More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3924 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3924  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 468 aa  884    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3373  GntR family transcriptional regulator  49.34 
 
 		 478 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576212  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2700  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  49.55 
 
 		 475 aa  362  6e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0691632 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1408  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.71 
 
 		 488 aa  332  7.000000000000001e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3184  regulatory protein GntR, HTH  46.67 
 
 		 485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6790  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.05 
 
 		 487 aa  323  5e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3410  transcriptional regulator  46.22 
 
 		 485 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.723571  decreased coverage  0.0095682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5956  putative transcriptional regulator, GntR family  44.99 
 
 		 486 aa  312  5.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.072408 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2248  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.78 
 
 		 486 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000288373  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2093  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.74 
 
 		 503 aa  300  4e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.619312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2369  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.93 
 
 		 505 aa  290  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3402  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.83 
 
 		 515 aa  290  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000368024  hitchhiker  0.000012724 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0925  GntR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 485 aa  287  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1854  GntR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 478 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1901  GntR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 478 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2441  GntR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 449 aa  278  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1835  GntR family transcriptional regulator  42.83 
 
 		 478 aa  277  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.422733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1043  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.54 
 
 		 486 aa  274  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4144  putative transcriptional regulator, GntR family  45.85 
 
 		 472 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.805557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2084  GntR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 504 aa  260  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.87186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0748  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.26 
 
 		 493 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4275  GntR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 480 aa  254  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.310254  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0620  GntR family transcriptional regulator  39.14 
 
 		 496 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0615  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.53 
 
 		 491 aa  230  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4172  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  38.97 
 
 		 488 aa  226  9e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03897  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3344  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.56 
 
 		 482 aa  203  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5610  putative transcriptional regulator, GntR family  36.06 
 
 		 468 aa  180  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2586  putative transcriptional regulator, GntR family  34.72 
 
 		 478 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0905182 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1217  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.33 
 
 		 466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6330  putative transcriptional regulator, GntR family  37.87 
 
 		 437 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00057428  hitchhiker  0.00168096 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  27.55 
 
 		 480 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  31.06 
 
 		 498 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.93 
 
 		 477 aa  160  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  26.9 
 
 		 480 aa  159  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.27 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.76 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 477 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 477 aa  156  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.67 
 
 		 477 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 477 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 480 aa  156  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  26.14 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.45 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  26.45 
 
 		 477 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 477 aa  153  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 481 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.44 
 
 		 490 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 498 aa  150  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  35.99 
 
 		 404 aa  150  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  31.26 
 
 		 493 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  25.77 
 
 		 480 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  36.94 
 
 		 377 aa  146  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6290  transcriptional regulator  33.56 
 
 		 467 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167913  normal  0.588848 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  27.08 
 
 		 480 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 520 aa  143  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 482 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 480 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 482 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.29 
 
 		 480 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 482 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 480 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 471 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  24.63 
 
 		 482 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 395 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 482 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.09 
 
 		 483 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 477 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  28 
 
 		 500 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  26.94 
 
 		 480 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  24.78 
 
 		 482 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 480 aa  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5401  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 470 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.02 
 
 		 480 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 480 aa  140  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4096  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 474 aa  140  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2063  transcriptional regulator  31.01 
 
 		 463 aa  140  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569208  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  32.47 
 
 		 416 aa  140  6e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  24.84 
 
 		 482 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 477 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 480 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 547 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  24.14 
 
 		 482 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4791  transcriptional regulator  30.63 
 
 		 464 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  24.7 
 
 		 503 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0253  GntR family transcriptional regulator  29.98 
 
 		 483 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  24.84 
 
 		 482 aa  137  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 438 aa  137  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3481  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 491 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.679234  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4265  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 485 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0310844 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4885  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 491 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 477 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48160  Aminotransferase protein  30.02 
 
 		 460 aa  136  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7210  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.99 
 
 		 478 aa  136  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  28.83 
 
 		 517 aa  136  9e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  36.17 
 
 		 400 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3084  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 460 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.189557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0828  GntR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  25.71 
 
 		 477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>