1043  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.97 
 
 		 486 aa  171  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0748  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.63 
 
 		 493 aa  169  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5956  putative transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 486 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.072408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3402  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.98 
 
 		 515 aa  160  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000368024  hitchhiker  0.000012724 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0615  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.49 
 
 		 491 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4275  GntR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 480 aa  155  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.310254  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4144  putative transcriptional regulator, GntR family  37 
 
 		 472 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.805557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2586  putative transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 478 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0905182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4172  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  35.38 
 
 		 488 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03897  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2084  GntR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 504 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.87186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3344  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.2 
 
 		 482 aa  142  9e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  36.62 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 377 aa  123  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 395 aa  120  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5610  putative transcriptional regulator, GntR family  33.75 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  31.21 
 
 		 498 aa  112  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  31.48 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1217  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.12 
 
 		 466 aa  107  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  27.25 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 480 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  28.86 
 
 		 437 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.33 
 
 		 483 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  29.64 
 
 		 484 aa  103  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 480 aa  103  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 480 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 480 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.33 
 
 		 480 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  27.33 
 
 		 480 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.33 
 
 		 480 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  27.03 
 
 		 480 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 477 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0253  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 483 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  29.57 
 
 		 611 aa  100  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 480 aa  100  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 478 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  26.09 
 
 		 446 aa  99.8  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  29.23 
 
 		 446 aa  99.8  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 481 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  30.15 
 
 		 554 aa  99.4  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  28.06 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  30.06 
 
 		 404 aa  99  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  24.58 
 
 		 477 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2671  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  28.92 
 
 		 493 aa  97.8  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 480 aa  97.8  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  28.96 
 
 		 436 aa  98.2  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  26.58 
 
 		 433 aa  98.2  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  24.64 
 
 		 461 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 399 aa  98.2  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 416 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  29.05 
 
 		 439 aa  97.4  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  28.66 
 
 		 398 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 441 aa  97.4  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 397 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 398 aa  96.7  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 383 aa  96.7  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  28.14 
 
 		 517 aa  96.7  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  28.66 
 
 		 398 aa  96.3  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  34.06 
 
 		 402 aa  96.3  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 395 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3585  putative transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 		 410 aa  96.3  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.06961  normal  0.158236 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0099  aminotransferase class I and II  21.91 
 
 		 442 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0095  GntR family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 442 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 477 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  24.07 
 
 		 480 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  26.57 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4380  GntR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 415 aa  95.5  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4267  putative transcriptional regulator, GntR family  32.6 
 
 		 454 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  26.7 
 
 		 441 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  25.15 
 
 		 485 aa  94.4  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2027  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 383 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  24.85 
 
 		 477 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3618  putative aminotransferase  32.04 
 
 		 388 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 399 aa  93.2  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5662  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 425 aa  93.2  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182521  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  24.38 
 
 		 503 aa  93.2  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  25.59 
 
 		 477 aa  93.2  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 477 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  25.59 
 
 		 477 aa  92.8  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 477 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>